ウイルス進化推進力分析から未来進化予測の基盤を構築する
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21K05601
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 39040:Plant protection science-related
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| Research Institution | Saga University |
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Principal Investigator |
大島 一里 佐賀大学, 農学部, 教授 (00176869)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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| Keywords | ウイルス進化推進力 / 新興病原ウイルス / 植物ウイルス / 拡散年代 / 世界地図 / 日本地図 / ポティウイルス / 侵入年代 / 未来進化予測 / ウイルス / 分子進化 / 推進力 / ゲノム進化 |
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| Outline of Research at the Start |
農作物に甚大な被害を与える代表的な病原ウイルスとしてRNAゲノムを持つポティウイルスがあり，応募者はこれまでゲノム分析し，ウイルス進化の三大推進力である突然変異，組換えそして再集合について世界に先駆けて明らかにしてきた。
スーパーコンピューターを用いた分析系が確立できたことにより，より大量のウイルスゲノムを一度に様々な角度から複数回分析できるようになった。
そこで本応募では，過去の進化を検証しつつ，幾つかのウイルス拡散の地球地図を世界に先駆けて完成させるだけでなく，課題として残されていた病原性進化に関わった推進力の爆発年代をウイルス種としてだけでなく属レベルとしてまで明らかにする。
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| Outline of Annual Research Achievements |
昨年度と同様に，これまで応募者が独自に蓄積してきた情報に加えて，農作物や人の移動経路を考慮しながら，ウイルス病原体が起源地から世界中に拡がるハブ地となる発生中心にどのように移動し，その後世界各地域にどのように拡散したのか，また我が国にどのような経路で侵入したのか，我が国内でどのように循環しているのかなど，最終的には地球規模や全国規模での視点から明らかにすると共に，これまで課題として残されてたウイルス病原性進化に関わった推進力の爆発年代をウイルス種並びに属レベルまで明らかにして，次のステップとなる病原体の未来進化予測の基盤を構築することを目的とした。
ポティウイルスのウイルス種の代表的な種としてジャガイモYウイルスやカブモザイクウイルス（TuMV）の大量のゲノム情報を用い， TuMV の分子系統グループ，そしてポティウイルス属全体に焦点を当て，突然変異，組換え，再集合の進化推進力そして宿主適応などの分子進化について進化速度から爆発年代進化や拡散を地球規模で分析した。今年度は特にカブモザイク分子系統グループのTuMVの我が国の集団に焦点を当て補足しなければならないウイルスゲノムの塩基配列の決定を行った後，分子疫学的・進化的な新知見をもとに爆発年代を伴う病原性進化を分析評価し，我が国の集団について地球規模での農作物の伝播，人の移動及び農業の発達に関わる総合的な考察を行い，応募者が独自にこれまで積み上げてきたゲノム情報を合わせて未来の病原体の未来進化予測の基盤構築のアプローチを行った。具体的にはポティウイルスのカブモザイクウイルスについて我が国内での拡散や侵入年代の推定を行い，植物ウイルスとしてこれまでにない膨大な集団を用いて解析し，投稿論文として公表した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
予定していた投稿論文が，受理された。
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| Strategy for Future Research Activity |
投稿予定の論文の進化学的な解析をさらに推進し，目的としているウイルス進化推進力分析から未来進化予測の基盤を構築するためのアプローチを行う。
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Report
(2 results)
Research Products
(4 results)
