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Development of high-resolution hemodynamic biomarker calculation method for cerebral aneurysms using 4D-Flow and deep learning

Research Project

Project/Area Number 21K09175
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 56010:Neurosurgery-related
Research InstitutionSeirei Christopher University (2023)
Nagoya University (2021-2022)

Principal Investigator

Isoda Haruo  聖隷クリストファー大学, リハビリテーション科学研究科, 臨床教授 (40223060)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 平野 祥之  名古屋大学, 医学系研究科(保健), 准教授 (00423129)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywordsartificial intelligence / deep learning / noise reduction / 4D Flow MRI / intracranial aneurysm / fluid dynamics / hemodynamics / 人工知能 / 深層学習 / ノイズ低減 / 脳動脈瘤 / 磁気共鳴流体解析 / 計算流体解析 / ノイズ軽減 / 4D Flow / 高分解能 / 血流動態
Outline of Research at the Start

血流動態(壁剪断応力など)が血管病変発生・成長に大きな役割を担い、脳動脈瘤の発生・成長・破裂のリスクを予測するバイオマーカーになり得る。磁気共鳴流体解析 (MRFD)はヒトから直接データを収集できる利点はあるが、空間分解能と時間分解能が低い。一方、計算流体解析 (CFD)は高時間分解能・高空間分解能であるが、処理時間や計算時間が掛かる欠点があり、臨床応用しにくい。そこで、磁気共鳴画像データを入力データ、CFDの結果を正解データとする教師データを学習させ、臨床現場で直ちにCFDと同等の血流解析結果(バイオマーカーの数値も含め)が得られる「深層学習を用いた人工知能のモデル」を構築することを目指す。

Outline of Final Research Achievements

Teaching data were prepared using the three dimensional and three directional velocity data in cerebral arteries from computational fluid dynamics (CFD) results based on magnetic resonance fluid dynamics (MRFD) results of cerebral arteries containing aneurysms as ground truth data and the data obtained by adding noise that mimics MRFD noise to these CFD data as input data. Prioritising accuracy improvement through noise reduction over higher resolution, the aforementioned teaching data were trained on the Win5-RB model, and deep learning models for noise reduction were developed for 'spatial 2D', 'spatial 2D + time', 'spatial 3D' and 'spatial 3D + time'. The degree of noise reduction was evaluated using the angular similarity index of the velocity vectors, magnitude similarity index of the velocity vectors, velocity vector fields, streamlines and wall shear stress, with the 'spatial 2D + time' noise reduction model being the best.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

脳動脈瘤の発生・成長・破裂に脳動脈瘤の血流動態(壁剪断応力など)が大きな役割を担っており、脳動脈瘤のリスクを予測するバイオマーカーになり得る。ヒトの血流解析には磁気共鳴流体解析(MRFD)と計算流体解析(CFD)がある。MRFDはヒトから直接データを収集できる利点はあるが、ノイズによる精度低下・低空間分解能・低時間分解能の欠点がある。一方、CFDは高時間分解能・高空間分解能・高精度であるが、処理時間や計算時間(3時間から1日)が掛かる欠点があり、臨床応用しにくい。本研究のように、深層学習モデルでMRFDデータのノイズ除去を行い、CFDと同等の精度が即座に得られれば、臨床現場で有用と考えられる。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2023 2022 2021

All Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Presentation] 3次元深層学習モデルの磁気共鳴流体解析のノイズ低減 ~時間情報の有無によるノイズ除去効果の違い~2023

    • Author(s)
      小田凌太郎, 礒田治夫, 小山修司, 平野祥之, 中島美来, 寺田理希, 牛尾貴輔, 五島聡
    • Organizer
      第5回 4D Flow研究会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Differences of Noise Reduction in Magnetic Resonance Fluid Dynamics of Intracranial Aneurysms with the “Spatial 2D with time” and “Spatial 3D without time” 3D Deep Learning Models2023

    • Author(s)
      Ryotaro Oda, Haruo Isoda, Shuji Koyama, Yoshiyuki Hirano, Miku Nakashima, Masaki Terada, Takasuke Ushio, Satoshi Goshima
    • Organizer
      Society for Magnetic Resonance Angiography 2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 3次元深層学習モデルの磁気共鳴流体解析ノイズ低減 --時間情報の有無によるノイズ除去効果の違い2023

    • Author(s)
      小田凌太郎, 礒田治夫, 小山修司, 平野祥之, 中島美来, 寺田理希, 牛尾貴輔, 五島聡
    • Organizer
      第53回 日本神経放射線学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 深層学習を用いた磁気共鳴流体解析のノイズ低減2022

    • Author(s)
      中島美来, 礒田治夫, 平野祥之
    • Organizer
      第45回 日本バイオレオロジー学会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Noise Reduction in Magnetic Resonance Fluid Dynamics Using Deep learning2022

    • Author(s)
      Miku Nakashima, Haruo Isoda, Yoshiyuki Hirano
    • Organizer
      Society for Magnetic Resonance Angiography
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 深層学習を用いた磁気共鳴流体解析のノイズ低減2022

    • Author(s)
      中島美来, 礒田治夫, 平野祥之
    • Organizer
      第4回4D-Flow研究会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 深暦学習を用いた磁気共嗚流体解析のノイズ低減 ー trigger time に着目した基礎的検討ー2021

    • Author(s)
      中島美来, 礒田治夫,蓑島啓史,平野祥之,福山篤司,加藤 裕,市川和茂,水野 崇
    • Organizer
      第3回4D-Flow研究会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

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Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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