Targeted exome analysis as a diagnostic tool for the leptin-melanocortin pathway related genes in childhood obesity
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21K11701
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 59040:Nutrition science and health science-related
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| Research Institution | Kyoto Prefectural University of Medicine |
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Principal Investigator |
中島 久和 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 特任講師 (80363985)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
森 潤 地方独立行政法人大阪市民病院機構大阪市立総合医療センター(臨床研究センター), 臨床研究センター, 部長 (20750011)
森元 英周 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (20827539)
福原 正太 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 特任助教 (80817685)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
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| Keywords | 小児肥満 / レプチン-メラノコルチン摂食抑制系 / 次世代シーケンサ / ゲノム解析 / 遺伝子異常 / 次世代シーケンサー / エクソーム解析 |
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| Outline of Research at the Start |
次世代シーケンサーとバイオインフォルアティクスの技術を用いて、小児肥満のNon-syndromic monogenic obesity (単一遺伝子の変異に起因する非症候群性肥満)の診断を試みる。レプチン-メラノコルチン摂食抑制系の機能遺伝子に着目してゲノム解析を行う。レプチン遺伝子、レプチン受容体遺伝子、メラノコルチン４型受容体遺伝子、MC3R、POMCなどを候補遺伝子とする。京都府立医科大学附属病院およびその関連する医療機関で研究対象者を募集し、インフォームドコンセントを取得し採血を実施、ゲノム解析を実施する。京都府立医科大学医学倫理審査委員会での承認を経て、医学研究倫理に配慮し実施する。
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| Outline of Annual Research Achievements |
小児肥満（症）患者あるいは成人に達した小児肥満症経験者について、レプチンメラノコルチン摂食抑制系に関わる遺伝子群の病的バリアントを検出する率を研究する計画である。レプチン遺伝子、レプチン受容体遺伝子、プロオピオメラノコルチン（POMC）遺伝子、MC4R遺伝子などを標的として次世代シーケンサーを用いて、遺伝子の塩基配列を解析する。データベースと照合し既知の病的バリアントの検出する。病的意義が不明なバリアントが検出された場合はPolyPhen2などのタンパク質の機能予測モデルプログラムを利用し、病的意義を考察する。
2022年度は京都府立医科大学医学倫理審査委員会における審査にて研究許可の承認を得た。2022年10月から研究対象者のエントリーを開始した。2023年3月末時点で12例の小児期に発症した肥満症の患者をエントリーした。現在、本研究コホートの参加者について末梢血からテンプレートDNAを抽出し、次世代シーケンサーを用いて遺伝子を解析中である。また、次年度以降も研究対象者を増やして、解析を進める予定である。
別の研究コホートとして甲状腺ホルモン２型脱ヨード酵素遺伝子の多型、rs225014 (DIO2, Thr92Ala)について検討した。Ala/Ala多型は小児肥満者に占める割合が15.1%、非肥満者の6.3%と比べてオッズ比3.393 (p=0.003)と高かった。多変量解析でもオッズ比3.757[95%CI,1.645-8.580; p=0.002]であった。rs225015は小児肥満のリスクを高める遺伝子多型である可能性が示唆された。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
2021年7月に京都府立医科大学医学倫理審査委員会の初回申請を行った。審査委員による何度かの査読・修正を必要とした。2022年9月をもって本学倫理審査委員会の審査を通過し、研究開始の承認を得た。2022年10月から小児肥満患者、あるいはかつて小児肥満であった成人経験者を研究対象としたリクルートを開始した。2023年3月末をもって12名の患者の説明・同意（インフォームド・コンセント）を取得した。また、コロナウイルス感染症パンデミックの時期に重なり、一般的に病院受診が控えられるような政策誘導・風潮があり研究対象者の数を増やすことが困難であった。
以上のように医学倫理審査に多大な時間と労力を要したため、研究対象候補者に対する説明同意（インフォームド・コンセント）の作業を開始する時期が非常に遅れたため研究進捗が遅滞している。またコロナウイルスパンデミックの影響を受けたことも研究進捗のおくれに影響したと思われる。
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| Strategy for Future Research Activity |
研究対象者のエントリーを増やす試みを継続する。京都府立医科大学附属病院の通院患者だけではなく、連携施設の協力を要請する必要がある。多施設共同研究に移行するため、本研究に参加意向がある施設を募る。本学倫理委員会には倫理審査の外部機関一括審査を依頼する。
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Report
(2 results)
Research Products
(13 results)
