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Measurement of Survival Curves and Gene Expression Levels in Various Cell Lines Following Radiation Exposure

Research Project

Project/Area Number 21K07617
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 52040:Radiological sciences-related
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

Hirano Yoshiyuki  名古屋大学, 医学系研究科(保健), 准教授 (00423129)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 松井 佑介  名古屋大学, 医学系研究科(保健), 准教授 (90761495)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000)
Fiscal Year 2022: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
KeywordsRNA-seq / 放射線治療 / 放射線影響 / 遺伝子発現 / バイオインフォマティクス / 生物効果モデル / 放射線耐性 / ガンマ線損傷 / コロニーアッセイ / 放射線照射による遺伝子発現 / 遺伝子発現情報 / 細胞生存率 / 生物線量 / 生物学的効果比
Outline of Research at the Start

放射線治療において、局所制御率や正常組織の有害事象を予測することは極めて重要である。そのための生物効果モデルが幾つか提案されているが、限られた細胞株でしか検証されていない。またほとんどがLET (linear energy transfer)等の物理量を基に作成されている。そこで本研究では、放射線治療適用部位を起源とする細胞株を中心に、多くの細胞株の細胞生存率曲線と、生物学的な量として、照射後の遺伝子発現情報を取得する。これらのデータベースを作成し、遺伝子発現量と細胞生存率曲線との関係を明らかにするとともに、得られた知見からより高精度な生物効果モデルの作成を試みる。

Outline of Final Research Achievements

Using HeLa cells, we measured and analyzed the gene expression levels at 1, 5, and 12 h after gamma radiation exposure using RNA-seq. We classified the genes with similar variations into 12 groups and identified the biological processes of each group. Additionally, we examined gene expression differences after gamma ray exposure in both highly radiosensitive and radioresistant cell lines to investigate the dependence of gene expression differences on radiosensitivity. No characteristic gene expression was observed in the radioresistant cell lines. However, it was found that radioresistant cell lines exhibited fewer changes in gene expression compared to the highly radiosensitive cell lines. Identifying the reasons for these differences remains a future challenge.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

放射線治療の分野においても遺伝子の情報を利用する機会が益々増えると考えられる。その際に、様々な細胞株における放射線照射後の遺伝子発現データは、どのように遺伝情報を有効利用するかを決定するための基礎データとして欠かせないと考えられ、本研究ではそのデータの一部を取得できた。また放射線感受性と遺伝発現情報との関係を明らかにすることができれば、より高精度な放射線治療効果予測や効果的な放射線防護につながると考えられ、本研究ではその関係の特徴を示すことができた。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2023 2022

All Presentation (4 results)

  • [Presentation] Analysis of gene expression changes in human tumor cells after gamma irradiation using RNA-seq2023

    • Author(s)
      加藤誠也、平野祥之
    • Organizer
      放射線影響学会66回大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Simulation study of the H abstraction from DNA sugar moiety by OH radicals using molecular dynamics and ab initio calculation2023

    • Author(s)
      平野祥之
    • Organizer
      放射線影響学会66回大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Gene expression analysis of radioresistance in human cell lines2023

    • Author(s)
      平野祥之
    • Organizer
      The 125th Scientific Meeting of the Japan Society of Medical Physics
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Analysis of temporal variations of gene expression after gamma-ray irradiation in HeLa cells by RNA-seq2022

    • Author(s)
      Satsuki MYOGA Yoshiyuki HIRANO
    • Organizer
      日本放射線影響学会第65回大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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