| Project/Area Number |
21K07771
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 52050:Embryonic medicine and pediatrics-related
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| Research Institution | Nagoya University |
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Principal Investigator |
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
奥野 友介 名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(医学), 教授 (00725533)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
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| Keywords | 若年性骨髄単球性白血病 / エピゲノム / JMML / クロマチン免疫沈降シーケンス / ヒストン修飾 |
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| Outline of Research at the Start |
若年性骨髄単球性白血病（juvenile myelomonocytic leukemia; JMML）は、主に5歳未満の小児に発症する予後不良な造血器腫瘍である。本研究では、予備的検討で確立したChIP-Seqの手法を利用し、H3K27ac、H3K36me3、H3K27me3、H3K4me3などの代表的なヒストン修飾に対するChIP-Seqを平行して行うことで、JMMLにおけるヒストン修飾の網羅的プロファイリングを行う。加えて、過去の研究で解析済みの全ゲノムシーケンス・RNAシーケンスなどの網羅的遺伝子情報との統合的な解析により、JMMLの分子学的発症メカニズムの全体像を明らかにする。
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| Outline of Final Research Achievements |
Juvenile myelomonocytic leukemia (JMML) is a hematopoietic tumor with poor prognosis that mainly affects children under the age of 5 years. In this study, we performed comprehensive profiling of histone modifications by chromatin immunoprecipitation sequencing (ChIP-Seq) to elucidate the overall molecular pathogenesis mechanism and extracted candidate enhancer regions enriched in the disease-specific histone mark H3K27ac in JMML. In addition, we performed an integrated analysis with other genomic analyses (single-cell RNA sequencing and error-corrected sequencing).
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
若年性骨髄単球性白血病（juvenile myelomonocytic leukemia; JMML）は、主に5歳未満の小児に発症する予後不良な造血器腫瘍である。唯一の根治療法は同種造血細胞移植であるが、満足できる治療成績は得られていない。今回のクロマチン免疫沈降シーケンスを含む網羅的遺伝子解析による研究成果により、JMMLの分子学的発症メカニズムの更なる解明が進み、予後を正確に予測するバイオマーカーに基づく最適医療（PrecisionMedicine）の実現に寄与することが期待される。
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