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メタ16S解析を用いた帝王切開出生児の口腔内細菌叢獲得機序の解明

Research Project

Project/Area Number 21K10266
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 57080:Social dentistry-related
Research InstitutionThe Nippon Dental University

Principal Investigator

佐野 拓人  日本歯科大学, 新潟生命歯学部, 助教 (90880592)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 佐藤 拓一  新潟大学, 医歯学系, 教授 (10303132)
岡田 康男  日本歯科大学, 新潟生命歯学部, 教授 (40267266)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2021: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Keywords口腔内細菌叢 / 16S rRNA / 新生児 / メタゲノム / 帝王切開
Outline of Research at the Start

帝王切開にて出生した乳児は、口腔内細菌叢に構成異常(dysbiosis)が生じることが報告されている。新生児期に獲得する細菌叢は、児の免疫系や代謝系の発達に重大な影響を与える一因であると認識されている。帝王切開による分娩は、初産高齢化や医療技術の進歩等により先進諸国では増加傾向にあるが、分娩形式(自然分娩と帝王切開)が口腔内細菌叢形成過程へ与える影響の詳細は分かっていない。本研究の目的は、新生児の口腔内細菌叢の細菌種構成と細菌量の変動を経時的に解析し、新生児口腔dysbiosis発生過程、ひいては新生児期における正常な口腔内細菌叢形成とは何かを探究することである。

Outline of Annual Research Achievements

本研究は分娩形式(自然分娩・帝王切開)に関連した新生児口腔dysbiosisの発生プロセス及び、新生児の正常な口腔内細菌叢形成とは何かを明らかにするために、経時的に新生児口腔内細菌を質的(細菌叢構成)かつ量的(細菌量変動)に解析するものである。出生後3日から7日の新生児から滅菌スワブを用いて唾液を採取し試料とした。試料を緩衝液に懸濁し、ボルテックスで分散・均一化後、連続10倍希釈し、CDC血液寒天培地に接種し、好気および嫌気環境下で細菌培養を行った。培養により得られた細菌のコロニー数から新生児唾液中の細菌量(CFU/mL)を算出した。加えて、ヒト母乳には特有の細菌叢が存在していることが近年の研究で明らかになっており、新生児口腔内細菌叢形成過程にも影響を与えていることが推測される。このことから本研究では、新生児の口腔内擦過サンプルに加えて、滅菌搾乳器で搾乳した母乳も試料とし、母乳中の細菌の量的および質的解析も行っている。
新生児の口腔内擦過サンプルから得られた細菌量は、帝王切開児で平均(2.9 ± 2.7)×10の7乗 CFU/mL、自然分娩児では、平均(1.5 ± 3.2)×10の6乗 CFU/mLであり、帝王切開児で多い傾向にあった。母乳中の細菌量は、平均(1.4 ± 1.6) × 10の5乗 CFU/mLであった。細菌叢構成は、帝王切開児の口腔内細菌叢では、自然分娩児に比べて、多様性が低く、皮膚の常在細菌(Staphylococcus epidermidis等)と一般的な口腔内常在細菌(Streptococcus属)が共に優勢菌となっている傾向にあった。搾乳された母乳の細菌叢構成は、Staphylococcus属、Cutibacterium属、Streptococcus属が優勢菌であった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

細菌叢構成解析結果に関して、一部データの再検討を行う必要が生じたため、研究計画にやや遅れが生じた。

Strategy for Future Research Activity

本年度に引き続き得られたデータのインフォマティクス解析を進めていく予定である。

Report

(3 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2023 2022 2021

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 6 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] The effect of the formalin-fixed paraffin-embedded process on salivary microbiota profiling2023

    • Author(s)
      SANO Hiroto、SATO Takuichi、KANRI Yoriaki、ONO Junya、OKADA Yasuo
    • Journal Title

      Biomedical Research

      Volume: 44 Issue: 3 Pages: 117-126

    • DOI

      10.2220/biomedres.44.117

    • ISSN
      0388-6107, 1880-313X
    • Year and Date
      2023-06-01
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Profiling of the microbiota in the remaining sports drink and orange juice in plastic bottles after direct drinking2022

    • Author(s)
      Kawachi Miho、Wakui Anna、Kaku Nagara、Takahashi Nanase、Maruyama Shingo、Washio Jumpei、Abiko Yuki、Mayanagi Gen、Tanaka Kaori、Takahashi Nobuhiro、Sato Takuichi
    • Journal Title

      Journal of Oral Biosciences

      Volume: 64 Issue: 4 Pages: 437-444

    • DOI

      10.1016/j.job.2022.08.003

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Profiling of the microbiota of breast milk before and after feeding with an artificial nipple2022

    • Author(s)
      Sano Hiroto、Wakui Anna、Kawachi Miho、Maruyama Shingo、Moriyama Sachie、Nishikata Mayumi、Washio Jumpei、Abiko Yuki、Mayanagi Gen、Sakashita Reiko、Tanaka Kaori、Takahashi Nobuhiro、Sato Takuichi
    • Journal Title

      Journal of Oral Biosciences

      Volume: 64 Issue: 4 Pages: 431-436

    • DOI

      10.1016/j.job.2022.09.004

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Microbiota profiles on the surface of non-woven fabric masks after wearing2022

    • Author(s)
      Maruyama Shingo、Sano Hiroto、Wakui Anna、Kawachi Miho、Kaku Nagara、Takahashi Nanase、Miyazawa Misato、Abe Takashi、Sato Aya、Washio Jumpei、Abiko Yuki、Mayanagi Gen、Tanaka Kaori、Takahashi Nobuhiro、Sato Takuichi
    • Journal Title

      Journal of Oral Biosciences

      Volume: 64 Issue: 3 Pages: 376-379

    • DOI

      10.1016/j.job.2022.07.002

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Profiling of microbiota at the mouth of bottles and in remaining tea after drinking directly from plastic bottles of tea2021

    • Author(s)
      Wakui A*, Sano H*, Hirabuki Y*, Kawachi M, Aida A, Washio J, Abiko Y, Mayanagi G, Yamaki K, Tanaka K, Takahashi N, Sato T
    • Journal Title

      Dentistry Journal

      Volume: 9 Issue: 6 Pages: 58-58

    • DOI

      10.3390/dj9060058

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Profiling system of oral microbiota utilizing polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism analysis2021

    • Author(s)
      Sano H, Wakui A, Kawachi M, Washio J, Abiko Y, Mayanagi G, Yamaki K, Tanaka K, Takahashi N, Sato T
    • Journal Title

      Journal of Oral Biosciences

      Volume: 63 Issue: 3 Pages: 292-297

    • DOI

      10.1016/j.job.2021.05.003

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Profiling of the microbiota in the remaining green tea of the plastic bottles2023

    • Author(s)
      Kawachi M, Wakui A, Sano H, Abiko Y, Washio J, Takahashi N, Sato T
    • Organizer
      The 65th Annual Meeting of Japanese Association for Oral Biology
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Bacterial characterization of breast milk before/after with artificial nipple feeding2023

    • Author(s)
      Wakui A, Kawachi M, Sano H, Nishikata M, Washio J, Sakashita R, Sato T
    • Organizer
      The 52nd Annual Meeting & Exhibition of the AADOCR / 47th Annual Meeting of the CADR
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 母乳と新生児口腔細菌叢との連関:網羅的培養による細菌学的アプローチ2022

    • Author(s)
      涌井杏奈 , 河内美帆 , 佐野拓人 , 丸山伸吾 , 佐藤拓一
    • Organizer
      第75回日本細菌学会関西支部総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 使用済みマスクおよび頬部皮膚に付着・生息する細菌のプロファイリング2022

    • Author(s)
      丸山伸吾, 佐野拓人, 佐藤拓一
    • Organizer
      第33回日本臨床微生物学会総会・学術集会
    • Related Report
      2022 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2024-12-25  

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