GWAS and post-GWAS on genes associated with occurrence of ANCA-associated vasculitis and comorbidity of interstitial lung diseases.
Project/Area Number |
21K08435
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 54020:Connective tissue disease and allergy-related
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Research Institution | University of Tsukuba |
Principal Investigator |
土屋 尚之 筑波大学, 医学医療系, 教授 (60231437)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
針谷 正祥 東京女子医科大学, 医学部, 教授 (20238207)
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Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
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Keywords | ANCA関連血管炎 / ゲノムワイド関連研究 / 再燃 / 生存曲線解析 / HLA / 間質性肺疾患 / 好酸球性多発血管炎性肉芽腫症 / TSLP / 疾患感受性遺伝子 / GWAS / ポストGWAS |
Outline of Research at the Start |
ANCA関連血管炎(AAV)の疫学はヨーロッパ系集団と東アジア集団において顕著に異なり、東アジアではMPO-ANCA陽性AAVが大部分を占め、間質性肺疾患(ILD)の合併率が高い。われわれは最近、日本人AAVを対象とするGWASにより、多数の新規関連候補領域を見いだした。本研究では、独立の患者対照群によるsecond GWASとメタアナリシスにより新規関連バリアントを見出すとともに、機能的候補領域のシークエンス解析により新規関連バリアントの同定を行い、AAV発症およびILD合併の遺伝因子を包括的に検出する。さらに、ポストGWAS研究により、分子標的やバイオマーカー同定の端緒を開く。
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Outline of Annual Research Achievements |
2022年度は、ポストGWAS研究の一環として、すでにMPO-ANCA陽性血管炎(MPO-AAV)の発症との関連を報告したHLA-class IIについて、病因的アリルを検討するとともに、寛解後の再燃リスクとの関連を検討した。 発症との関連では、中国人集団においてMPO-AAVとの関連が報告されたHLA-DQA1*03:02が日本人集団においても有意に関連することが検出されたが、DRB1*09:01-DQB1*03:03ハプロタイプと強い連鎖不平衡にあり、いずれが一義的な発症関連アリルかの決定は困難であった。現時点では、DRB1*09:01-DQA1*03:02-DQB1*03:03を発症リスクハプロタイプと考えるのが妥当と結論した。 寛解後の再燃リスクとの関連では、発症リスク同様、DRB1*09:01-DQA1*03:02-DQB1*03:03が関連する傾向が見出された。一方、HLA-DR分子のβ鎖 position 13にSerを有するアリル(DRβ1_13S)を保有すると再燃に抵抗性であることが見出された。 そこで、再燃リスクに関連するDQA1*03:02と再燃抵抗性に関連するDRβ1_13Sの有無によって患者群を4群に分けて生存曲線解析を行ったところ、DQA1*03:02陽性かつDRβ1_13S 陰性群では、DQA1*03:02陰性かつDRβ1_13S陽性群と比較して、ハザード比4.02(95% 信頼区間 1.39-11.6)で有意に再燃リスクが高いことが明らかになった。 また、新たなゲノムワイド関連研究(second GWAS)の対象となるANCA関連血管炎(AAV)患者試料と臨床情報の収集を行った。合計で約200検体に到達したが、受託解析先が当初の計画から変更になったことに伴い、変更倫理申請等に時間を要したため、GWASは2023年度に施行することとなった。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
MPO-AAVの再燃リスクとHLAとの関連に関して新たな知見が得られ、2022年度内に英文原著論文として出版することができたことから、概ね順調に進展していると判断する。 一方、ゲノムワイド関連研究(GWAS)については、症例のリクルートは順調に進行したものの、当初予定されていた受託解析先に、価格の上昇、納期が遅いことなどの問題が生じ、さらに研究上の必要性からも、受託解析先の変更が必要となった。研究代表施設ならびに共同研究施設を含めて、変更倫理審査が必要となったため、GWASは当初の予定より遅れ、2023年度に施行することとなった。
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Strategy for Future Research Activity |
受託解析先の変更に関する変更倫理審査が研究代表施設および共同研究施設で承認され次第、当初の計画通り、ゲノムワイド関連研究を施行し、MPO-AAV発症関連バリアントおよび間質性肺疾患合併関連バリアントの解析を進める。
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Report
(2 results)
Research Products
(9 results)
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[Journal Article] Association of HLA class II alleles with risk of relapse in myeloperoxidase-antineutrophil cytoplasmic antibody positive vasculitis in the Japanese population.2023
Author(s)
Kawasaki A, Sada K-e, Kusumawati PA, Hirano F, Kobayashi S, Nagasaka K, Sugihara T, Ono N, Fujimoto T, Kusaoi M, Tamura N, Kusanagi Y, Itoh K, Sumida T, Yamagata K, Hashimoto H, Makino H, Arimura Y, Harigai M, Tsuchiya N
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Journal Title
Frontiers in Immunology
Volume: 14
Pages: 1119064-1119064
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Association of HLA class II alleles with risk of relapse in myeloperoxidase-antineutrophil cytoplasmic antibody positive vasculitis in the Japanese population. [PREPRINT]2022
Author(s)
Kawasaki A, Sada K-e, Kusumawati PA, Hirano F, Kobayashi S, Nagasaka K, Sugihara T, Ono N, Fujimoto T, Kusaoi M, Tamura N, Kusanagi Y, Itoh K, Sumida T, Yamagata K, Hashimoto H, Makino H, Arimura Y, Harigai M, Tsuchiya N.
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Journal Title
DOI
Related Report
Open Access
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[Presentation] 好酸球性多発血管炎性肉芽腫症とHLA-DRB1およびTSLPバリアントの関連.2022
Author(s)
川﨑綾, 佐田憲映, 草薙恭圭, 伊藤健司, 小野伸之, 平野史生, 小林茂人, 長坂憲治, 杉原毅彦, 藤本隆, 草生真規雄, 田村直人, 山縣邦弘, 住田孝之, 尾崎承一, 橋本博史, 槇野博史, 有村義宏, 針谷正祥, 土屋尚之.
Organizer
第66回日本リウマチ学会総会・学術集会
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