正準判別分析を用いたトランスクリプトミクスによる腫瘍分類システムの開発

Research Project

Project/Area Number	21K07397
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 52010:General internal medicine-related
Research Institution	Bunkyo Gakuin University
Principal Investigator	小松博義文京学院大学, 保健医療技術学部, 非常勤講師 (30170377)
Project Period (FY)	2021-04-01 – 2025-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help	¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000) Fiscal Year 2024: ¥390,000 (Direct Cost: ¥300,000、Indirect Cost: ¥90,000) Fiscal Year 2023: ¥390,000 (Direct Cost: ¥300,000、Indirect Cost: ¥90,000) Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000) Fiscal Year 2021: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000)
Keywords	トランスクリプトミクス / 腫瘍分類 / 正準判別分析
Outline of Research at the Start	蛋白質レベルでのリン酸化蛋白質発現プロファイルを作成し、これに多変量解析を応用することで属性未知の腫瘍細胞の由来を明らかにすることに成功した。本来は臨床的に有意な意義を有していない蛋白質であっても、それら蛋白質に思わぬ臨床的意義が浮かび上がることを明らかにしたとともに、細胞内の動きを個別的なリン酸化蛋白質分子の働きから見るのではなく、マス（mass）としてリン酸化蛋白質群の働きを解析する必要があると確信した。そこで、トランスクリプトミクスを用いて細胞内における遺伝子の発現状況を網羅的に把握することにより遺伝子レベルでのリン酸化蛋白質発現プロファイルを作成する。