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Development of ANCsome contaning aASO-RNaseH conjugates

Research Project

Project/Area Number 21K05307
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 37030:Chemical biology-related
Research InstitutionKyoto Institute of Technology

Principal Investigator

KOBORI AKIO  京都工芸繊維大学, 分子化学系, 教授 (00397605)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywordsアンチセンス / 核酸医薬 / 光反応 / RNaseH / ジアジリン / 架橋性核酸 / エクソソーム
Outline of Research at the Start

本研究において我々は、新しい分子標的薬の母核として共有結合で架橋された核酸-RNA分解酵素複合体を提案する。また、核酸-RNA分解酵素複合体の細胞送達キャリアーとして、核酸-RNA分解酵素複合体を内包するエクソソーム(Antisense-Nuclease Capsulated Exosome : ANCsome)を新たに開発する。

Outline of Final Research Achievements

In this research period, we succeeded in developing two types of nucleic acid derivatives (1) and (2) that selectively form covalent bonds with target proteins that have the ability to bind to nucleic acids under light irradiation and in a molecularly crowded environment. Nucleic acid derivative (1) : By using oligonucleic acid derivatives with a diazirine moiety at the 5' end, RNaseH-ASO complexes were successfully constructed with high efficiency and sequence selectivity. Nucleic acid derivative (2) : we newly developed photoresponsive cross-linking nucleotides with a chloraldehyde derivative protected by a nitrobenzyl group at the 3' end. By using the oligonucleotides, the activity of telomerase, which is highly expressed in cancer cells and the highly important target protein for anticancer reagents, were selectively inhibited using light irradiation as a trigger under molecularly crowded environment.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究期間において我々は、光照射下かつ分子狭雑環境下において、標的タンパク質と選択的に共有結合を形成する2種類の核酸誘導体の開発に成功した。開発した2種類のオリゴ核酸は標的タンパクに結合している核酸を配列選択的に認識しながら、標的タンパク質表面のアミノ酸残基と光照射をトリガーとして化学結合を形成する性質を持つことから、タンパク質を標的とした核酸医薬として、これまでに報告されていない核酸医薬の新しいプラットフォームを提供する結果が得られたと考えている。今後は、得られた光架橋核酸-タンパク質共有結合体の解析を行うとともに、光架橋性核酸を利用したタンパク質活性阻害法の汎用性について検討する。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Wash-free FISH of bacterial ribosomal RNAs by benzo[a]pyrene-modified oligonucleotides.2024

    • Author(s)
      Y. Watari, K. Nakatani, K. Matsuo, T. Waku, A. Kobori
    • Journal Title

      Results in Chemistry

      Volume: 7 Pages: 101214-101214

    • DOI

      10.1016/j.rechem.2023.101214

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 多環芳香族アジド誘導体を有する新規光架橋性核酸の開発2023

    • Author(s)
      北村 真知子
    • Organizer
      第13回4大学連携フォーラム
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 光架橋性核酸を用いたDNA-RNase H複合体の構築2023

    • Author(s)
      小畑 健太郎
    • Organizer
      第13回4大学連携フォーラム
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 点変異を標的としたジアジリン修飾光架橋性核酸の開発2023

    • Author(s)
      宇仁田 大樹
    • Organizer
      第13回4大学連携フォーラム
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Construction of DNA-RNase H conjugates using photo-cross-linking ODNs2023

    • Author(s)
      Kentaro Kobata, Kazuya Matsuo, Tomonori Waku, Akio Kobori
    • Organizer
      ISNAC2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 点変異を標的としたジアジリン修飾光架橋性核酸の開発2023

    • Author(s)
      宇仁田 大樹、小畑健太郎、松原一稀、松尾和哉、和久友則、小堀哲生
    • Organizer
      日本化学会第103回春季年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] ジアジリン残基を導入した光架橋性拡散によるテロメラーゼ活性阻害2022

    • Author(s)
      松原一稀、辰巳颯一、松尾和哉、和久友則、小堀哲生
    • Organizer
      日本核酸医薬学会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 細胞抽出液中における光架橋性核酸の反応性2022

    • Author(s)
      松原一稀、松尾和哉、和久友則、小堀哲生
    • Organizer
      第12回4大学連携研究フォーラム
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Reactivity of photo-cross-linking ODNs in cellular extracts2022

    • Author(s)
      小畑健太郎、松原一稀、松尾和哉、和久友則、小堀哲生
    • Organizer
      ISNAC2022
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 点変異mRNA選択的な遺伝子発現抑制を志向した光応答性α-ブロモアルデヒド修飾核酸の開発2021

    • Author(s)
      小畑健太郎、Ivana dvorakova、太田良、辰巳颯一、和久友則、小堀哲生
    • Organizer
      第15回バイオ関連化学シンポジウム
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 光応答性α-ハロアルデヒドを鎖中に導入したアンチセンス核酸の開発と架橋特性評価2021

    • Author(s)
      小畑健太郎、Ivana dvorakova、太田良、辰巳颯一、和久友則、小堀哲生
    • Organizer
      日本核酸医薬学会第6回年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

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Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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