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High sensitive metabolite detection using DNA barcoding strategy

Research Project

Project/Area Number 21K14754
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 37030:Chemical biology-related
Research InstitutionAoyama Gakuin University

Principal Investigator

NISHIHARA Tatsuya  青山学院大学, 理工学部, 助教 (00773201)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
Keywords代謝物 / DNAバーコード / 代謝物解析
Outline of Research at the Start

近年、生体内で産生される代謝物は疾病と関連する診断マーカーとして機能することから医学研究分野を中心に注目されている。従来の代謝物解析法は、主に液体クロマトグラフィー質量分析計 (LC-MS) などが用いられているが、質量分析計の原理上、統一的な定量値の評価が難しいという課題を抱えている。以上を踏まえ、本研究では、代謝物の構造情報をDNAの配列情報に置き換えうるシステムを新たに設計することを目指した。定量PCRや次世代シーケンサーにより、置き換えたDNAを統一的に、かつ超高感度に定量し、新たな代謝物解析手法を確立する。

Outline of Final Research Achievements

In the field of medicine, metabolome analysis has been actively conducted in recent years, combining separation methods such as capillary electrophoresis (CE), liquid chromatography (LC), and gas chromatography (GC) with mass spectrometry techniques. Metabolome analysis has been conducted in the cohort study to discover the disease biomarker. In this study, we attempted to convert the metabolite information into DNA sequences using chemical reactions. The proposed methodology can realize integrated analysis with the transcriptome and genome.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では、従来の質量分析計によるメタボローム解析の課題解決に向け、代謝物情報をDNAの配列情報へ置換する方法論の構築を進めた。実際に、レドックスの維持に寄与するグルタチオン、および、がん代謝において重要な役割を果たすグルコース、乳酸へ適用し、代謝物情報をDNAの配列情報へ置き換え可能であることを初めて明らかにした。これにより、mRNAとの同時解析も可能であった。そのため、従来の代謝物解析の課題克服に繋がる重要な成果であると言える。

Report

(3 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2022 2021

All Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Presentation] 細胞内の標的代謝物情報をコード可能にする機能性人工核酸の開発と応用2022

    • Author(s)
      本橋優人、盛谷周平、西原達哉、田邉一仁
    • Organizer
      日本化学会第103春季年会2023
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] アミノペプチダーゼ活性をコード可能にする機能性核酸の開発2022

    • Author(s)
      三尾玲緒斗、西原達哉、田邉一仁
    • Organizer
      日本化学会第103春季年会2023
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 標的代謝物を定量可能にする人工核酸の開発2022

    • Author(s)
      本橋優人、西原達哉、田邉一仁
    • Organizer
      第44回日本光医学・光生物学会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] フェニルボロン酸含有人工核酸を用いた代謝物解析手法の開発2022

    • Author(s)
      本橋優人、西原達哉、田邉一仁
    • Organizer
      第16回バイオ関連化学シンポジウム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Detection of cellular metabolite using phenylboronic acid-modified oligonucleotides2022

    • Author(s)
      Yuto Motohashi, Tatsuya Nishihara, Kazuhito Tanabe
    • Organizer
      第49回国際核酸化学シンポジウム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 代謝物の高感度検出を目指したDNA配列情報へコード可能にする新規ラベル化剤の開発2021

    • Author(s)
      矢島百華 西原達哉 田邉一仁
    • Organizer
      日本化学会 第102春季年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 代謝物応答性人工核酸を用いた標的代謝物の超感度検出法の開発2021

    • Author(s)
      本橋優人 盛谷周平 西原達哉 田邉一仁
    • Organizer
      日本化学会 第102春季年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 代謝物の高感度検出を実現する新規ラベル化剤の開発2021

    • Author(s)
      矢島百華 西原達哉 田邉一仁
    • Organizer
      第11回 CSJ化学フェスタ2021
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 代謝物の超高感度検出を可能にする機能性核酸の開発2021

    • Author(s)
      本橋優人 西原達哉 田邉一仁
    • Organizer
      第15回 バイオ関連化学シンポジウム
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Functional Oligonucleotide Encoding the Metabolite Information2021

    • Author(s)
      Tatsuya Nishihara, Yuto Motohashi, Shuhei Moritani, Momoka Yajima, Kazuhito Tanabe
    • Organizer
      The 48th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2021
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 代謝物情報をコード可能にする機能性核酸の開発2021

    • Author(s)
      西原達哉 本橋優人 盛谷周平 矢島百華 田邉一仁
    • Organizer
      第15回 バイオ関連化学シンポジウム
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 標的代謝物の多検体解析を指向した機能性人工核酸の開発2021

    • Author(s)
      西原達哉 本橋優人 盛谷周平 田邉一仁
    • Organizer
      日本化学会 第102春季年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 検体中に含まれるグルタチオン濃度をコード可能にする機能性核酸の開発2021

    • Author(s)
      盛谷周平 西原達哉 田邉一仁
    • Organizer
      第11回 CSJ化学フェスタ2021
    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2024-01-30  

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