The elucidation of carcinogenesis, metastasis gene and development of non-invasive treatment of sebaceous gland carcinoma with the next-generation sequencer
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21K09726
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 56060:Ophthalmology-related
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| Research Institution | Kyoto Prefectural University of Medicine |
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Principal Investigator |
渡辺 彰英 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 講師 (80516188)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
中山 知倫 京都府立医科大学, 医学部附属病院, 専攻医 (00769325)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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| Keywords | 脂腺癌 / nodular type / diffuse type / 網羅的遺伝子解析 / 遺伝子変異 / 次世代シークエンサー / TP53 / ZNF750 / 瞼板 / dissuse type / エクソーム解析 / トランスクリプトーム解析 / 核酸抽出法 / 腫瘍組織 / 次世代シーケンサー / 遺伝子解析 / 発癌・転移遺伝子 / 非観血的治療 |
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| Outline of Research at the Start |
脂腺癌は転移や局所再発のリスクが比較的高い眼瞼に好発する悪性腫瘍である。治療は外科的切除が第一選択であり、有効な内科的治療法は存在しない。また、脂腺癌には臨床像の違いや人種差があることが知られているが、その原因は未だ不明である。
本研究では、次世代シーケンサーを用いて脂腺癌の遺伝子解析を行い、発癌、増殖及び転移に関わる細胞内伝達機構を明らかにし、脂腺癌の実臨床における予後推測および非観血的治療法の可能性を探る。
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、①次世代シークエンサーを用いた脂腺癌の網羅的遺伝子解析、②臨床病型との照合、人種差の原因解明、③発癌、増殖及び転移に関わる細胞内伝達機構を明らかにし、予後予測および内科的治療法につなげることが目的である。
咋年度までに、総計脂腺癌15症例から各々正常及び癌組織の核酸を抽出し、次世代シークエンスが可能な品質のRNA、DNAを取得した。
本年度は、抽出した15症例分のDNAから2回に分けて取得したエキソームデータを順次解析し、がん特異的な変異の同定のために各症例の腫瘍と正常組織をpair単位で比較する検出作業を行なった。まずは先行してデータの取得をした6症例を詳細に調査した結果、代表的ながん抑制遺伝子のTP53上の変異を5症例、脂腺癌との関連の報告例があるZNF750遺伝子上の変異を4症例で認めた。TP53変異ではframeshift変異が1例、ナンセンス変異が１例、同義置換が1例、非同義置換が2例であった。一方、ZNF750変異では、frameshift変異が1例、ナンセンス変異が2例、非同義置換が１例であった。現在、残る9症例でも同様の解析を行っており、上記以外にも既報情報やがんパネル採用遺伝子に加え、新規関連遺伝子の探索を進めている。また、データ取得済みの15症例のうち4症例がアジア人には少ないdiffuseタイプの脂腺癌であり、他にも性別、年齢などの臨床像を加味した腫瘍組織、正常組織のpair単位での比較を行うことにより、脂腺癌特異的な遺伝子の発現や変異の同定、及び関連するpathwayを絞り込む各種解析などを検討を重ねながら進めている。
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Report
(3 results)
Research Products
(9 results)
