オートエンコーダーを用いたSTINGの恒常的活性化メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number	21K12134
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related
Research Institution	National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
Principal Investigator	土屋裕子国立研究開発法人産業技術総合研究所, 情報・人間工学領域, 主任研究員 (30557773)
Project Period (FY)	2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help	¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000) Fiscal Year 2023: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000) Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000) Fiscal Year 2021: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Keywords	オートエンコーダー / シミュレーション / 疾病発症機構
Outline of Research at the Start	自然免疫に関わるタンパク質STINGは感染時に生成されるリガンドを結合することで活性化しI型インターフェロン (IFN) 産生を促進する。しかし変異体では無感染状態でも恒常的にIFNを産生し自己免疫疾患の発症を導く。変異による主鎖構造の顕著な変化が見られないことや変異部位からIFN産生に関わる機能部位まで離れていることから、ダイナミックアロステリーと呼ばれる現象が生じていると考えられる。研究代表者らが開発したシミュレーションデータから側鎖原子の構造情報を落とすことなくシグナル伝達の解析を行うオートエンコーダーに基づく手法により、STINGの遺伝子変異が導く恒常的活性化のメカニズムの解明を行う。