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Elucidation of protein molecular basis in the information transmission mechanism of magnetoreception

Research Project

Project/Area Number 21K06093
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 43030:Functional biochemistry-related
Research InstitutionNational Institutes for Quantum Science and Technology

Principal Investigator

Arai Shigeki  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 量子生命科学研究所, 上席研究員 (00391269)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywords磁覚 / X線小角散乱 / タンパク質 / 相互作用 / X線小角散乱 / 熱安定性 / リアルタイムPCR / 立体構造 / 蛋白質
Outline of Research at the Start

多くの生物は磁気を認識する感覚(磁覚)を有する。網膜細胞に存在する蛋白質クリプトクロム(CRY)が磁気を検出しうることが知られるが、磁気情報をCRYから神経系に伝達する物質(CRY-R)は同定されておらず、磁気情報を知覚化する機構は解明されていない。本研究では分光学的・熱力学的手法等を駆使してCRY-Rを同定し、その構造・物性・CRYとの相互作用様式などを明らかにし、磁気情報伝達機構の解明に挑む。得られる知見は、磁場による生物影響の量子論~分子論的解明や、磁場を介して細胞内外での分子挙動・機能を制御できるCRY/CRY-R融合蛋白質開発など、量子生命科学分野の開拓や新奇的技術開発などに資する。

Outline of Final Research Achievements

CRY4 is one of the photoreceptor proteins thought to be involved in the mechanism by which birds recognize the inclination angle of geomagnetic field. By using the small-angle X-ray scattering method, which can provide structural information on a wide range of spatial resolution scales, we revealed that the tertiary structure and oligomeric state of erCRY4 from European robin, a representative magnetoreceptor species, change in response to light. We also confirmed that a part of the intracellular domain of the voltage-gated potassium channel subfamily V (erKCNV2-2) interacts with erCRY4. Moreover, we found that the interaction between erKCNV2-2 and erCRY4 could induce the spatially ordered oligomerization of erCRY4. These findings contribute to the elucidation of the mechanism of magnetic field information perception originating from bird’s CRY4.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本成果は、CRY仮説の大きな問題点の一つである量子論的現象と分子論的機構の接点の解明に資するものであり、磁気感覚の蛋白質分子基盤の解明に大きく貢献する。また、本成果は、磁場情報と感覚モダリティとの関係性を調べる際の重要な基礎的知見の一つとなる。将来的には、erCRY4やerKCNV2と構造的に相同なCRYやCRY-R候補分子を保有する生物種をゲノム情報等から網羅的に調べることで、磁場影響を受けやすい生物種を分子論的に推定することが可能になると期待できる。このようなアプローチは、人工磁場等の生物影響を体系的に研究するための新たな手段となり得る。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (20 results)

All 2024 2023 2022 2021 Other

All Journal Article (5 results) (of which Open Access: 3 results,  Peer Reviewed: 1 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results) Book (3 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] Self-Oligomerization of Pigeon Iron-Sulfur Protein Induced by Magnetic Field2023

    • Author(s)
      Shigeki Arai, Rumi Shimizu, Motoyasu Adachi, Hirai Mitsuhiro
    • Journal Title

      Photon Factory Highlight 2022

      Volume: 1 Pages: 22-23

    • Related Report
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    • Open Access
  • [Journal Article] Novel Function of Pigeon Iron-Sulfur Protein for the Magnetoreception Predicted by SAXS Analysis with a Permanent Magnetic Device2023

    • Author(s)
      Shigeki ARAI, Rumi SHIMIZU, Motoyasu ADACHI, Mitsuhiro HIRAI
    • Journal Title

      Photon Factory Activity Report

      Volume: 40 Pages: 23-23

    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Journal Article] Magnetic field effects on the structure and molecular behavior of pigeon iron?sulfur protein2022

    • Author(s)
      Arai Shigeki、Shimizu Rumi、Adachi Motoyasu、Hirai Mitsuhiro
    • Journal Title

      Protein Science

      Volume: 31 Issue: 6 Pages: 1-13

    • DOI

      10.1002/pro.4313

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ISCA1蛋白質の分子挙動への磁場印加効果2022

    • Author(s)
      新井栄揮, 清水瑠美, 安達基泰, 平井光博
    • Journal Title

      Photon Factory Activity Report

      Volume: 39 Pages: 29-29

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    • Open Access
  • [Journal Article] Fe-S cluster binding mechanism of pigeon's ISCA1 clarified by SEC-SAXS2021

    • Author(s)
      Arai Shigeki, Shimizu Rumi, Adachi Motoyasu, Hirai Mitsuhiro
    • Journal Title

      Photon Factory Activity Report

      Volume: 38 Pages: 60-60

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    • Open Access
  • [Presentation] 小角散乱法による蛋白質の磁場応答性と磁覚の研究展開2024

    • Author(s)
      新井栄揮
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      PF研究会「物質・生命研究における小角散乱法の展開:現状と展望のための討論会」
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    • Invited
  • [Presentation] Structural studies of magnetic field-responsive proteins by small-angle X-ray scattering analysis2023

    • Author(s)
      Arai Shigeki, Shimizu Rumi, Adachi Motoyasu, Mitsuhiro Hirai
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      第61回日本生物物理学会年会
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  • [Presentation] 鳥類の磁覚の機構における蛋白質基盤の構造学的洞察2023

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      新井栄揮, 清水瑠美, 安達基泰
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      第23回日本蛋白質科学会年会
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  • [Presentation] Magnetic field response of cryptochrome partner candidate protein2023

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      Shigeki Arai, Rumi Shimizu, Motoyasu Adachi, Mitsuhiro Hirai
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      Gordon Research conference, Quantum Biology
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 「磁覚」 ~動物が磁場を感知する謎の能力~2023

    • Author(s)
      新井栄揮
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      千葉市科学館・大人が楽しむ科学教室
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  • [Presentation] Structural change of cryptochrome 4 of European robin by blue light absorption2022

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      新井栄揮、清水瑠美、安達基泰
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      量子生命科学会第4回大会
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  • [Presentation] 鳥たちの磁覚 ~磁場を感じる不思議な感覚の科学~2022

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      新井栄揮
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      量子科学技術研究開発機構 量子生命・医学部門一般公開
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  • [Presentation] 青色光照射によって誘導されるクリプトクロム4の構造変化と自己会合2022

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      新井栄揮, 清水瑠美, 安達基泰
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      2021年度量子ビームサイエンスフェスタ
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  • [Presentation] Structural changeability and oligomerization of the magnetoreceptor candidate ISCA12021

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      新井栄揮, 清水瑠美, 安達基泰, 平井光博
    • Organizer
      第21回日本蛋白質科学会年会
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  • [Book] 量子生命科学ハンドブック2023

    • Author(s)
      新井栄揮、他
    • Total Pages
      10
    • Publisher
      エヌ・ティー・エス
    • ISBN
      9784860438821
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  • [Book] 日経サイエンス「動物たちの磁気感覚」2022

    • Author(s)
      日経サイエンス副編集長・出村政彬 52巻8号55~57ページ
    • Total Pages
      3
    • Publisher
      株式会社 日経サイエンス
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  • [Book] 日刊工業新聞「鳥の帰巣本能 タンパク質磁場情報変換」2022

    • Author(s)
      令和4年5月11日21面
    • Total Pages
      1
    • Publisher
      日刊工業新聞社
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  • [Remarks] PHOTON FACTORY HIGHLIGHTS 2022

    • URL

      https://www2.kek.jp/imss/pf/science/publ/pfhl/2022/pfhl_all_2022.pdf

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  • [Remarks] 鳥の“帰巣本能”を解明する新たな手掛かりを発見

    • URL

      https://www.qst.go.jp/site/press/20220511.html

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  • [Remarks] 動物たちの磁気感覚

    • URL

      https://www.nikkei-science.com/202208_055.html

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Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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