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Transcriptomic analyses of mouse cardiac myocytes and cardiac non-myocyte cells: postmitotic vs. proliferative cells

Research Project

Project/Area Number 21K11605
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 59040:Nutrition science and health science-related
Research InstitutionNippon Medical School

Principal Investigator

Takenaka Yasuhiro  日本医科大学, 医学部, 講師 (20586789)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 平崎 正孝  埼玉医科大学, 医学部, 講師 (10522154)
柿沼 由彦  日本医科大学, 大学院医学研究科, 大学院教授 (40233944)
大畠 久幸  日本医科大学, 医学部, 講師 (80256924)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2023: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Keywords老化 / 心筋 / 非心筋 / 分裂終了細胞 / トランスクリプトーム解析 / ミトコンドリア / 核小体低分子RNA / snoRNA / 分裂停止細胞 / 心筋細胞 / マウス / RNAシーケンス / 老化マウス / 老化マーカー / マーカー / 変性タンパク質
Outline of Research at the Start

老化とは分裂細胞の分裂限界として現れる現象と、非分裂性細胞の生存限界として現れる現象との重なり合いの結果である。しかし、分裂細胞の老化研究が進む一方で心筋などの分裂終了細胞が個体の老化にどう関わっているのかについては解析が遅れている。本研究では、マウス心筋細胞を用いて網羅的遺伝子発現解析により分裂終了細胞に普遍的な新規老化マーカーを同定し、個体及び細胞の老化における本マーカーの機能を明らかにする。将来的には、本老化マーカーを指標とした個体老化レベルの多面的評価法の確立や、既に蓄積したマーカー分子の軽減、消去法を模索することによる老化表現型の緩和や加齢による心機能低下の治療応用も期待される。

Outline of Final Research Achievements

Adult heart mostly contains long-lived postmitotic cardiomyocytes and non-cardiomyocytes that have proliferative potential. Here, we isolated cardiomyocytes and non-cardiomyocytes from young and aged mouse heart, and performed transcriptome analyses to understand the differences of gene expression in postmitotic and proliferative cells. Gene ontology analyses revealed that genes associated with inflammatory response were upregulated in aged cardiac myocytes, whereas genes including two ATP synthases in mitochondrial respiratory were significantly downregulated. We also found that the expression levels of some small nucleolar RNAs (snoRNAs) are decreased cardiomyocytes with aging. snoRNAs are deeply involved in RNA modification such as pseudouridylation stabilizing ribosomal RNA and mRNA splicing. Therefore, the age-related reduction in snoRNA expression may lead to the destabilization of rRNA, splicing dysfunction, and ultimately a decrease in protein synthesis capacity.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

老化研究は老化に伴う組織の機能低下に加えて多くの疾患の診断や治療を根底から変える可能性を秘めており、老化の根本的なメカニズム解明は高齢化の進む現代において急務である。多くの多細胞生物において老化とは分裂細胞の分裂限界として現れる現象と、非分裂性細胞の生存限界として現れる現象との重なり合いの結果である。本研究の成果により将来的には、当該老化マーカーのカイネティクスを元にした個体老化レベルの多面的評価法の確立が期待される。また既に蓄積したマーカー分子の軽減、消去法を模索することによる老化表現型の緩和や高齢期における心機能低下の治療への応用も期待される。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2024 2023 2022 Other

All Journal Article (5 results) (of which Open Access: 3 results,  Peer Reviewed: 3 results) Presentation (6 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Transcriptome Analysis Reveals Enhancement of Cardiogenesis-Related Signaling Pathways by S-nitroso-N-pivaloyl-D-penicillamine (SNPiP): Implications for Improved Diastolic Function and Cardiac Performance2024

    • Author(s)
      Takenaka Yasuhiro、Hirasaki Masataka、Bono Hidemasa、Nakamura Shigeo、Kakinuma Yoshihiko
    • Journal Title

      Journal of Cardiovascular Pharmacology

      Volume: 1 Issue: 5 Pages: 433-445

    • DOI

      10.1097/fjc.0000000000001552

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Transcriptome analyses of mouse cardiac myocytes and non-cardiomyocytes: postmitotic vs. proliferative cells2023

    • Author(s)
      Takenaka Yasuhiro、Hirasaki Masataka、Inoue Ikuo、Ikeda Masaaki、Ohata Hisayuki、Kakinuma Yoshihiko
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: 1

    • DOI

      10.1101/2023.08.20.554007

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Open Access
  • [Journal Article] Temporal inhibition of the electron transport chain attenuates stress-induced cellular senescence by prolonged disturbance of proteostasis in human fibroblasts2023

    • Author(s)
      Yasuhiro Takenaka, Ikuo Inoue, Masataka Hirasaki, Masaaki Ikeda, Yoshihiko Kakinuma
    • Journal Title

      FEBS Journal

      Volume: in press Issue: 15 Pages: 3843-3857

    • DOI

      10.1111/febs.16785

    • Related Report
      2023 Annual Research Report 2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Positive feedback regulation of Pparγ1sv and Pparγ2 during adipogenesis in 3T3-L1 cells2023

    • Author(s)
      Takenaka Yasuhiro、Kakinuma Yoshihiko、Inoue Ikuo
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: 1

    • DOI

      10.1101/2023.08.03.551916

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Open Access
  • [Journal Article] Prolonged disturbance of proteostasis induces cellular senescence via temporal mitochondrial dysfunction and subsequent mitochondrial accumulation in human fibroblasts2022

    • Author(s)
      Yasuhiro Takenaka, Ikuo Inoue, Takanari Nakano, Masaaki Ikeda, Yoshihiko Kakinuma
    • Journal Title

      FEBS Journal

      Volume: 289(6) Issue: 6 Pages: 1650-1667

    • DOI

      10.1111/febs.16249

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 増殖停止細胞の老化を解き明かす:トランスクリプトーム解析による老齢マウス心筋細胞の核小体低分子RNA(snoRNA)とミトコンドリア遺伝子発現2023

    • Author(s)
      竹中 康浩、平崎 正孝、井上 郁夫、池田 正明、大畠 久幸、柿沼 由彦
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] タンパク質恒常性(プロテオスタシス)の視点から見たストレス誘導性細胞老化とその制御:ミトコンドリア代謝の重要性2023

    • Author(s)
      竹中 康浩、井上 郁夫、平崎 正孝、池田 正明、柿沼 由彦
    • Organizer
      第96回日本生化学会大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 個体老化における増殖停止細胞(心筋細胞)と増殖性細胞(非心筋細胞)のトランスクリプトーム解析2023

    • Author(s)
      竹中 康浩、平崎 正孝、井上 郁夫、池田 正明、大畠 久幸、柿沼 由彦
    • Organizer
      第46回日本基礎老化学会大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] マウス心筋細胞および非心筋細胞のトランスクリプトーム解析:個体老化における増殖停止細胞と増殖性細胞の比較2023

    • Author(s)
      竹中 康浩、平崎 正孝、井上 郁夫、池田 正明、大畠 久幸、柿沼 由彦
    • Organizer
      日本生理学会第100回記念大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Transcriptomic analyses of mouse cardiac myocytes and cardiac non-myocyte cells: postmitotic vs. proliferative cells2023

    • Author(s)
      Yasuhiro Takenaka, Masataka Hirasaki, Ikuo Inoue, Masaaki Ikeda, Yoshihiko Kakinuma
    • Organizer
      第100回日本生理学会大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Vitamin E and rapamycin treatment attenuate cellular senescence induced by prolonged disturbance of proteostasis in human fibroblasts2022

    • Author(s)
      Yasuhiro Takenaka, Ikuo Inoue, Masaaki Ikeda, Yoshihiko Kakinuma
    • Organizer
      第99回日本生理学会大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Remarks] 主な研究内容

    • URL

      https://www.nms.ac.jp/college/schoolroom/kisoigaku/seitaitougyogaku/kenkyunaiyou.html

    • Related Report
      2023 Annual Research Report 2022 Research-status Report 2021 Research-status Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 脂質タンパク質複合体を含む多検体試料を分析するための電気泳動用スラブ型ポリアクリルアミドゲル及びその方法2022

    • Inventor(s)
      竹中 康浩、井上 郁夫、柿沼 由彦
    • Industrial Property Rights Holder
      竹中 康浩、井上 郁夫、柿沼 由彦
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2022-001983
    • Filing Date
      2022
    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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