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An attempt to isolate potential biotin excretion mutants in Corynebacterium glutamicum

Research Project

Project/Area Number 21K05337
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 38020:Applied microbiology-related
Research InstitutionShinshu University

Principal Investigator

Ikeda Masato  信州大学, 学術研究院農学系, 教授 (00377649)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 竹野 誠記  信州大学, 学術研究院農学系, 准教授 (30422702)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywordsコリネバクテリウム グルタミカム / ビオチン排出輸送体 / ビオチン取り込み輸送体 / アコニターゼ / 応用微生物 / ビオチン / 排出輸送体 / 発酵
Outline of Research at the Start

細菌がビオチンを分泌する現象には、ビオチンの特異的排出輸送系が関わっていると推察されるが、ビオチンの排出輸送系はいかなる生物でも報告がなく、実体は不明である。申請者は、ビオチンをデノボ合成できるように育種したコリネ菌に、一つの不可解な現象を見出した。その現象に基づき、独自の仮説を導いて、想定される未同定のビオチン排出輸送体(BioEと命名)を欠損した変異株のポジティブ選択法を考案した。この方法でBioE欠損株の誘導を試みる。目的株が得られたら、原因変異を特定し、ビオチン排出輸送体という生物界で未だ報告のない新機能を明らかにする。

Outline of Final Research Achievements

We metabolically engineered naturally biotin-auxotrophic Corynebacterium glutamicum into a biotin prototroph. Interestingly, the strain exhibited a biotin-hyperauxotrophic phenotype when the biotin-uptake gene bioY and the phosphoenolpyruvate carboxylase gene ppc were disrupted. We spontaneously isolated biotin-prototrophic suppressor mutants from the bioY and ppc double disruptant. Genomic analysis of the two independently isolated mutants identified different missense mutations in the same aconitase gene. The acn mutations are considered to be novel useful mutations that allow central metabolism to be biotin-independent because both mutants exhibit the biotin-prototrophic phenotype although their intracellular biotin concentrations remain low.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では、当初期待した未同定のビオチン排出輸送体“BioE”の欠損変異株を得ることはできなかったが、代わりに新規な糖代謝系変異株を見出した。同株の持つacn変異は中央代謝をビオチン非依存にすると考えられる点で学術的意義を有するだけでなく、広く発酵生産への応用性を秘めている。例えば、リジン発酵など、コリネ菌を用いたアミノ酸生産の工業プロセスでは、その多くが高価なビオチンを多量に要している。これはビオチン酵素であるPYCを活性化するためであるが、コストアップ要因となっている。今回見出したacn変異はその解決を図る代替策として有用技術になる可能性がある。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2023 2022

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Metabolic engineering to produce palmitic acid or palmitoleic acid in an oleic acid-producing Corynebacterium glutamicum strain2023

    • Author(s)
      Seiki Takeno, Yosuke Hirata, Kako Kitamura, Tatsunori Ohtake, Kuniyoshi Aoki, Noriko Murata, Mikiro Hayashi, Masato Ikeda
    • Journal Title

      Metab Eng

      Volume: 78 Pages: 148-158

    • DOI

      10.1016/j.ymben.2023.06.002

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] コリネ型細菌によるパルミトレイン酸の生産(第四報)2023

    • Author(s)
      平田陽祐、竹野誠記、池田正人
    • Organizer
      日本農芸化学会2023年度大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] コリネ型細菌のBirAが単機能型とする定説の再検証(第一報)2023

    • Author(s)
      水野聖夜、西原一毅、津久井裕太、原志門、竹野誠記、池田正人
    • Organizer
      日本農芸化学会2023年度大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] コリネ型細菌における長鎖脂肪酸排出輸送体の探索2022

    • Author(s)
      佐藤美奈子,村田紀子,村松哲広,竹野誠記,池田正人
    • Organizer
      日本農芸化学会2022年度大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] コリネ型細菌による中鎖脂肪酸生産への代謝工学2022

    • Author(s)
      村田春樺,内藏 萌,竹野誠記,池田正人
    • Organizer
      日本農芸化学会2022年度大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] コリネ型細菌におけるリポ酸の炭素骨格C8供給経路の解明2022

    • Author(s)
      津久井裕太,竹野誠記,池田正人
    • Organizer
      日本農芸化学会2022年度大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] コリネ型細菌における“ビオチン再回収説”とその検証2022

    • Author(s)
      宮澤 萌,小林央恒,横山夏音,岡本理瑚,竹野誠記,池田正人
    • Organizer
      日本農芸化学会2022年度大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

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Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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