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Development of artificial nucleic acid aptamers to improve the efficacy of antisense oligonucleotide

Research Project

Project/Area Number 21K14743
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 37010:Bio-related chemistry
Research InstitutionNational Institutes of Biomedical Innovation, Health and Nutrition

Principal Investigator

Kasahara Yuuya  国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 医薬基盤研究所 創薬デザイン研究センター, 副センター長 (10740673)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywordsアプタマー / SELEX / ポリメラーゼ / 人工核酸 / アンチセンス核酸 / 核酸医薬 / DDS
Outline of Research at the Start

核酸医薬の一つであるアンチセンス核酸(ASO)を肝臓以外の臓器に効率的に送達し機能を発揮させるために、同じ核酸分子であるアプタマーに着目した。アプタマーは抗体のように標的分子を選択的に捉えることが可能な核酸分子であり、SELEXと呼ばれる選別方法によって望みの機能を持ったものを効率的に取得できる特徴がある。本研究では、ASOの機能を指標としたSELEXによって、目的の臓器(細胞)への送達効率だけでなくASOの機能も向上可能なアプタマーの創出を試みる。得られたアプタアーを培養細胞での機能評価だけでなく実験動物における送達効率や治療効果を検証することでその有用性を評価する。

Outline of Final Research Achievements

The objective of this study was to create aptamers that could be used as delivery carriers. To this end, libraries with improved functions were created using artificial nucleic acids and screened based on their functions. Dual-modified artificial nucleic acid triphosphates were synthesized by modifying a methoxy group at the 2' position of the sugar moiety of the nucleic acid to enhance nuclease stability and an indole ring at the 5-position of the uracil base via a linker to facilitate intracellular translocation. Subsequently, the conditions for efficient library production were identified by refining each reaction condition during enzyme synthesis. In addition, artificial nucleic acid aptamers with improved blood-brain barrier (BBB) permeability were successfully obtained by screening using an in vitro BBB model.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究を通して、人工核酸を搭載したライブラリの効率的な酵素合成方法の確立と、機能に着目したスクリーニングによるデリバリー担体としての機能を有したアプタマーの効率的な取得方法を確立することができた。本研究成果は、従来の天然のDNAやRNAで構成されたアプタマーを生体内で利用する際の最大の課題である核酸分解酵素に対する安定性を解決することにつながるため、学術的意義は大きい。今後は、本研究で得られた知見をいかして様々な機能を有した人工核酸アプタマーの創出に応用展開していく予定である。

Report

(3 results)
  • 2023 Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2023 2022 2021

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (12 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] Hybrid-Type SELEX for the Selection of Artificial Nucleic Acid Aptamers Exhibiting Cell Internalization Activity2021

    • Author(s)
      Uemachi Hiro、Kasahara Yuuya、Tanaka Keisuke、Okuda Takumi、Yoneda Yoshihiro、Obika Satoshi
    • Journal Title

      Pharmaceutics

      Volume: 13 Issue: 6 Pages: 888-888

    • DOI

      10.3390/pharmaceutics13060888

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 糖・塩基部デュアル修飾型人工核酸を用いた抗CHIP/STUB1アプタマーの創出2023

    • Author(s)
      石田健太、千賀陽子、仁田峠海斗、岡正啓、大岡伸通、星野秀和、出水庸介、井上貴雄、小比賀聡、笠原勇矢
    • Organizer
      日本薬学会 第143年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] ランダム領域を拡張した修飾オリゴヌクレオチドの酵素合成2023

    • Author(s)
      仁田峠海斗、石田健太、星野秀和、笠原勇矢、小比賀聡
    • Organizer
      日本薬学会 第143年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] ポリアミンによる人工核酸の酵素伸長への影響2023

    • Author(s)
      星野秀和、笠原勇矢、小比賀聡
    • Organizer
      日本薬学会 第143年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 2′位や5′位を修飾した人工核酸の改変ポリメラーゼによる酵素伸長2022

    • Author(s)
      石田健太、笠原勇矢、星野秀和、小比賀聡
    • Organizer
      日本核酸医薬学会第7回年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 塩基部修飾人工核酸を用いた抗IL-6Rアプタマーの開発2022

    • Author(s)
      笠原勇矢、千賀陽子、石田健太、奥田匠、長尾知生子、新山真由美、鎌田春彦、水口賢司、小比賀聡
    • Organizer
      日本核酸医薬学会第7回年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Enzymatic synthesis of oligonucleotide with 2′-MOE modification2022

    • Author(s)
      Ishida K., Kasahara Y., Hoshino H., Obika S.
    • Organizer
      The 18th Annual Meeting of the Oligonucleotide Therapeutics Society
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Development of antagonist aptamers to interleukin-6 receptor2022

    • Author(s)
      Kasahara Y., Senga Y., Ishida K., Okuda T., Nagao C., Niiyama M., Kamada H., Mizuguchi K., Obika S.
    • Organizer
      The 18th Annual Meeting of the Oligonucleotide Therapeutics Society
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] アプタマー創薬を志向した2′-MOEオリゴ核酸の酵素合成2022

    • Author(s)
      石田健太, 笠原勇矢, 星野秀和, 米田悦啓, 小比賀聡
    • Organizer
      日本薬学会 第142年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] タンパク質標的型核酸医薬の新たな可能性2022

    • Author(s)
      笠原勇矢
    • Organizer
      第3回モダリティ創薬デザイン研究会シンポジウム
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 胃がん腹膜播種治療に向けたSYT13標的アンチセンス核酸の毒性評価およびオフターゲット解析2021

    • Author(s)
      笠原勇矢, 神田光郎, 山隈晴美, 亀岡なつ実, 小比賀聡
    • Organizer
      日本核酸医薬学会第6回年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Development of xeno nucleic acid aptamers targeting the SARS-CoV-2 spike protein for COVID-19 therapeutics2021

    • Author(s)
      石田健太, 笠原勇矢, 星野秀和, 小比賀聡
    • Organizer
      日本核酸医薬学会第6回年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 人工核酸アプタマーを利用したMCM8-9阻害剤の開発2021

    • Author(s)
      内堀友紀, 笠原勇矢, 真柳浩太, 杉本のぞみ, 藤田雅俊
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

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Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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