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Integration of viral genome in nails.

Research Project

Project/Area Number 21K08517
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 54030:Infectious disease medicine-related
Research InstitutionToho University

Principal Investigator

小松 陽樹  東邦大学, 医学部, 准教授 (80424711)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 星野 廣樹  東邦大学, 医学部, 助教 (90810531)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2022-03-31
Project Status Discontinued (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
KeywordsB型肝炎ウイルス / 爪 / Integration / DNA / ヘルペスウイルス / 次世代シークエンサー / ターゲットシークエンス / ウイルス / B型肝炎 / 次世代シークエシング
Outline of Research at the Start

本研究の目的は、爪と血液細胞においてB型肝炎ウイルス(HBV)及びヒトヘルペスウイルス科ウイルスのintegrationの有無を明らかにすることである。HBVキャリアを対象として、rea-time PCR, target-capture次世代シークエンシング、サンガーシークエンスを実施し、爪と血液細胞におけるウイルスのintegration siteを同定する。爪や血液細胞におけるintegrationを詳細に調べることにより、感染症におけるintegrationの意義が明らかになる。また、本研究は種を越えて爪を有する動物でのウイルス感染症への応用も期待できる。

Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、爪と血液細胞においてB型肝炎ウイルス(HBV)及びヒトヘルペスウイルス科ウイルスのヒトゲノムへのintegrationの有無を明らかにすることである。HBVキャリアを対象として、rea-time PCR, target-capture次世代シークエンス、サンガーシークエンスを実施し、爪と血液細胞におけるウイルスのintegration siteの同定を試みた。HBVキャリア60人(年齢::median 15歳、HBeAg陽性:47人)から爪を採取した。爪細胞においてPCR法にてHBV DNAは37人(61.7%)から検出された(Nail HBV DNA levels: median 4.3 Log copies/mL)。さらに、ヘルペス科ウイルスに属する①HSV-1,②HSV-2,③VZV, ④EBV,⑤CMV,⑥HHV-6,⑦HHV-7の7種類のウイルスDNAをPCR法にて測定し、HHV-7 DNAのみが3人(5.0%)から検出された(HHV-7 DNA level: median 2.8 Log copies/mL)。次に、ウイルスゲノムのintegrationの有無を調べるためHBV DNA陽性かつHHV-7DNA陽性の血液細胞と爪細胞を用いて、target-capture 次世代シークエンシングを行った。次世代シークエンシングでは血液及び爪において、HBVとHHV-7のintegration siteを検出することができた。しかし、サンガーシークエンスでintegration siteを再確認できたのは、血液細胞におけるHBVのintegration siteのみであった。【結論】血液細胞へのHBVのintegrationは確認できたが、血液細胞へのHHV-7と爪細胞へのウイルスゲノムのintegrationは確認することができなかった。

Report

(1 results)
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (1 results)

All 2022

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results)

  • [Journal Article] Hepatitis B virus DNA in the fingernails and hair of children with acute hepatitis B2022

    • Author(s)
      Harada Takumi、Komatsu Haruki、Inui Ayano、Tsunoda Tomoyuki、Hashimoto Takuji、Fujisawa Tomoo
    • Journal Title

      Journal of Infection and Chemotherapy

      Volume: 28 Issue: 1 Pages: 82-86

    • DOI

      10.1016/j.jiac.2021.08.014

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2022-12-28  

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