Cerebral white matter lesions and cerebral small vessel disease-related gene variants in the Japanese general population
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21K07441
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 52020:Neurology-related
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| Research Institution | Kyoto Prefectural University of Medicine |
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Principal Investigator |
水田 依久子 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (80397760)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
水野 敏樹 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 特任教授 (30264782)
渡辺 明子 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 特任助教 (90828881)
佐々木 真理 岩手医科大学, 医歯薬総合研究所, 教授 (80205864)
布施 昇男 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 教授 (10302134)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2025-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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| Keywords | 東北メディカル・メガバンク / 脳小血管病 / 白質病変 / 遺伝要因 / NOTCH3 / 一般集団 / 大脳白質病変 / NOTCH3バリアント / バイオバンク |
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| Outline of Research at the Start |
大脳白質病変は脳MRI検査で高齢者に少なからず認められ、脳卒中の発症・再発・予後悪化および認知機能低下の重要な危険因子であることが報告されている。一方、早期から大脳白質病変を呈する脳小血管病CADASIL の原因遺伝子NOTCH3のバリアント（配列の変化）が一般集団にも存在し、特に東アジアで多いことが報告されている。本研究ではNOTCH3が一般集団の大脳白質病変に関連するという仮説をたて、この仮説を検証するために、大規模な地域住民ゲノムコホート研究である東北メディカル・メガバンクのデータを用いて、大脳白質病変とNOTCH3遺伝子バリアントとの関連解析を行う。
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、東北メディカル・メガバンクのデータのうちMRIのFLAIR画像とゲノム情報を持つ325人を研究対象とし、岩手医科大学匿名化データ解析室のスパコン端末からデータにアクセスして白質病変と遺伝子バリアントとの関連解析を行う。
前年度に引き続き、研究代表者は研究分担者（京都府立医大：水野・渡邉、岩手医科大学／いわて東北メディカル・メガバンク機構(IMM)：佐々木、東北大学／東北メディカル・メガバンク機構(ToMMo)：布施）および研究協力者（岩手医科大学／IMM：清水・須藤・山下・山﨑、東北大学／ToMMo：木下・麦倉・森・平良・宮澤・齊藤・坂本、京都府立医大：松浦）と連携して、メールおよび対面で相談を行いながらデータ収集と解析を進めた。
今年度は調査票から生活習慣病、生活習慣に関するデータとして、高血圧、糖尿病、高脂血症の既往、喫煙歴、飲酒歴の解析を行った。高血圧の重症度の判定のための眼底検査所見解析も行い、白質病変の自動定量解析も進めた。また、東北メディカル・メガバンクから公開されている約54万人のゲノムバリアントデータベース54KJPNのデータを解析し、遺伝子の病的バリアントの有償データベースであるHGMDを参考にしながら、本研究で着目している8個の遺伝子（NOTCH3, HTRA1, GLA, COL4A1, COL4A2, TREX1, ABCC6, RNF213）から抽出するバリアントのリスト作成を進めた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
画像や臨床項目のデータ解析は岩手医科大学匿名化データ解析室にて行う必要があるが、研究代表者を含めた京都府立医科大学の3名の研究者が岩手医科大学に出張できる日程が限られていた。
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| Strategy for Future Research Activity |
岩手医科大学匿名化データ解析室にてデータクリーニングを完成し、遺伝子バリアントデータ抽出を行い、白質病変と遺伝因子との関連解析を行い、研究分担者、研究協力者間で情報共有と討議を継続し、学会発表と論文作成を行う。
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Report
(3 results)
Research Products
(1 results)
