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Elucidation of the emergence of drug-resistant bacteria associated with antimicrobial therapy and its mechanism

Research Project

Project/Area Number 21K10403
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 58020:Hygiene and public health-related: including laboratory approach
Research InstitutionNara Medical University

Principal Investigator

Nakano Ryuichi  奈良県立医科大学, 医学部, 准教授 (80433712)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 矢野 寿一  奈良県立医科大学, 医学部, 教授 (20374944)
遠藤 史郎  東北医科薬科大学, 医学部, 教授 (40614491)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywordsカルバペネム耐性腸内細菌目(CRE) / カルバペネマーゼ / 第3世代セファロスポリン耐性菌 / カルバペネマーゼ非産生カルバペネム耐性菌 / 変異獲得 / 転位因子 / 薬剤耐性菌 / β-ラクタマーゼ / 抗菌薬 / グラム陰性桿菌 / 発現調節機構 / カルバペネム耐性菌 / 抗菌薬治療 / 耐性獲得 / 挿入配列(IS)
Outline of Research at the Start

医療現場において感染症治療を進めている内に、薬剤耐性菌が出現し治療に難渋する例が散見される。その要因として耐性遺伝子獲得や突然変異獲得が挙げられるが、生体内においてどのような条件によって耐性化しているか、またそれらの特徴について不明な点が多い。本研究ではカルバペネム耐性菌が出現するメカニズムを明らかにし、耐性菌を生み出さない条件を提案することを目的とし、次の3つの研究課題に取り組む。
課題1.抗菌薬治療中に耐性獲得した病原菌の実態ならびに耐性機構を明らかにする
課題2.どのような抗菌薬添加条件が耐性獲得に導くか再現実験にて立証する
課題3.耐性機構の不明な菌株についてそのメカニズムを解明する

Outline of Final Research Achievements

In this study, we aimed to elucidate in which areas drug-resistant bacteria exist, and the backgrounds under which they emerge. We isolated carbapenem-resistant Escherichia coli and third-generation cephalosporin-resistant E. coli in medical, community, and livestock settings, and characterized the resistance mechanisms. Although there were some common features among resistant strains from patients and healthy individuals, these strains showed different characteristics from those from livestock. Analysis of the resistance mechanism of carbapenemase-nonproducing carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae revealed that most of them have mutations in the outer membrane protein porin. Furthermore, the resistance mechanism of carbapenemase-producing bacteria was clarified, the first case of its detection in Japan.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本邦の医療機関で分離される耐性菌の一部は既に市中での拡がりが確認された。家畜からも同様に耐性菌は分離されるが、これらはヒトとの関連性は確認されなかった。それぞれの領域において耐性菌が伝播している可能性が推測された。耐性菌の一部にはその出現に際して、抗菌薬治療などによる変異獲得の可能性が判った。変異の獲得様式はどの株にも起こりうるものであり、その出現メカニズムや制御は重要であることが判った。さらに新規に発見した耐性遺伝子について、転位因子が大きく関与している可能性があった。ゲノム解析が頻繁になった昨今において、今後もこの様な耐性菌の存在がさらに明らかになると思われる。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 3 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 4 results)

  • [Journal Article] Genetic relatedness of third-generation cephalosporin-resistant Escherichia coli among livestock, farmers, and patients in Japan2023

    • Author(s)
      Nakano Ryuichi、Nakano Akiyo、Nishisouzu Ryuji、Hikosaka Kenji、Suzuki Yuki、Kamoshida Go、Tansho-Nagakawa Shigeru、Endo Shiro、Kasahara Kei、Ono Yasuo、Yano Hisakazu
    • Journal Title

      One Health

      Volume: 16 Pages: 100524-100524

    • DOI

      10.1016/j.onehlt.2023.100524

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Emergence and Evolution of Unique Plasmids Harboring blaIMP-70 and blaCTX-M-253 in Multidrug-Resistant Providencia rettgeri.2022

    • Author(s)
      Watanabe M, Nakano R, Tanouchi A, Nakano A, Suzuki Y, Saito K, Sakata R, Ogawa M, Yano H
    • Journal Title

      Microbiol Spectr

      Volume: 6 Issue: 4

    • DOI

      10.1128/spectrum.01204-22

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The Role of nmcR, ampR, and ampD in the Regulation of the Class A Carbapenemase NmcA in Enterobacter ludwigii2022

    • Author(s)
      Nakano Ryuichi、Yamada Yuki、Nakano Akiyo、Suzuki Yuki、Saito Kai、Sakata Ryuji、Ogawa Miho、Narita Kazuya、Kuga Akio、Suwabe Akira、Yano Hisakazu
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 12 Pages: 794134-794134

    • DOI

      10.3389/fmicb.2021.794134

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Predominance of CTX-M-9 Group Among ESBL-Producing <i>Escherichia coli</i> Isolated from Healthy Individuals in Japan2022

    • Author(s)
      Masui Takashi、Nakano Ryuichi、Nakano Akiyo、Saito Kai、Suzuki Yuki、Kakuta Naoki、Horiuchi Saori、Tsubaki Kousuke、Kitahara Tadashi、Yano Hisakazu
    • Journal Title

      Microbial Drug Resistance

      Volume: 28 Pages: 355-360

    • DOI

      10.1089/mdr.2021.0062

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Prevalence and characteristics of carbapenem-resistant Enterobacterales in 23 hospitals in Nara City, Japan from 2018 to 2020: predominance of IMP-6 carbapenemase2024

    • Author(s)
      Ryuichi Nakano, Rio Kishi, Akiyo Nakano, Takehito Harimoto, Sayaka Mizuno, Koichi Yamaguchi, Yuki Suzuki, Daisuke Kitagawa, Saori Horiuchi, Ryuichi Morita, Takashi Kawabe, Hisakazu Yano
    • Organizer
      ECCMID2024(欧州臨床微生物感染症学会議)
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ややこしい薬剤耐性菌,どうする? グラム陰性桿菌の薬剤耐性 CLSI 法で検出困難な耐性2024

    • Author(s)
      中野竜一
    • Organizer
      第35回日本臨床微生物学会総会・学術集会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Genetic relatedness of third-generation cephalosporin-resistant Escherichia coli among livestock, farmers, and patients in Japan2022

    • Author(s)
      Nakano R, Nakano A, Nishisouzu R, Hikosaka K, Suzuki Y, Kamoshida G, Shigeru T, Kasahara K, Ono Y, Yano H.
    • Organizer
      32nd International Congress of Antimicrobial Chemotherapy
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Molecular and epidemiological characteristics of carbapenemase-producing Enterobacterales clinical isolates in Nara, Japan2022

    • Author(s)
      Kishi R, Nakano R, Nakano A, Suzuki Y, Horiuchi S, Saito K, Watanabe M, Morita R, Kawabe T, Yano H
    • Organizer
      32nd International Congress of Antimicrobial Chemotherapy
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 奈良市医療機関23施設におけるカルバペネム耐性腸内細菌科の分子疫学解析2022

    • Author(s)
      岸 莉央、中野竜一、中野章代、鈴木由希、堀内沙央里、斉藤 開、渡邉真子、矢野寿一
    • Organizer
      第70回日本化学療法学会西日本支部総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 本邦の医療機関から分離されたIMP-6産生菌の細菌学的・遺伝学的特徴の解明2022

    • Author(s)
      山口晃一、中野竜一、中野章代、岸 莉央、斉藤 開、渡邉真子、鈴木由希、矢野寿一
    • Organizer
      第65回日本感染症学会中日本地方会学術集会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Meet the Expert β-ラクタマーゼを理解する2021

    • Author(s)
      中野竜一
    • Organizer
      第33回日本臨床微生物学会総会・学術集会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Meet the Expert CTX-M産生菌の水平伝播2021

    • Author(s)
      中野竜一
    • Organizer
      第95回日本感染症学会学術講演会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 薬剤耐性菌の拡散メカニズムについて2021

    • Author(s)
      中野竜一
    • Organizer
      第33回分子生物学・生理生化学研究会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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