Comprehensive genetic analysis-based liquid biopsy for establishment of the novel tumor biomarker in dog
| Project/Area Number |
21K05952
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 42020:Veterinary medical science-related
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| Research Institution | Okayama University of Science (2022)
Obihiro University of Agriculture and Veterinary Medicine (2021) |
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Principal Investigator |
田川 道人 岡山理科大学, 獣医学部, 准教授 (00749468)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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| Keywords | 悪性黒色腫 / メラノーマ / cell free DNA / 全エクソン解析 / バイオインフォマティクス / リキッドバイオプシー / リアルタイムPCR / 全ゲノム解析 / 腫瘍マーカー / 遺伝子解析 |
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| Outline of Research at the Start |
医学では血液検査により腫瘍の状態を把握できる様々な腫瘍マーカーが利用されているが、獣医療においては実用可能な腫瘍マーカーは存在しない。そこで循環腫瘍遺伝子と呼ばれる、腫瘍由来の遺伝子を血液から検出するリキッドバイオプシーに着目し、犬の腫瘍にみられる遺伝子変異を包括的に解析することで血中に放出される腫瘍由来の遺伝子変異を特定し、血液検査だけで実施可能な新規腫瘍マーカーの確立を目的とした。
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| Outline of Annual Research Achievements |
犬悪性黒色腫４症例より得た腫瘍組織と、同一症例の末梢血液より得たPBMCよりDNAを抽出し、両者をKOTAI社に送付し全エクソン解析を行った。得られた遺伝子配列は
犬の全ゲノム（CanFam 3.1 genome (GCF_000002285.3_CanFam3.1) ）に対してアノテーションを行い個体特有の遺伝子変異を決定した。その結果、各症例とも複数の遺伝子変異が観察され、人の悪性黒色腫に関連した変異、その他の腫瘍に関連した変異などが認められた。一方、複数の症例で同一の変異は観察されず、腫瘍マーカーとして利用可能な変異の同定には至らなかった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
当方の異動と一時的な休職期間により十分な研究が行えなかった。
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| Strategy for Future Research Activity |
現在は得られた変異情報をもとにマーカー候補の探索を行っている。候補決定後はデジタルPCRなどでの検出系の確立を目指す。
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Report
(2 results)
Research Products
(1 results)
