Molecular epidemiological study of Gram-positive cocci in Japan regarding novel resistance mechanisms to linezolid
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21K10401
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 58020:Hygiene and public health-related: including laboratory approach
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| Research Institution | Sapporo Medical University |
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Principal Investigator |
アウン メイジソウ 札幌医科大学, 医学部, 講師 (10749584)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
小林 宣道 札幌医科大学, 医学部, 教授 (80186759)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
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| Keywords | グラム陽性球菌 / リネゾリド耐性 / 分子疫学 |
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| Outline of Research at the Start |
リネゾリド（linezolid）はMRSA、VRE等の感染症に有効な薬剤の一つとして世界的に広く使用されているが、近年新規耐性遺伝子（optrA、cfr）を獲得したリネゾリド耐性菌が世界各国で報告されている。本研究では、日本において各種臨床材料から分離されるMRSA、腸球菌等を対象として新規耐性遺伝子（optrA、cfr）の存在および分布状況を解析する。合わせてリネゾリド耐性菌の菌種、各種薬剤感受性、病原因子の分布のほか、疾患・患者属性等の情報、遺伝子型、薬剤耐性の分子機序およびゲノム解析による分子疫学的情報をもとに、耐性菌株の特徴と耐性の機序を明らかにする。
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| Outline of Annual Research Achievements |
リネゾリド（linezolid）はMRSA、VRE等の感染症に有効な薬剤の一つとして世界的に広く使用されているが、近年新規耐性遺伝子（optrA、cfr）を獲得したリネゾリド耐性菌の報告が増えている。本研究では、日本において各種臨床材料から分離されるグラム陽性球菌を対象として耐性菌の分布状況と新規耐性遺伝子・耐性機序を解析する。合わせて遺伝子型、病原因子の分布を含め、疫学的特徴を明らかにすることを目的としている。今年度は北海道において分離される腸球菌を対象とし、薬剤感受性の評価およびoptrA、cfrの検索、病原因子の検出等を行った。2022年4月から4ヵ月間、北海道内の医療機関における臨床材料から分離された腸球菌480株（E. faecalis 426株、E. faecium 54株）を対象として解析を行った。E. faecalisの遺伝子型ではST16, ST179が、E. faeciumではCC(clonal complex)17が多かった。E. faecalisでは約半数がマクロライド耐性で耐性遺伝子erm(B)を、13％がゲンタマイシン高度耐性を示した。7％がキノロン耐性を示し、GyrA/ParCにおけるキノロン耐性関連変異が認められた。E. faecalisの1株がリネゾリド耐性であり、optrA遺伝子が検出され、その検出率は0.2％と算出された。この株は高齢の外来患者（尿検体）から分離され、他にも薬剤耐性遺伝子を有し多剤耐性を示していた。本菌株はST480に属していたが、この遺伝子型はアジア（中国、韓国）、ヨーロッパでも報告がある。optrA遺伝子のST480における検出は本邦では初めてであり、optrA保有ST480 E. faecalisの日本への拡がりが示唆された。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
腸球菌に対しリネゾリド耐性遺伝子optrAの分布を調査した結果、optrAを日本で初めてST480のE. faecalisにおいて検出し、腸球菌臨床分離株における分布率を明らかにすることができたため。
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| Strategy for Future Research Activity |
研究代表者の教室において様々な材料（臨床検体、食品、健康保菌者当）から分離、保存されているブドウ球菌のリネゾリド感受性をMICにより評価し、MICが増高している株、明らかな耐性株について耐性遺伝子を検索する。またoptrA保有腸球菌の全ゲノムを解析し、optrA保有菌株の特徴を明らかにする。
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Report
(2 results)
Research Products
(9 results)
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[Journal Article] Antimicrobial Resistance, Virulence Factors, and Genotypes of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium Clinical Isolates in Northern Japan: Identification of optrA in ST480 E. faecalis.2023
Author(s)
Aung MS, Urushibara N, Kawaguchiya M, Ohashi N, Hirose M, Kudo K, Tsukamoto N, Ito M, Kobayashi N
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Journal Title
Antibiotics
Volume: 12
Issue: 1
Pages: 108-108
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Clonal diversity and molecular characteristics of methicillin-susceptible and -resistant Staphylococcus aureus from pediatric patients in Myanmar.2022
Author(s)
Aung MS, San T, Urushibara N, San N, Hlaing MS, Soe PE, Htut WHW, Moe I, Mon WLY, Chan ZCN, Kobayashi N.
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Journal Title
Microbial Drug Resistance
Volume: 28
Issue: 2
Pages: 191-198
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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