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Identification of D-amino acid metabolic pathways in hyperthermophile

Research Project

Project/Area Number 21K05348
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 38020:Applied microbiology-related
Research InstitutionKitasato University

Principal Investigator

Miyamoto Tetsuya  北里大学, 薬学部, 講師 (10739238)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
KeywordsD-アミノ酸 / アミノ酸ラセマーゼ / D-アミノ酸アミノトランスフェラーゼ / 多機能型酵素 / ペプチドグリカン / 超好熱菌 / アミノ酸アミノトランスフェラーゼ / スレオニンアルドラーゼ / O-アセチルホモセリンスルフヒドラーゼ / アセチルオルニチンアミノトランスフェラーゼ
Outline of Research at the Start

細菌においてD-アミノ酸は、細菌の環境適応において重要な生理的機能分子である。超好熱菌 Thermotoga maritima のペプチドグリカンは、3種類のD-アミノ酸を含み、ユニークな構造を有している。しかし、これらD-アミノ酸の代謝経路は明確になっていないため、その全容の解明を目指している。その過程で、2つの異なるD-アミノ酸代謝活性を有する新規の多機能型酵素を発見した。本研究では、この酵素を中心として、D-アミノ酸代謝に関連する酵素を同定し、その機能及び生理的役割を明らかにする。本研究は、各種生物におけるD-アミノ酸バイオシステムの理解にも繋がる重要な基盤研究である。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we aimed to identify novel D-amino acid metabolic pathways in hyperthermophile Thermotoga maritima. We identified several enzymes that have D-amino acid-metabolizing activity through functional analysis of various enzymes. These enzymes displayed several different activities associated with amino acid metabolism. These studies also revealed that D-glutamate, which is an important component in bacterial peptidoglycan, is produced by novel D-amino acid aminotransferase in T. maritima.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

細菌においてD-アミノ酸は、細菌の環境適応に関わる重要な生理的機能分子である。超好熱菌 Thermotoga maritima のペプチドグリカンは、3種類のD-アミノ酸を含み、ユニークな構造を有している。本研究においては、このうちD-グルタミン酸の合成経路を明らかとしており、これは細菌の環境適応機構を理解する上で非常に重要である。また、D-アミノ酸が多機能型代謝酵素を介して代謝されるという新規のD-アミノ酸代謝経路を見出したことは、各種生物におけるD-アミノ酸バイオシステムの理解にも繋がる重要な発見である。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (27 results)

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 1 results) Presentation (19 results) (of which Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Multifunctional enzymes related to amino acid metabolism in bacteria2024

    • Author(s)
      Miyamoto Tetsuya
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: - Issue: 6 Pages: 585-593

    • DOI

      10.1093/bbb/zbae027

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      Miyamoto Tetsuya、Fushinobu Shinya、Saitoh Yasuaki、Sekine Masae、Katane Masumi、Sakai‐Kato Kumiko、Homma Hiroshi
    • Journal Title

      The FEBS Journal

      Volume: 291 Issue: 2 Pages: 308-322

    • DOI

      10.1111/febs.16953

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      Miyamoto Tetsuya、Saitoh Yasuaki、Katane Masumi、Sekine Masae、Homma Hiroshi
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      FEMS Microbiology Letters

      Volume: 369 Issue: 1 Pages: 1-7

    • DOI

      10.1093/femsle/fnac096

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      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: 86 Issue: 11 Pages: 1536-1542

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      The FEBS Journal

      Volume: 289 Issue: 19 Pages: 5933-5946

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      Miyamoto Tetsuya、Saitoh Yasuaki、Katane Masumi、Sekine Masae、Sakai‐Kato Kumiko、Homma Hiroshi
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      FEBS Letters

      Volume: 595 Issue: 23 Pages: 2931-2941

    • DOI

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      Journal of Cellular Biochemistry

      Volume: 122 Issue: 11 Pages: 1639-1652

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      Miyamoto Tetsuya、Katane Masumi、Saitoh Yasuaki、Sekine Masae、Sakai-Kato Kumiko、Homma Hiroshi
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      Amino Acids

      Volume: 53 Issue: 6 Pages: 903-915

    • DOI

      10.1007/s00726-021-02993-x

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Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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