Project/Area Number |
21K05861
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 41040:Agricultural environmental engineering and agricultural information engineering-related
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Research Institution | National Agriculture and Food Research Organization |
Principal Investigator |
望月 遼太 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 九州沖縄農業研究センター, 研究員 (90846065)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
鈴木 達郎 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 九州沖縄農業研究センター, グループ長補佐 (00469842)
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Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Fiscal Year 2023: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
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Keywords | 温度応答 / 微気象 / RNA-seq / 遺伝子発現 |
Outline of Research at the Start |
気候変動下における安定的な作物生産実現のためにも作物の生育予測モデルの精度向上は喫緊の課題である。精度向上に向けた課題の一つに生殖成長期の生育予測がある。花芽などの生殖器官は環境要因、特に温度に対する感受性が高い。そこで申請者らは生育予測の精度向上を目指し、温度応答遺伝子の発現量を予測するモデルの構築を試みる。栽培温度、部位別に温度応答遺伝子の発現量を定量し、作物の温度応答を可視化する。この結果と高度別群落内微気象により作物の温度応答モデルを構築する。本研究は農業環境分野と遺伝学分野の融合的取り組みであり、本試験によって得られた遺伝子情報は遺伝学分野においても新たな知見として活用できる。
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Outline of Annual Research Achievements |
寒冷地での栽培が主流な普通ソバを用いて、作物体の温度応答を調査した。初年度に作出した自殖性の高温耐性系統と感受性系統それぞれの生育調査および各器官(葉・花・蕾)別のサンプリングを実施した。RNA-seqにより、温度応答に関連する複数の遺伝子候補が見つかってきた。現在は、遺伝子候補群のプライマーを作成し、リアルタイムPCRにより温度応答遺伝子を同定していく予定である。 ソバ栽培における花芽器官と標準高度間での気温差異を観測した。水稲と比較してソバ群落内の気温は標準高度から大きな差はつかず、日中1度程度の差が生じる程度であった。このことからもソバの花芽器官は高温条件にさらされやすいことが明らかとなった。6月-8月の高温条件下での栽培試験の結果、高温耐性系統において次世代の発芽率が大幅に低下する傾向が見られた。本年度は圃場での栽培試験についても生育調査を細かく実施していく。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
昨年、実施できていなかった葉のサンプルからRNAを取得し、RNA-seqによる解析を実施中である。電気代高騰のあおりを受け、人工気象器を用いた栽培試験が一時的に中断していた。その影響もあり、昨年度はRNA-seqおよびリアルタイムPCR用のサンプルを十分に確保することが出来なかった。圃場試験でのサンプリング調査を前倒しで実施しているものの全体としては、遅延している。
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Strategy for Future Research Activity |
RNA-seqサンプルの解析手法等の環境は、先行して実施していたサンプルを用いて構築済みであるので、結果を受領次第、リアルタイムPCRを用いた解析を進めていく予定である。当初計画に、組み込んでいた圃場試験を用いた遺伝子応答の追跡試験については次年度以降の検証・報告内容として実施する可能性も視野に作業を実施していく。
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