• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Molecular pathology of infectious keratitis utilizing nucleic acid sequencing and quantification

Research Project

Project/Area Number 21K09720
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 56060:Ophthalmology-related
Research InstitutionTottori University

Principal Investigator

Inoue Yoshitsugu  鳥取大学, 医学部, プロジェクト研究員 (10213183)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 宮崎 大  鳥取大学, 医学部, 教授 (30346358)
春木 智子  鳥取大学, 医学部附属病院, 助教 (90838153)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywords感染性角膜炎 / 単純ヘルペスウイルス / 角膜潰瘍 / 眼感染症 / RNA網羅解析
Outline of Research at the Start

眼感染症におけるホスト側の反応を検出することによって、感染・非感染の鑑別や起因微生物の同定ができないかを検討するため、患者病巣(結膜ぬぐい液、角膜擦過物、前房水、硝子体液)から得られた試料を用いて次世代シークエンサーを用いたRNA(mRNA及びmiRNA)の網羅的解析を行って検討する。更に網羅的解析により同定されたRNA種のreal-time RT-PCRによる評価を行う。得られたデータをAIを用いて、教師あり機械学習を行い、これにより非感染、感染の分類及び起因微生物の分類、が可能な発現プロファイル及びネットワーク特徴量を同定する。

Outline of Final Research Achievements

In order to better diagnose and manage infectious keratitis, we have attempted to verify the pathogenesis of the disease by molecular biological methods from the perspective of pathogen and host reaction. For each pathogen, we explored and optimized identification methods using PCR-based sequencing. In terms of pathogenesis, we clarified the relationship between molecular pathology, clinical features, and prognosis, especially for herpes simplex. In addition, after optimizing the comprehensive RNA analysis of clinical specimens, we searched for molecular pathways that are characteristically activated in various pathogens and that can be used to select the initiation of steroid therapy.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

角膜混濁は失明原因の上位を占めており、感染性角膜炎はその重要な原因となる。適切な診断及び治療の選択が視力予後の改善に必須である。一方、いかに診断し、治療するのかに関して十分な指針は策定されていない。そこで、原因病原体の同定手法の確立と評価、さらには分子病態の探索を試みた。これにより、より妥当性のある診断及びマネージメント手法の設計に資する分子病態を明らかにした。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2024 2023

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] Effect of atopic conditions on development and recurrences of infectious keratitis2024

    • Author(s)
      Yutaka Omatsu , Yumiko Shimizu , Tomoko Haruki , Yoshitsugu Inoue , Dai Miyazaki.
    • Journal Title

      Allergology International

      Volume: 73 Issue: 3 Pages: 445-452

    • DOI

      10.1016/j.alit.2024.01.008

    • ISSN
      1323-8930, 1440-1592
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Profiling miRNAs in tear extracellular vesicles: a pilot study with implications for diagnosis of ocular diseases2023

    • Author(s)
      Torimura Airu、Kanei Saki、Shimizu Yumiko、Baba Takashi、Uotani Ryu、Sasaki Shin-ichi、Nagase Daisuke、Inoue Yoshitsugu、Ochiya Takahiro、Miyazaki Dai
    • Journal Title

      Japanese Journal of Ophthalmology

      Volume: 68 Issue: 1 Pages: 70-81

    • DOI

      10.1007/s10384-023-01028-0

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 角膜ヘルペス再発に対する気温因子の影響2024

    • Author(s)
      大松 寛、清水由美子、春木智子、井上幸次、宮﨑 大
    • Organizer
      第68回山陰眼科集談会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 角膜ヘルペス再発における気象因子の影響2023

    • Author(s)
      大松 寛、清水由美子、春木智子、宮﨑 大、井上幸次
    • Organizer
      第67回山陰眼科集談会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 単純ヘルペスウイルス角膜炎の再発における気候因子の影響2023

    • Author(s)
      大松 寛、清水由美子、春木智子、井上幸次、宮﨑 大
    • Organizer
      フォーサム2023大阪 (第59回日本眼感染症学会・第56回日本眼炎症学会・第65回日本コンタクトレンズ学会総会・第11回日本涙道・涙液学会総会)
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] アレルギー関連疾患を有する症例におけるステロイド点眼と上皮型角膜ヘルペス再発の関連性2023

    • Author(s)
      大松 寛、清水由美子、春木智子、井上幸次、宮﨑 大
    • Organizer
      第6回日本眼科アレルギー学会学術集会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] アトピー性皮膚炎における感染性角膜炎の病原体の特徴2023

    • Author(s)
      大松 寛、清水由美子、春木智子、井上幸次、宮﨑 大
    • Organizer
      第72回日本アレルギー学会学術大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi