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結晶構造に基づいたβ-ラクタム剤分解酵素メタロ-β-ラクタマーゼ阻害剤の分子設計

Research Project

Project/Area Number 21K06500
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 47020:Pharmaceutical analytical chemistry and physicochemistry-related
Research InstitutionKinjo Gakuin University

Principal Investigator

黒崎 博雅  金城学院大学, 薬学部, 教授 (70234599)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 加藤 紘一  湘南医療大学, 薬学部医療薬学科, 講師 (80814821)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywords細菌感染症 / 抗生物質 / ラクタマーゼ / 亜鉛酵素 / 感染症 / β-ラクタム剤 / 阻害剤 / 加水分解酵素 / βーラクタム剤 / ラクタム剤
Outline of Research at the Start

メタロ-β-ラクタマーゼは「最後の切り札的な存在」であるカルバペネム系β-ラクタム剤をも分解し不活化するZn(II)酵素である。さらにMBLは、セリン-β-ラクタマーゼ阻害剤も全く無効で、臨床で有効なメタロ-β-ラクタマーゼ阻害剤もないという極めて深刻な問題がある。このような現状から、本研究では、申請者らが明らかにしたMBLの結晶構造の原子座標とドッキングシミュレーションを併用し、よりメタロ-β-ラクタマーゼを強く阻害する化合物の分子設計と合成を行うことを目的とした。

Outline of Annual Research Achievements

耐性を獲得した病原菌が院内感染の要因ともなり大きな社会的問題となっている。その原因の1つにメタロ-β-ラクタマーゼの産生が挙げられる。これは、新しいβ-ラクタム加水分解機構をもつので既存のβ-ラクタマーゼ阻害剤には無効であり、カルバペネムを含むほとんど全てのβ-ラクタム剤を不活化する。そのため、メタロ-β-ラクタマーゼ産生菌を初期段階で判別することは化学療法において極めて重要である。本年度は、2021年度にセファロスポリン中間体とメタロ-β-ラクタマーゼの阻害剤であるN-[2-(5-dimethylamino-naphthalene-1-sulfonylamino)butyl]-3-mercaptopropionamideを結合させた化合物(以下、GCLE-DansylC4SHと略す)の大量合成を分子設計し合成した。本年度は、GCLE-DansylC4SHの大量合成を行い、IMP-1型メタロ-β-ラクタマーゼに対する阻害効果並びにIMP-1型メタロ-β-ラクタマーゼとKPC-3型セリン-β-ラクタマーゼに対する蛍光特性を詳細に検討した。以下に本研究で得られた知見を要約する。
(1)GCLE-DansylC4SHのIMP-1型メタロ-β-ラクタマーゼに対する50%阻害濃度(IC50)は0.6μMであった。(2)1μMのGCLE-DansylC4SHにKPC-3型セリン-β-ラクタマーゼを10μMまで段階的に添加すると蛍光相対強度の増加は観測されなかった。一方、同一条件下でIMP-1型メタロ-β-ラクタマーゼで行ったところ反応初期から蛍光相対強度が増加し、それに伴って時間と共に極大吸収が540nmから徐々に短波長側にシフトした。最終的には蛍光相対強度は増大して530nmに極大をもつ蛍光スペクトルに変化した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

すでにGCLE-DansylC4SHの合成法は確立しており、スムーズに大量に合成することができた。IMP-1型メタロ-β-ラクタマーゼとKPC-3型セリン-β-ラクタマーゼの酵素の培養と精製についても予定していたよりも短期間で調製できたので、阻害実験や蛍光分光法での検討が可能になった。

Strategy for Future Research Activity

本年度ではGCLE-DansylC4SHのIMP-1型メタロ-β-ラクタマーゼの阻害効果並びにIMP-1型メタロ-β-ラクタマーゼとKPC-3型セリン-β-ラクタマーゼに対する蛍光特性について酵素レベルで検討を行った。今後は、メタロ-β-ラクタマーゼやセリン-β-ラクタマーゼ産生菌についてGCLE-DansylC4SHの阻害能や蛍光特性を検討する予定である。

Report

(3 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2023 2022 2021

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 3 results)

  • [Journal Article] Artificial helix supramolecule by doubly p-xylyl bridged bis(ZnII-cyclen) (cyclen = 1,4,7,10-tetraazacyclododecane)2023

    • Author(s)
      Ichimaru Yoshimi、Kato Koichi、Sugiura Kirara、Isomura Risa、Fujioka Haruto、Koike Tohru、Fujii-Kishida Sayuri、Kurihara Masaaki、Yamaguchi Yoshihiro、Jin Wanchun、Imai Masanori、Kurosaki Hiromasa
    • Journal Title

      Inorganic Chemistry Communications

      Volume: 153 Pages: 110782-110782

    • DOI

      10.1016/j.inoche.2023.110782

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Bis(nitrato-κO)(1,4,8,11-tetraazacyclotetradecane-κ4N)zinc(II) methanol monosolvate2022

    • Author(s)
      Ichimaru Yoshimi、Kato Koichi、Kurihara Masaaki、Jin Wanchun、Koike Tohru、Kurosaki Hiromasa
    • Journal Title

      IUCrData

      Volume: 7 Issue: 8 Pages: 220854-220863

    • DOI

      10.1107/s2414314622008549

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Difference in the Inhibitory Effect of Thiol Compounds and Demetallation Rates from the Zn(II) Active Site of Metallo-β-lactamases (IMP-1 and IMP-6) Associated with a Single Amino Acid Substitution2022

    • Author(s)
      Yamaguchi Yoshihiro、Kato Koichi、Ichimaru Yoshimi、Uenosono Yuya、Tawara Sakiko、Ito Rio、Matsuse Natsuki、Wachino Jun-ichi、Toma-Fukai Sachiko、Jin Wanchun、Arakawa Yoshichika、Otsuka Masami、Fujita Mikako、Fukuishi Nobuyuki、Sugiura Kirara、Imai Masanori、Kurosaki Hiromasa
    • Journal Title

      ACS Infectious Diseases

      Volume: 9 Issue: 1 Pages: 65-78

    • DOI

      10.1021/acsinfecdis.2c00395

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal Structure of Bis{1,3-bis[bis(pyridin-2-ylmethyl)amino]propan-​2-olato-dizinc(II)}orthophosphate Tris(perchlorate) Octahydrate, [(Phos-tag)<sub>2</sub>-PO<sub>4</sub><sup>3−</sup>][ClO<sub>4</sub><sup>−</sup>]<sub>3</sub>·8H<sub>2</sub>O2021

    • Author(s)
      Ichimaru Yoshimi、Kato Koichi、Jin Wanchun、Sugiura Kirara、Kinoshita-Kikuta Emiko、KINOSHITA Eiji、Kurosaki Hiromasa、Koike Tohru
    • Journal Title

      X-ray Structure Analysis Online

      Volume: 37 Issue: 0 Pages: 87-88

    • DOI

      10.2116/xraystruct.37.87

    • NAID

      130008127785

    • ISSN
      1883-3578
    • Year and Date
      2021-12-10
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Characterization of the binding of adenosine-5’-monophosphate to a mu-type alkoxide-linked dinuclear zinc(II) complex in crystal and solution state.2021

    • Author(s)
      Kinoshita-Kikuta, E., Ichimaru, Y., Yamano, Y., Kato, K., Kurosaki, H. Eiji Kinoshita, Koike, T.
    • Journal Title

      Bull. Chem. Soc. Jpn.

      Volume: 94(11) Issue: 11 Pages: 2670-2677

    • DOI

      10.1246/bcsj.20210280

    • NAID

      130008137574

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2024-12-25  

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