| Project/Area Number |
21K06122
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 43050:Genome biology-related
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| Research Institution | Okayama University |
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Principal Investigator |
宮地 まり 岡山大学, 医歯薬学域, 助教 (50349255)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2025-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
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| Keywords | ニューロエピジェネティクス / ゲノム構造 / 終末分化 / 神経細 / 核内構造 / 神経細胞 / 神経特異的遺伝子 / ニューロン / 核構造 / 遺伝子発現制御 |
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| Outline of Research at the Start |
ラット初代培養神経細胞を用いて，CTCFとSP120のChIP-seqおよびSP120のCLIP-seqを行うことによりトポIIβ，SP120, CTCFによって制御される核内構造よって神経特異的遺伝子の発現が共制御される分子機構を明らかにする．ゲノムワイド解析から共制御のモデル立て，モデル領域の遺伝子発現に関与するSP120結合RNAをノックダウンすることにより共制御が喪失するかを確認することでモデルを検証する．
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| Outline of Annual Research Achievements |
DNAトポイソメラーセ (トポ) IIβはDNAの高次構造を変換する酵素で，私たちはトポIIβが一群の神経特異的遺伝子の発現を誘導，または抑制することを明らかにしてきた．本研究では，ラット初代培養神経細胞を用いて，試験管内で分化を誘導，この過程でトポIIβが制御する遺伝子群をRNA-seq法により，トポIIβが正または，負に制御する一群の神経特異的遺伝子を同定した．Gene Ontology解析から，トポIIβが正に制御する遺伝子群は，終末分化した神経細胞で機能する遺伝子が有意に多く，一方，負に制御される遺伝子群には，神経前駆細胞で機能する遺伝子が有意に多かった．ゲノム上の配置を解析し，これらの遺伝子群がゲノム上で固まって存在していることを示した．以上の結果は，トポIIβが個々の遺伝子をローカルに発現制御するだけでなく，ゲノム構造変換を介してグローバルに制御することにより，神経前駆細胞から神経細胞へ終末分化のスイッチ機能を有することを支持する結果である．
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
投稿論文の リバイス対応に時間を割かれたため，研究の進行は遅れているが，着実に進めている．
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| Strategy for Future Research Activity |
結果をまとめ，投稿準備中である．2024年度中に投稿予定である．
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