| Project/Area Number |
21K05570
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 39030:Horticultural science-related
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| Research Institution | National Agriculture and Food Research Organization |
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Principal Investigator |
後藤 新悟 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 果樹茶業研究部門, 上級研究員 (60433215)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2025-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2022: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
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| Keywords | 細胞質雄性不稔 / ファインマッピング / 稔性回復遺伝子 / 細胞質雄性不稔性 / PPR / カンキツ / CMS / Rf / ミトコンドリア / DNAマーカー選抜 / 雄性不稔性 / ゲノム |
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| Outline of Research at the Start |
カンキツにおいて種なし性は食べやすさを決める重要な形質であり、その主な要因のひとつが雄性不稔性（花粉を作れなくなる性質）である。本研究課題代表者は、カンキツにおいては、ミトコンドリアに雄性不稔性の原因となる遺伝子が存在し、核側に存在している稔性回復遺伝子を持つか、持たないかによって雄性不稔性が決まることを明らかにしてきた。さらに、稔性回復遺伝子が存在している大まかな場所を見つけ、有力な候補遺伝子を見つけることができた。そこで、本研究課題ではこの有力候補遺伝子が本当に稔性回復遺伝子かどうかを検証していく。また、ミトコンドリアに存在している雄性不稔性原因遺伝子についても探索をおこなう。
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| Outline of Annual Research Achievements |
「ファインマッピングによる稔性回復遺伝子の同定」について、最終的に19の交配集団からなる983実生のジェノタイピングを終了し、MS-P1領域を挟むSSR00220-4とSSR00432-1間で組換えを起こしていた実生を17系統選抜することができた。また、これら系統すべての葯のサンプリングを完了させており、順次、雄性不稔性の評価を進めている。
前年度までに、HT1ハプロタイプ（non-functional restorerof-fertility）ホモに持つKO14とHT6ハプロタイプ（functional restorerof-fertility）ホモに持つ口之津51号とのロングシークエンシングデータの比較解析において、2つの候補遺伝子周辺に欠損が確認されていた。さらに、データ解析を進めたところ、2つの候補遺伝子のORFにおいても欠損が確認された。これら候補遺伝子がどちらか片方、もしくは両方が稔性回復遺伝子であることが示唆された。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
MS-P1領域を挟む2つのマーカー間で組換えを起こしていた実生を17系統選抜することができ、これらの雄性不稔性評価も進んでいる。また、HT1ハプロタイプにおいて2つの候補遺伝子のORFに欠損が生じていることも明らかになっていることから、稔性回復遺伝子の同定に向けて確実に進展している。
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| Strategy for Future Research Activity |
MS-P1領域内にマーカーをデザインし、選抜された17系統のジェノタイピングを進める。また、それらの雄性不稔性評価も合わせて行い、ファインマッピングを進めていく。
ロングリードシークエンスデータを用いて2つの候補遺伝子のORFに欠損があることが示唆されたが、この欠損はPCRとシークエンスを用いて、確認していく。
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