Integration of viral genome in nails.

Research Project

Project/Area Number	21K08517
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 54030:Infectious disease medicine-related
Research Institution	Toho University
Principal Investigator	小松陽樹東邦大学, 医学部, 准教授 (80424711)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	星野廣樹東邦大学, 医学部, 助教 (90810531)
Project Period (FY)	2021-04-01 – 2022-03-31
Project Status	Discontinued (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help	¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000) Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000) Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000) Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Keywords	B型肝炎ウイルス / 爪 / Integration / DNA / ヘルペスウイルス / 次世代シークエンサー / ターゲットシークエンス / ウイルス / B型肝炎 / 次世代シークエシング
Outline of Research at the Start	本研究の目的は、爪と血液細胞においてB型肝炎ウイルス（HBV）及びヒトヘルペスウイルス科ウイルスのintegrationの有無を明らかにすることである。HBVキャリアを対象として、rea-time PCR, target-capture次世代シークエンシング、サンガーシークエンスを実施し、爪と血液細胞におけるウイルスのintegration siteを同定する。爪や血液細胞におけるintegrationを詳細に調べることにより、感染症におけるintegrationの意義が明らかになる。また、本研究は種を越えて爪を有する動物でのウイルス感染症への応用も期待できる。
Outline of Annual Research Achievements	本研究の目的は、爪と血液細胞においてB型肝炎ウイルス（HBV）及びヒトヘルペスウイルス科ウイルスのヒトゲノムへのintegrationの有無を明らかにすることである。HBVキャリアを対象として、rea-time PCR, target-capture次世代シークエンス、サンガーシークエンスを実施し、爪と血液細胞におけるウイルスのintegration siteの同定を試みた。HBVキャリア60人（年齢:：median 15歳、HBeAg陽性：47人）から爪を採取した。爪細胞においてPCR法にてHBV DNAは37人（61.7％）から検出された（Nail HBV DNA levels: median 4.3 Log copies/mL)。さらに、ヘルペス科ウイルスに属する①HSV-1,②HSV-2,③VZV, ④EBV,⑤CMV,⑥HHV-6,⑦HHV-7の7種類のウイルスDNAをPCR法にて測定し、HHV-7 DNAのみが3人（5.0％）から検出された（HHV-7 DNA level: median 2.8 Log copies/mL）。次に、ウイルスゲノムのintegrationの有無を調べるためHBV DNA陽性かつHHV-７DNA陽性の血液細胞と爪細胞を用いて、target-capture 次世代シークエンシングを行った。次世代シークエンシングでは血液及び爪において、HBVとHHV-7のintegration siteを検出することができた。しかし、サンガーシークエンスでintegration siteを再確認できたのは、血液細胞におけるHBVのintegration siteのみであった。【結論】血液細胞へのHBVのintegrationは確認できたが、血液細胞へのHHV-7と爪細胞へのウイルスゲノムのintegrationは確認することができなかった。