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Integrated regulatory system by functional sRNA and mRNA-binding protein CsrA

Research Project

Project/Area Number 21K07004
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 49050:Bacteriology-related
Research InstitutionEhime Prefectural University of Health Science

Principal Investigator

Mima Takehiko  愛媛県立医療技術大学, 保健科学部, 教授 (80596437)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 港 雄介  藤田医科大学, 医学部, 講師 (10836620)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords発現調節 / sRNA / RNA binding protein / Vibrio / 遺伝子発現調節 / RNA結合タンパク質 / 発現制御 / 二成分制御系 / 環境適応
Outline of Research at the Start

細菌は、単細胞であるが故に多様な環境に直接曝されており、複数の環境要因を感知して適応する必要がある。申請者は、海洋性細菌V. alginolyticusが保有する4つの機能性small RNAが、「様々な環境シグナルを受けて演算し、適切な遺伝子発現パターンを導く統合型発現制御システムである。」という新しい仮説を提唱した。本研究では、種々の遺伝学的手法および網羅的手法を用いて、統合型発現制御システムの全容を明らかにする。

Outline of Final Research Achievements

VarS/VarA two-component regulatory system controls the expression of target genes through regulating the transcription of small RNAs (sRNAs). Bacteria possesses several copies of sRNA genes which were thought to be redundant. Vibrio alginolyticus possesses four copies of sRNAs. We have found the possibility that different proteins regulate the expression of their respective sRNAs. This study revealed that the expression of one of the four sRNAs, sRNA1, is regulated by the anaerobic state signal via ArcB/ArcA two-component regulatory system and leucine signals via Lrp. Based on these results, we proposed a model in which the regulatory system consisting of the multiple copies of sRNAs and an mRNA-binding protein CsrA is an integrated regulatory system that integrates multiple environmental signals to optimize the expression of target genes.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究は、これまでVarS/VarA二成分制御系の構成因子とされていた複数コピーのsRNAが、他の複数の環境シグナルによっても別々に制御されることを初めて示した。その結果から、それら複数コピーのsRNAとRNA結合タンパク質CsrAからなる制御系が、複数の環境シグナルを統合して演算し、環境の変化に適応するための複数の標的遺伝子の発現を統合的に調節する(multiple-input and multiple-output)という全く新しい発現調節機構(sRNAs-CsrA統合制御システム)であると考えられることを示した学術的意義の大変高いものである。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2023 2022 2021 Other

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results) Presentation (7 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Elizabethkingia anophelis, an emerging pathogen, inhibits RAW 264.7 macrophage function2021

    • Author(s)
      Mayura I. Putu Bayu、Gotoh Kazuyoshi、Nishimura Hayato、Nakai Erina、Mima Takehiko、Yamamoto Yumiko、Yokota Kenji、Matsushita Osamu
    • Journal Title

      Microbiology and Immunology

      Volume: 65 Issue: 8 Pages: 317-324

    • DOI

      10.1111/1348-0421.12888

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Vibrio alginolyticusのArcB/ArcA二成分制御系による遊走制御機構の解析2023

    • Author(s)
      藤井 萌,横田憲治,美間健彦
    • Organizer
      第76回日本細菌学会総会中国・四国支部総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Regulation of sRNA1 expression by ArcB/ArcA two-component regulatory system in Vibrio alginolyticus.2023

    • Author(s)
      美間健彦、藤井 萌、後藤和義、山本由弥子、横田憲治、松下 治
    • Organizer
      第96回日本細菌学会総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Md Asaduzzaman、美間健彦、後藤和義、山本由弥子、内山淳平、Joshua Sakon、松下 治2023

    • Author(s)
      細菌性コラゲナーゼの構造活性相関の解析
    • Organizer
      第96回日本細菌学会総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 細菌代謝機構を標的とした抗菌化合物のスクリーニング2023

    • Author(s)
      猪飼まりえ、熊懐香葉、平田 直、藤井 萌、坂入孔明、美間健彦、森田雄二、佐藤綾人、港 雄介
    • Organizer
      第96回日本細菌学会総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Vibrio alginolyticusのArcB/ArcA二成分制御系による sRNA1の発現調節機構の解析2022

    • Author(s)
      美間健彦、後藤和義、山本由弥子、横田憲治、松下 治
    • Organizer
      第75回日本細菌学会中国四国支部総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Regulation of expression of the VarS/VarA-controlled sRNA by ArcA in Vibrio alginolyticus.2022

    • Author(s)
      美間健彦、Agus Eka Darwinata、後藤和義、山本由弥子、松下 治
    • Organizer
      第95回日本細菌学会総会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Vibrio alginolyticusのsmall RNAの発現調節機構の解明2021

    • Author(s)
      松下 治、美間健彦、後藤和義、山本由弥子、横田憲治
    • Organizer
      2021年度中四国乳酸菌研究会・研究発表会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Remarks] 愛媛県立医療技術大学ホームページ

    • URL

      https://www.epu.ac.jp/graduate/health_sciences/in-mima.html

    • Related Report
      2023 Annual Research Report 2021 Research-status Report
  • [Remarks] 愛媛県立医療技術大学ウェブサイト

    • URL

      https://www.epu.ac.jp/graduate/health_sciences/in-mima.html

    • Related Report
      2022 Research-status Report

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Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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