• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Structural and functional analysis of a peptide ABC transporter for paraben

Research Project

Project/Area Number 21K05351
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 38020:Applied microbiology-related
Research InstitutionTokyo University of Agriculture

Principal Investigator

Yajima Shunsuke  東京農業大学, 生命科学部, 教授 (90301548)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Keywords基質認識 / X線結晶構造解析 / 基質特異性 / 放線菌 / X線結晶構造解析 / 基質 / ABCトランスポーター / ヒドラジド / Actinobacteria門
Outline of Research at the Start

非天然化合物であるhydrazide化合物を唯一の炭素源として資化できるMicrobacterium hydrocarbonoxydansから、その代謝を制御するオペロンを見出した。その特徴は、amidase superfamilyに属するhydrazidaseと、既知および新規構造の可能性をもつ2種のABCトランスポーターである。このオペロンは本菌のみならずActinobacteria門に見られること、細菌の生理機能に重要な役割を担っていると考えられる。そこで本申請では、2種のトランスポーターの立体構造、機能解析を中心に、このオペロン構造の生理機能上の重要性解明を目指す。

Outline of Final Research Achievements

It was revealed that parabens are natural substrates for hydrazidase, which is isolated from Microbacterium hydrocarbonoxydans grown with hydrazide compounds as sole carbon source. Growth experiments and gene expression analysis of the bacteria also indicated that parabens are catabolized by the bacteria. Furthermore, a homologue of the enzyme was isolated from another actinomycete, and its function and structure were analyzed. Although the homologue also catalyzed parabens as substrates, differences were observed in the activity of the two enzymes, which was attributed to structural differences in the entrance region of the active sites. On the other hand, the analysis of the transporter that takes up parabens requires further investigation to obtain the recombinant protein.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

化合物を資化する仕組みにおいてトランスポーターと分解酵素の役割は重要であるが、データベースの情報のみでは、本来の基質を正確に予測することは容易ではない。今回、立体構造解析等をもとにパラベンを代謝する最初の段階の仕組みを明らかにした。パラベンは化粧品や食品の保存料として使われている一方、内分泌系への懸念もいわれる。またパラベンが植物体の構成成分として存在するという報告もある。パラベンを触媒する蛋白質、また資化する菌は本研究が初めての報告であり、分子レベルでは蛋白質機能解析に新たな知見を加えた点、微生物としてはバイオレメディエーションへの応用などが考えられる研究成果である。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (2 results)

All 2024 2023

All Presentation (2 results)

  • [Presentation] 放線菌由来hydrazidaseのパラベン分解活性に関する解析2024

    • Author(s)
      竹野谷美穂子、伊藤晋作、佐々木康幸、矢嶋俊介
    • Organizer
      日本農芸化学会2024年度大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 人工ヒドラジド分解活性をもつPseudonocardia acaciae由来Amidaseの天然基質の探索2023

    • Author(s)
      竹野谷 美穂子、平塚 孔章、伊藤 晋作、佐々木 康幸、矢嶋 俊介
    • Organizer
      日本農芸化学会2023年度大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi