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Genomics analysis of immune microenvironmental changes in hepatocarcinogenesis after cure of hepatitis C

Research Project

Project/Area Number 21K08745
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 55020:Digestive surgery-related
Research InstitutionNational Hospital Organization, Kyushu Cancer Center

Principal Investigator

Sugimachi Keishi  独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター), その他 部局等, 肝胆膵外科部長 (90452763)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 間野 洋平  独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター), その他部局等, 肝胆膵外科医師 (10792244)
増田 隆明  九州大学, 大学病院, 准教授 (50463493)
荒木 啓充  九州大学, 経済学研究院, 助教 (60572823)
吉住 朋晴  九州大学, 医学研究院, 教授 (80363373)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywords肝細胞癌 / エピゲノム / 転写因子 / C型肝炎治癒 / C型肝炎 / メチル化シークエンス / mRNAシークエンス / ウイルス学的著効 / 免疫微小環境 / ゲノミクス / 肝がん
Outline of Research at the Start

肝がんは予後不良の固形悪性腫瘍である。近年は抗ウイルス治療により発癌原因となるC型肝炎ウイルス(HCV)を消失させることが可能になった一方で肝炎治癒後に発生する肝がんが増加しており改めて肝発癌機序の根本的解明が求められている。近年、肝発癌機序に宿主肝の免疫環境の変化が関わっていることが示唆されてきたが詳細は未だに分かっていない。本研究の目的は、ゲノミクスによる腫瘍の免疫微小環境の解析によりC型肝炎治癒後に発生する肝がんの発癌機序を解明し、さらに肝がんに対する免疫療法の作用機序や治療効果予測に関するバイオマーカーを同定することである。

Outline of Final Research Achievements

We conducted research aimed at elucidating the molecular mechanisms underlying the development of hepatocellular carcinoma (HCC) after treatment for hepatitis C virus (HCV) infection. Analyses were performed based on whole-genome methylation sequencing and RNA sequencing. We obtained important insights that epigenome abnormalities in the HCC caused by HCV infection are retained and remained unnormalized even after virological cure of HCV by antiviral therapy. Furthermore, through analysis of transcription factors and their target genes, we revealed that sustained epigenetic abnormalities induce abnormalities in apoptosis and inflammatory signaling pathways, which are associated with the development of HCC.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究により、C型肝炎が治癒した後もC型肝炎ウイルス(HCV)によって引き起こされたメチル化異常が肝臓で保持されているという重要な知見を得ることができた。さらに、HCV排除後も維持されているメチル化・エピゲノム異常に起因する転写因子と標的遺伝子の発現変化が、SVR肝発癌に関与していることが分かった。本研究成果によりメチル化変動転写因子は、肝癌発生の予測や早期発見のバイオマーカーとして有望であると考えられた。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2023 2022

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Convergent genomic diversity and novel BCAA metabolism in intrahepatic cholangiocarcinoma2023

    • Author(s)
      Kitagawa A, Osawa T,Noda M,Kobayashi Y, Aki S,Nakano Y,Saito T,Shimizu D,Komatsu H,Sugaya M,Takahashi J,...Mimori K.
    • Journal Title

      Br J Cancer

      Volume: - Issue: 12 Pages: 22068-22068

    • DOI

      10.1038/s41416-023-02256-4

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Persistent epigenetic alterations in transcription factors after a sustained virological response in hepatocellular carcinoma2022

    • Author(s)
      Sugimachi Keishi、Araki Hiromitsu、Saito Hideyuki、Masuda Takaaki、Miura Fumihito、Inoue Kentaro、Shimagaki Tomonari、Mano Yohei、Iguchi Tomohiro、Morita Masaru、Toh Yasushi、Yoshizumi Tomoharu、Ito Takashi、Mimori Koshi
    • Journal Title

      JGH Open

      Volume: 6 Issue: 12 Pages: 854-863

    • DOI

      10.1002/jgh3.12833

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] C型肝炎治癒後肝癌の転写因子-標的遺伝子の網羅的解析2023

    • Author(s)
      杉町圭史、島垣智成、冨野高広、大西惠美、増田隆明、森田勝、三森功士、藤也寸志
    • Organizer
      第34回日本消化器癌発生学会総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Sustained epigenetic carcinogenic alteration in hepatocellular carcinoma arising on the liver after viral eradication2023

    • Author(s)
      Keishi Sugimachi, Tomonari Shimagaki, Yohei Mano, Emi Onishi, Masaru Morita, Yasushi Toh, Koshi Mimori
    • Organizer
      Society of Surgical Oncology 2023 International Conference on Surgical Cancer Care
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 全ゲノム的メチローム・トランスクリプトーム解析によるSVR後肝発癌関連転写因子の同定2022

    • Author(s)
      杉町圭史、間野洋平、島垣智成、大西惠美、増田隆明、藤本禎明、上原英雄、中島雄一郎、杉山雅彦、山本学、森田勝、三森功士、藤也寸志
    • Organizer
      第122回日本外科学会定期学術集会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

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Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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