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Functional analysis of Safford virus receptor candidate genes identified by CRISPR screening

Research Project

Project/Area Number 21K07045
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 49060:Virology-related
Research InstitutionKanazawa Medical University

Principal Investigator

OKUWA Takako  金沢医科大学, 医学部, 助教 (20460347)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
KeywordsSaffold virus / 感染受容体 / CRISPRスクリーニング / CRISPR/Cas9 / sgRNAライブラリー / サフォードウイルス
Outline of Research at the Start

これまでに、CRISPR/Cas9 システムを用いて サフォードウイルス (SAFV) 高感受性細胞の遺伝子を網羅的にノックアウトし、SAFV 非感受性となった細胞から感染受容体遺伝子の候補を抽出した。その候補遺伝子の解析の結果、SAFV の吸着・侵入の過程には候補遺伝子以外の宿主因子が関与していることが示唆された。本研究では、再びCRISPR/Cas9 システムを用いて、これまでに感染に関与することを明らかにした宿主因子以外の受容体遺伝子を同定する。最終的に、受容体の SAFV 遺伝子型特異性、組織分布を明らかにし、さらに、SAFV 病原性発現の分子機構を明らかにする。

Outline of Final Research Achievements

We have previously selected Saffold virus (SAFV) receptor candidate genes by genome-wide knockout screening using the CRISPR/Cas9 system. Among these candidate genes, we found that heparan sulfate (HS) is important for SAFV infection based on analysis of genes involved in HS biosynthesis. Furthermore, to identify SAFV receptors that were thought to exist in addition to HS, we generated an HS-deficient HeLa cell line and performed a CRISPR screening using this cell line. We identified SAFV receptors other than HS among the candidate genes selected in this screening.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

SAFVは上気道炎、胃腸炎、手足口病様疾患、無菌性髄膜炎、脳炎、膵炎などの患者検体から検出されていることから、多様な疾患の原因になると考えられるが、これらの疾患がどのようにして引き起こされるのかは解明されていない。本研究では、SAFVの感染に重要な受容体を同定した。受容体分子の発現分布からSAFVの組織親和性が明らかになり、その組織の細胞株を用いてSAFVの高感度な検出・分離が可能となるだけでなく、感染細胞の解析により、SAFVの詳細な病原性発現の分子機構の解明に繋がることが期待される。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2023 2021

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Generation of a recombinant Saffold Virus expressing UnaG as a marker for the visualization of viral infection2023

    • Author(s)
      Okuwa Takako、Himeda Toshiki、Utani Koichi、Higuchi Masaya
    • Journal Title

      Virology Journal

      Volume: 20 Issue: 1 Pages: 175-175

    • DOI

      10.1186/s12985-023-02142-8

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] CRISPR/Cas9 システムを用いた Saffold virus 受容体の同定2023

    • Author(s)
      大桑孝子, 姫田敏樹, 小林郷介, 野村奈美子, 宇谷公一, 小池 智, 樋口雅也
    • Organizer
      第70回日本ウイルス学会学術集会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] CRISPR/Cas9システムを用いたSaffoldウイルス感染受容体同定の試み2021

    • Author(s)
      大桑孝子、姫田敏樹、宇谷公一、小林郷介、小池智、樋口雅也
    • Organizer
      第68回日本ウイルス学会学術集会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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