Whole-genome analysis for drug-resistance and pathogenicity of Aspergillus fumigatus
| Project/Area Number |
21K07001
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 49050:Bacteriology-related
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| Research Institution | Chiba University |
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Principal Investigator |
高橋 弘喜 千葉大学, 真菌医学研究センター, 准教授 (60548460)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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| Keywords | 病原真菌 / アスペルギルスフミガタス / 薬剤耐性 / ゲノム解析 / 集団構造 / Aspergillus fumigatus / 系統解析 / 次世代シーケンサー |
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| Outline of Research at the Start |
環境中に普遍的に存在する糸状菌アスペルギルスフミガタスは、肺アスペルギルス症の主要な原因菌である。治療中にアゾール系抗真菌薬に対する耐性株が出現すると極めて難治となる。薬剤耐性となった菌株の系統的な特徴や臨床分離株のゲノム的特徴について明らかにできれば、新たな治療戦略を確立する上で重要な知見となる。本研究では、臨床分離株と環境分離株の大規模な（>150株）ゲノム解析を実施し、薬剤耐性が出現する系統、および病原性を規定する系統という２つの高リスク系統の同定とそれらに関連する因子の探索を目的とする。
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| Outline of Annual Research Achievements |
環境中に普遍的に存在する真菌アスペルギルスフミガタスは、環境中の物質循環に貢献しているのみならず、重篤な肺アスペルギルス症の原因菌として最も多く分離されることから、病原菌としても我々と密接な関係にある。近年、我が国を含む先進国を中心に肺アスペルギルス症が増加傾向にあり、主に治療に使用されているアゾール系抗真菌薬に対する耐性株も出現していることから、その治療戦略の確立が急務となっている。しかしながら、未だ薬剤耐性の性状変化が起こる菌株とその遺伝的背景の関連については明らかとなっていないことから、薬剤耐性となった菌株の系統的な特徴や臨床分離株のゲノム的特徴について明らかにできれば、新たな治療戦略を確立する上で重要な知見となる。そこで本研究では、（１）薬剤耐性化が起こる菌株に系統的な特徴はあるのか？（２）臨床分離株に系統的な特徴はあるのか？、という２つの高リスク系統に迫ることを目的とする。そのために、千葉大学真菌医学研究センターで保存されている分離源が明確なアスペルギルスフミガタスの本邦分離株(臨床分離株・環境分離株)の全ゲノムシーケンスを大規模に実施し、高精度な系統関係の構築を進めた。今年度は、本邦で分離された170株に加えて、世界各地で分離された株のゲノムデータ、薬剤感受性試験データを収集し統合解析を実施した。計876株を用いて、アスペルギルスフミガタスの遺伝集団について調査したところ、アスペルギルスフミガタスの遺伝系統には、地理的特徴が影響しており、我が国で分離される系統が存在することが明らかとなった。また、薬剤耐性化に関わる遺伝子座を同定し、高リスク系統の特徴の一端を解明した。
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Report
(3 results)
Research Products
(20 results)
