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Development of biomarker for postpartum depression using GWAS and metabolomics

Research Project

Project/Area Number 21K07479
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 52030:Psychiatry-related
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

高橋 長秀  名古屋大学, 医学部附属病院, 准教授 (50846714)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 富田 博秋  東北大学, 医学系研究科, 教授 (90295064)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywords産後うつ病 / GWAS / メタボローム / ゲノム解析 / メタボローム解析
Outline of Research at the Start

産後を含む周産期うつ病は頻度が高く、妊産婦には苦痛とQOL低下、ひいては自死をもたらし、児の養育環境の悪化も引き起こすために、早期発見・要介入群の同定や適切な治療法の確立が喫緊の課題である。本研究では、妊産婦前向きコホート参加者のDNAおよび血漿を用いて①ゲノムワイド関連解析による発症リスクを高める遺伝子多型とパスウェイの同定②先行研究を利用したPolygenic risk score解析によるコホート参加者の産後うつ病に対する遺伝的リスクの算出と、発症に対する診断能・経過予測能の検討③末梢血のメタボローム解析による疾患の発症と重症度に関連する代謝物の同定とバイオマーカーとしての評価を行う。

Outline of Annual Research Achievements

名古屋大学および関連病院から収集された妊産婦1002検体を東北大学に送付し、Japonica array NEOを用いて65万SNPをgenotypingした。日本人リファレンスパネル(4.2KJPN)を元にインピューテーションを行い、Quality Control(Hardy-Weinberg Equilibrium解析, imputation精度)を行い 、頻度1%以上の618万SNPについてgenotypingデータを取得し、複数回出産をしている妊婦については、初産のデータのみを使用した。IBD解析を行い、血縁関係にある妊婦を対象から除外し、PCA解析によりPopulation stratification analysisを行い、PC1-10および産前のうつ状態をcovariateとして産後うつ病発症群 vs 産後うつ病未発症群で関連解析を行い、染色体9番のABO遺伝子上に位置するSNPがゲノムワイドに有意な関連を示すことを見出した。東北メディカルメガバンクの検体を用いて、replicationを行ない、有意な関連が見られ、論文を作成し投稿したが、東北メディカルメガバンクをDiscovery cohortとして解析を行ったところ、新たなシグナルが見つかり、順番を入れ替えて両者を統合したデータにて論文を再投稿した。
メタボローム解析については、妊娠中・産後を通じて抑うつ状態の見られなかった妊産婦と産後にのみうつ状態の見られた妊産婦の血漿中の代謝物170について解析を行い、結果として、7つの代謝物が、産前・産後において変化していることを見出し、産後うつ病の病態に関連していることが示唆され、Pathway解析を行ったが、東北メディカルメガバンクの検体では再現されず、偽陽性の可能性が高いと考えられた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

当初予定していた解析はほぼ終了した。メタボローム解析では有意な結果は得られなかったが、GWASにてリスクアレルの同定を行うことができた。

Strategy for Future Research Activity

今後はさらにサンプル数を拡大し、浜松医科大学母と子の出生コホートとも協力して研究を進めていく。

Report

(3 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2024 2023 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] City University of New York(米国)

    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Journal Article] Early identification of postpartum depression using machine learning2024

    • Author(s)
      Nakamura Yukako、Ueno Taro、Takahashi Nagahide、Ichikawa Daisuke、Yamauchi Aya、Ozaki Norio
    • Journal Title

      Psychiatry and Clinical Neurosciences

      Volume: - Issue: 6 Pages: 372-373

    • DOI

      10.1111/pcn.13659

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Interaction of genetic liability for attention deficit hyperactivity disorder (ADHD) and perinatal inflammation contributes to ADHD symptoms in children2023

    • Author(s)
      Takahashi Nagahide、Nishimura Tomoko、Harada Taeko、Okumura Akemi、Iwabuchi Toshiki、Rahman Md Shafiur、Kuwabara Hitoshi、Takagai Shu、Usui Noriyoshi、Makinodan Manabu、Matsuzaki Hideo、Ozaki Norio、Itoh Hiroaki、Nomura Yoko、Newcorn Jeffrey H.、Tsuchiya Kenji J.
    • Journal Title

      Brain, Behavior, & Immunity - Health

      Volume: 30 Pages: 100630-100630

    • DOI

      10.1016/j.bbih.2023.100630

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The association between screen time and genetic risks for neurodevelopmental disorders in children2023

    • Author(s)
      Takahashi Nagahide、Tsuchiya Kenji J.、Okumura Akemi、Harada Taeko、Iwabuchi Toshiki、Rahman Md Shafiur、Kuwabara Hitoshi、Nomura Yoko、Nishimura Tomoko
    • Journal Title

      Psychiatry Research

      Volume: 327 Pages: 115395-115395

    • DOI

      10.1016/j.psychres.2023.115395

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Remarks] ResearchMap

    • URL

      https://researchmap.jp/read0130366

    • Related Report
      2023 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2024-12-25  

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