Establishment of ctDNA monitoring system in HNSCC
| Project/Area Number |
21K09561
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 56050:Otorhinolaryngology-related
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
古後 龍之介 九州大学, 大学病院, 助教 (90529885)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
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| Keywords | ctDNA / liquid biopsy / 頭頸部癌 |
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| Outline of Research at the Start |
血液中で検出可能な腫瘍由来の変異遺伝子はctDNAと呼ばれ、治療効果や再発のモニタリングに有用と考えられている。頭頸部癌では確立された腫瘍マーカーはなく、新規のバイオマーカーの開発が望まれている。我々は腫瘍マーカーと同様に血液中で検出可能なctDNAに着目した。症例特異的な遺伝子変異を次世代シーケンサーを用いて同定し、この変異遺伝子をctDNA候補遺伝子とし、digital PCRを用いて、血液中で検出、定量する。本研究ではctDNAモニタリングが、治療効果や再発の予測に有用かどうかを検討する。また、臨床応用を目指し、ctDNAの候補遺伝子の選定に最適な手法を検討する。
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| Outline of Annual Research Achievements |
令和４年度は新たに10例の頭頸部扁平上皮癌をSCC panel解析に提出し、ctDNAモニタリングを追加した。さらに9例をSCC panel解析に提出中であり、ctDNA候補遺伝子を検討している。扁平上皮癌における本手法はTP53変異を有する症例（8例/10例）では有用なバイオマーカーになることがわかった。現在、再発転移頭頸部癌に対して、薬物療法中の症例についてもctDNAモニタリングを施行し、画像検査より早く、治療効果が予測可能かどうかを検討している。
また、扁平上皮癌以外にもRET遺伝子変異陽性甲状腺髄様癌症例1例とHER2陽性唾液腺癌症例2例についてもdigital PCRを用いて、血漿中RET変異遺伝子の検出、HER2遺伝子の定量を行った。RET変異遺伝子は血漿中でも検出可能であった。HER2は血漿中で検出可能であったが、HER2 copy数は病勢を反映していなかった。血漿中のHER2の定量には有用なreference geneの選定などが今後必要になると思われる。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
これまで解析してきた頭頸部扁平上皮癌26例に加えて、令和４年度は12例のSCC panelによる変異解析とctDNAモニタリングを追加した。さらに9例のSCC panel解析を追加している。扁平上皮癌以外にもHER2陽性唾液腺癌やRET遺伝子変異陽性甲状腺髄様癌についても、HER2定量やRET変異の検出をdigital PCRを用いて行っている。症例数も順調に増加してきており、研究計画は概ね順調に進展している。
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| Strategy for Future Research Activity |
再発転移頭頸部癌に対して薬物療法を施行している症例についても研究を拡大している。ctDNAのturn around timeの短い性質を生かして、画像検査より早期に治療効果の予測が可能かどうかを検討したい。また、扁平上皮癌以外の癌腫のうち特定の遺伝子変異や融合遺伝子を有する頭頸部癌についてもdigital PCRを用いたctDNAモニタリングの有用性を証明したい。
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Report
(2 results)
Research Products
(4 results)
