深海底に沈む木材をニッチとした深海生菌類：その多様性と未知有用機能
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21K06328
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 45030:Biodiversity and systematics-related
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| Research Institution | Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology |
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Principal Investigator |
長野 由梨子 国立研究開発法人海洋研究開発機構, 地球環境部門(海洋生物環境影響研究センター), 研究員 (30512917)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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| Keywords | 深海 / 真菌類 / 沈木 / Oceanitis / Ceriosporopsis / 海生菌類 / アンプリコン解析 / 海洋プラスチックゴミ / 相模湾 / 菌類 / 海生菌 / 木材分解 |
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| Outline of Research at the Start |
深海環境に特殊に適応進化したと考えられている偏性深海生菌類は、世界でも6種が知られているのみで、全く研究が進んでいない。そこで、本研究ではどのような環境(海域、深度、 基質、樹種など)にどのような深海生菌類が生息しているのか、どのように深海環境に適応していったのか、点在する沈木から沈木へどのように分散・定着しているのか、その進化系統や生態について解明を進める。
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| Outline of Annual Research Achievements |
２０２２年度は、５月の研究航海において、約１年前に異なる４地点の深海底に設置した木材４種（スギ、マツ、ブナ、ミズナラ）の回収を行った。設置前のサンプルと１年後に回収したサンプルからRNAとDNAを抽出し、ITS rRNA領域を用いた真菌アンプリコン解析を行った。木材中の真菌相にどのような変化があったのか、現在解析中である。また今後設置２年半後のサンプルについても回収を行い、解析を行う予定である。
１０月に参加した調査航海では、深海底より植物片やプラスチック片のサンプリングを行った。各サンプルより真菌類の分離培養を行い、多くの培養株の取得に成功した。
２０２１年度にサンプリングを行い解析を進めていた深海底に沈んだ植物片における真菌多様性については、詳細な解析が進み、深海生菌類Oceanitis scuticellaは水深や海域に関わらず深海環境中の植物基質に高頻度で存在することが明らかとなった。また、水深５mの浅海より回収した試料からは海生菌類であるCeriosporopsis halimaと高い相同性を示す配列が優占して検出されたが、深海由来４試料からは、C. halimaと近縁だが別種と推定される配列が優占種として検出された。このことからC. halimaと近縁な深海種が存在することが示唆された。深海における植物由来有機物の分解には、Oceanitis属やCeriosporopsis属をはじめとした深海生菌類が大きく貢献していることが示唆された。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
２０２２年度も年２回の調査航海に参加し、順調にサンプリングや解析が進んだ。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後は、２０２２年度に回収した設置木材、プラスチックゴミ、設置プラスチックサンプルの解析を進めていく。また、これまでに分離した真菌株について詳細な解析を進めるとともに、偏性深海性菌類を含めた深海由来菌類のゲノム解析などを進めていき、その遺伝的特徴などを明らかにする。
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Report
(2 results)
Research Products
(6 results)
