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Missense rare variant analysis of APOE: Exploring the link between lipid metabolism and Alzheimer's disease

Research Project

Project/Area Number 21K07271
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 51030:Pathophysiologic neuroscience-related
Research InstitutionNiigata University

Principal Investigator

Miyashita Akinori  新潟大学, 脳研究所, 准教授 (60323995)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 他田 真理  新潟大学, 脳研究所, 准教授 (30646394)
阿部 学  新潟大学, 脳研究所, 准教授 (10334674)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
KeywordsAPOE / アルツハイマー病 / 感受性遺伝子 / バリアント / レアミスセンスバリアント / コモンミスセンスバリアント / コモンレアミスセンスバリアント / ミスセンスバリアント / 脂質代謝 / 認知症 / 脂質
Outline of Research at the Start

アポリポプロテインE遺伝子(APOE)はアルツハイマー病(AD)の最も強力な感受性遺伝子である。しかし、日本人においてマイナーアリル頻度(MAF)が1%未満でかつ、アミノ酸置換を伴うミスセンスレアバリアント解析は全く行われていない。そこで本研究ではこれまでに同定したAPOEのミスセンスレアバリアントに注力し、ADとの遺伝学的な関連解析、病理学的検証、モデル細胞・マウスによる機能解析を行う。

Outline of Final Research Achievements

The apolipoprotein E gene (APOE) is a significant susceptibility gene for Alzheimer's disease (AD). In recent years, studies in Western countries have focused on rare missense variants (RMVs) of APOE with a minor allele frequency (MAF) of less than 1%, leading to important discoveries that impact the pathology of AD. However, by 2020, no such studies had been conducted on Japanese individuals. Consequently, the applicant initiated this research project to investigate APOE RMVs in the Japanese population. During the project, more than 5,800 subjects were analyzed. The results revealed the presence of RMVs that are unique to East Asians, including Japanese individuals.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

疾患の病因解明や新たな治療戦略を創出する上で、アミノ酸置換や機能喪失を引き起こすレアバリアントの同定とその機能解析は、大きなブレイクスルーをもたらす可能性がある。例えば、APOEで同定されたクライストチャーチバリアントは神経細胞内に蓄積する毒性の高いリン酸化タウタンパクに対して抵抗性を示すことが明らかにされた。本研究プロジェクトを通じて同定されたAPOE RMVsの機能解析を今後展開することで、このような病態と関わりが理解されると期待される。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 2 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Polygenic effects on the risk of Alzheimer’s disease in the Japanese population2024

    • Author(s)
      Kikuchi M et al.
    • Journal Title

      Alzheimer's Research & Therapy

      Volume: 16 Issue: 1 Pages: 0-0

    • DOI

      10.1186/s13195-024-01414-x

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Clinicopathologic features of two unrelated autopsied patients with Charcot-Marie-Tooth disease carrying MFN2 gene mutation2023

    • Author(s)
      Hayashi H, Saito R, Tanaka H, et al.
    • Journal Title

      Acta Neuropathologica Communications

      Volume: 11 Issue: 1 Pages: 207-207

    • DOI

      10.1186/s40478-023-01692-w

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Genetics of Alzheimer’s disease: an East Asian perspective2022

    • Author(s)
      Miyashita Akinori、Kikuchi Masataka、Hara Norikazu、Ikeuchi Takeshi
    • Journal Title

      Journal of Human Genetics

      Volume: 68 Issue: 3 Pages: 115-124

    • DOI

      10.1038/s10038-022-01050-z

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] APOEコモン・レアミスセンスレアバリアント2023

    • Author(s)
      宮下哲典
    • Organizer
      The ApoEーapoE好きがapoEについて語る会ー
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 認知症のトランスクリプトーム解析:ヒト剖検脳のシングル核解析から見えてくるもの2023

    • Author(s)
      宮下哲典、他田真理、原範和、長谷川舞衣、柿田明美、池内健
    • Organizer
      第41回(2022年)日本認知症学会学術集会(東京)
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] ヒト剖検脳におけるAD、LATE、PARTの感受性バリアント解析2022

    • Author(s)
      宮下哲典、金田大太、原範和、月江珠緒、長谷川舞衣、春日健作、橋詰良夫、池内健
    • Organizer
      第41回(2022年)日本認知症学会学術集会(東京)
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Book] アルツハイマー病治療の新たなストラテジー2022

    • Author(s)
      宮下哲典、原範和、池内健
    • Total Pages
      150
    • Publisher
      先端医学社
    • ISBN
      4865505407
    • Related Report
      2022 Research-status Report

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Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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