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標的タンパク質結合ペプチド一斉同定を可能にする新規超高速スクリーニング技術の開発

Research Project

Project/Area Number 21K06475
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 47010:Pharmaceutical chemistry and drug development sciences-related
Research InstitutionUniversity of Yamanashi

Principal Investigator

川上 隆史  山梨大学, 大学院総合研究部, 助教 (60638881)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
KeywordsDirected evolution / SELEX / PUREシステム / 遺伝暗号拡張技術 / in vitro virus / mRNAディスプレイ / cDNAディスプレイ / FGFR / cDNA display / PURE system
Outline of Research at the Start

微生物由来の再構成型のin vitro転写・翻訳共役システム(Protein-synthesis Using Recombinant Elememts system, PUREシステム)と遺伝暗号拡張技術とin vitro virus (mRNAディスプレイ)法あるいはcDNAディスプレイ法を取り入れた分子進化工学的スクリーニング(Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment, SELEX)法などを用いて、標的タンパク質に結合する新規非天然型環状Nアルキルペプチド化合物を同定する新規超高速スクリーニング技術の開発を目指す。

Outline of Annual Research Achievements

PURE(Polypeptide synthesis Using Recombinant Elements)システムと遺伝暗号拡張技術(genetic code expansion)とin vitro virus(mRNAディスプレイ)法あるいはcDNAディスプレイ法を用いて、芳香族求核置換反応(Yokoyama et al.、Chemical Communications、58、5237-5240、2022)などにより環状化した非天然型環状(Nアルキル)ペプチド化合物のDNAコード化ライブラリー(DEL)より、分子進化工学的スクリーニング(Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment, SELEX)法を用いて、がんに関わる創薬標的タンパク質である線維芽細胞増殖因子受容体(FGFR)などに結合する完全新規の非天然型環状(Nアルキル)ペプチド化合物を複数種類、同定することに成功した。また、同定した新規FGFR結合環状(Nアルキル)ペプチド化合物が、FGF/FGFR間相互作用を阻害すること、FGFR発現細胞MCF7内のFGF依存的なERKリン酸化活性をアンタゴナイズすること、MCF7のFGF依存的な細胞増殖を阻害することも発見した。更に、FGFR結合環状(Nアルキル)ペプチド化合物二量体が、FGF依存的に増殖するヒトiPS細胞の未分化維持増殖を促すアゴニスト活性を有することも発見した。 本研究成果は、日本薬学会第144年会、および、第75回日本細胞生物学会で成果発表を行なっている。また、査読付き学術論文であるBioscience, Biotechnology, and Biochemistry誌に掲載される研究成果発表も併せて行なっている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

数兆種類の非天然型環状(Nアルキル)ペプチド化合物のDNAコード化ライブラリー(DEL)より、分子進化工学的スクリーニング(Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment, SELEX)法を用いて、がんに関わる創薬標的タンパク質である線維芽細胞増殖因子受容体(FGFR)などに結合する完全新規の非天然型環状(Nアルキル)ペプチド化合物を複数種類、同定することに成功したため。また、同定した新規FGFR結合環状(Nアルキル)ペプチド化合物が、FGF/FGFR間相互作用を阻害すること、FGFR発現細胞MCF7内のFGF依存的なFGFRリン酸化活性をアンタゴナイズすること、MCF7のFGF依存的な細胞増殖を阻害することも発見したため。 更に、FGFR結合環状(Nアルキル)ペプチド化合物二量体が、FGF依存的に増殖するヒトiPS細胞の未分化維持増殖を促すアゴニスト活性を有することも発見したため。そして、本研究成果は、日本薬学会第144年会、および、第75回日本細胞生物学会で成果発表を行なっているため。また、査読付き学術論文であるBioscience, Biotechnology, and Biochemistry誌に掲載される研究成果発表も併せて行なっているため。

Strategy for Future Research Activity

これまでに、PURE(Polypeptide synthesis Using Recombinant Elements)システムと遺伝暗号拡張技術(genetic code expansion)とin vitro virus(mRNAディスプレイ)法あるいはcDNAディスプレイ法を用いて、芳香族求核置換反応などにより環状化した非天然型環状(Nアルキル)ペプチド化合物のDNAコード化ライブラリー(DEL)より、分子進化工学的スクリーニング(Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment, SELEX)法を用いて、がんに関わる創薬標的タンパク質である線維芽細胞増殖因子受容体(FGFR)などに結合する完全新規の非天然型環状(Nアルキル)ペプチド化合物を複数種類、同定することに成功した。また、同定した新規FGFR結合環状(Nアルキル)ペプチド化合物が、FGF/FGFR間相互作用を阻害すること、FGFR発現細胞MCF7内のFGF依存的なFGFRリン酸化活性をアンタゴナイズすること、MCF7のFGF依存的な細胞増殖を阻害することも発見した。更に、FGFR結合環状(Nアルキル)ペプチド化合物二量体が、FGF依存的に増殖するヒトiPS細胞の未分化維持増殖を促すアゴニスト活性を有することも発見した。
そこで今後は、SELEXスクリーニングにより同定した新規FGFR結合環状(Nアルキル)ペプチド化合物をモデル標的タンパク質結合ペプチドとして、標的タンパク質結合ペプチド一斉同定を可能にする新規超高速スクリーニング技術を開発していく予定である。

Report

(3 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (33 results)

All 2024 2023 2022 2021 Other

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 6 results) Presentation (23 results) Book (1 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] SELEX-discovered aptamer that inhibits cellular interleukin-17/interleukin-17 receptor interaction and antagonizes interleukin-17 signaling2023

    • Author(s)
      Munshi Arifur Rahman、Wang Tong、Takamori Yukio、Ando Takehiro、Yokoyama Takumi、Fuji Daisuke、Xu Zhehao、Vedi Santhana、Yamamoto Mizuki、Tsukamoto Keita、Kawakami Takashi
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: 88 Issue: 2 Pages: 147-153

    • DOI

      10.1093/bbb/zbad170

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  • [Journal Article] Growth optimization of single-phase novel colloidal perovskite Cs3Bi2I9 nanocrystals and Cs3Bi2I9@SiO2 coreshell nanocomposites for bio-medical application2022

    • Author(s)
      Vedi Santhana、Dheivasigamani Thangaraju、Selvam Govarthini Seerangan、Kawakami Takashi、Rajeswaran Narmadha、Rajendran Selvakumar、Muthukaruppan Alagar、AlFaify S.、Shkir Mohd.
    • Journal Title

      Biomaterials Science

      Volume: 10 Issue: 20 Pages: 5956-5967

    • DOI

      10.1039/d2bm00773h

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  • [Journal Article] In vitro display evolution of unnatural peptides spontaneously cyclized via intramolecular nucleophilic aromatic substitutions2022

    • Author(s)
      Yokoyama Takumi、Ando Takehiro、Takamori Yukio、Fuji Daisuke、Sato Masashi、Vedi Santhana、Yamamoto Mizuki、Kawakami Takashi
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 58 Issue: 34 Pages: 5237-5240

    • DOI

      10.1039/d2cc00584k

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  • [Journal Article] Discovery of IL-5-binding unnatural cyclic peptides from multiple libraries by directed evolution2022

    • Author(s)
      Fuji Daisuke、Ando Takehiro、Sato Masashi、Vedi Santhana、Takamori Yukio、Yokoyama Takumi、Yamamoto Mizuki、Kawakami Takashi
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 610 Pages: 188-195

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.04.043

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      Takamori Yukio、Ando Takehiro、Sato Masashi、Vedi Santhana、Fuji Daisuke、Yokoyama Takumi、Tsukamoto Keita、Yamamoto Mizuki、Kawakami Takashi
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 614 Pages: 17-21

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.05.012

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      Yokoyama Takumi、Ando Takehiro、Iwamoto Rina、Fuji Daisuke、Yamamoto Mizuki、Kawakami Takashi
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 553 Pages: 148-153

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2021.03.076

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      山本美月、安東丈洋、高守幸男、横山匠、冨士大輔、Munshi Arifur Rahman、Vedi Santhana、Wang Tong、川上隆史
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      日本薬学会第144年会
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      Vedi Santhana、安東丈洋、横山匠、高守幸男、冨士大輔、Munshi Arifur Rahman、Wang Tong、山本美月、川上隆史
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      日本薬学会第144年会
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      Munshi Arifur Rahman、横山匠、安東丈洋、高守幸男、冨士大輔、Vedi Santhana、Wang Tong、山本美月、川上隆史
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      Arifur Rahman Munshi, Takehiro Ando, Takumi Yokoyama, Yukio Takamori, Daisuke Fuji, Santhana Vedi, Tong Wang, Mizuki Yamamoto and Takashi Kawakami
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      第75回日本細胞生物学会
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      高守幸男、佐藤将、安東丈洋、横山匠、Vedi Santhana、王桐、冨士大輔、山本美月、川上隆史
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      冨士大輔、安東丈洋、横山匠、高守幸男、Vedi Santhana、王桐、山本美月、川上隆史
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      冨士大輔、安東丈洋、Vedi Santhana、佐藤将、高守幸男、横山匠、山本美月、川上隆史
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    • Author(s)
      高守幸男、冨士大輔、安東丈洋、横山匠、佐藤将、ベディサンタナ、山本美月、川上隆史
    • Total Pages
      9
    • Publisher
      シーエムシー出版
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  • [Remarks] 川上研のHP

    • URL

      https://tkawakami.wixsite.com/kawakami-laboratory

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  • [Patent(Industrial Property Rights)] 芳香族求核置換反応で環化する環状ペプチド及びそれらのペプチドライブラリー、製造方法並びにスクリーニング方法2022

    • Inventor(s)
      川上 隆史
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人山梨大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2022
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  • [Patent(Industrial Property Rights)] 芳香族求核置換反応で環化する環状ペプチド及びそれらのペプチドライブラリー、製造方法並びにスクリーニング方法2021

    • Inventor(s)
      川上隆史
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人山梨大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2021-105191
    • Filing Date
      2021
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URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2024-12-25  

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