• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Development of prokaryotic growth accelerator using ribosomal RNA

Research Project

Project/Area Number 21K14771
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 38020:Applied microbiology-related
Research InstitutionYamaguchi University (2022-2023)
Osaka University (2021)

Principal Investigator

Sato Yu  山口大学, 大学研究推進機構, 助教(テニュアトラック) (90852187)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
KeywordsリボソームRNA / 増殖速度 / バクテリア / プラスミド / 微生物操作技術
Outline of Research at the Start

産業利用に有用な原核生物の探索における一つの律速段階として、多くの原核生物の増殖速度が遅いことが挙げられる。天然環境中では、ゲノム上のrRNA遺伝子のコピー数が多い原核生物ほど最大増殖速度が速い傾向が見られており、rRNA遺伝子に基づく増殖速度制御機構の存在が示唆される。一方、1菌株レベルでのrRNA遺伝子のコピー数と増殖速度との相関を検証した研究は少なく、rRNA量と増殖速度との関係については十分な解析がなされていない。そこで、本研究では、合成生物学的手法を用いて異なるコピー数のrRNA遺伝子をもつ 変異株ライブラリーを作製し、細胞内rRNA量の違いが原核生物の増殖に与える影響を評価する。

Outline of Final Research Achievements

In prokaryotes, there is a positive correlation between the number of ribosomal RNA (rRNA) genes involved in the translational process of protein synthesis and growth rate. In this research project, we tested whether the growth rate of a given bacterium can be manipulated by artificially adjusting the number of rRNA genes in the cell. As a result of genetic modification experiments using E. coli, which has rRNA genes only on a plasmid, we found that increasing the number of rRNA genes up to a certain level improves the growth rate. The results also showed that an excessive increase in the number of rRNA genes affects cell size and protein production, and the development of a new cell modification technology based on rRNA gene modification is expected.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

バイオ産業は目覚しい発展を続けており、経済協力開発機構によると2030年のバイオ市場は約200兆円の巨大市場に成長すると予想されている。これまでに環境中から約2万種もの原核生物が単離され、その性質に応じて幅広い分野に利用されてきた。しかしながら、産業利用に十分な菌体密度を得るまでに数日から数週間と増殖が遅い微生物も少なくなく、限られた原核生物しか産業利用できていない。本研究で得られた「rRNA遺伝子の改変により任意の微生物の増殖速度を加速可能である」という知見は、既存の微生物利用を最大化するとともに、有用微生物の探索の加速化にも貢献しうる。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Impacts of Groundwater Pumping on Subterranean Microbial Communities in a Deep Aquifer Associated with an Accretionary Prism2024

    • Author(s)
      Iso Shinsei、Sato Yu、Kimura Hiroyuki
    • Journal Title

      Microorganisms

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 679-679

    • DOI

      10.1007/s00792-023-01326-y

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Effects of small heat shock proteins from thermotolerant bacteria on the stress resistance of Escherichia coli to temperature, pH, and hyperosmolarity2024

    • Author(s)
      Sato Yu、Okano Kenji、Honda Kohsuke
    • Journal Title

      Extremophiles

      Volume: 28 Pages: 1-12

    • DOI

      10.3389/fmicb.2023.1321428

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] L‐Lactate oxidase‐mediated removal of L‐lactic acid derived from fermentation medium for the production of optically pure D‐lactic acid2022

    • Author(s)
      Okano Kenji、Sato Yu、Hama Shnji、Tanaka Tsutomu、Noda Hideo、Kondo Akihiko、Honda Kohsuke
    • Journal Title

      Biotechnology Journal

      Volume: 17 Issue: 4

    • DOI

      10.1002/biot.202100331

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 原核生物における多様な温度適応機構(Mechanisms underlying the temperature adaptation in prokaryotes)2021

    • Author(s)
      佐藤 悠、岡野憲司、木村浩之、本田孝祐
    • Journal Title

      環境バイオテクノロジー学会誌

      Volume: 21 Pages: 17-28

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 耐熱菌由来ヒートショックタンパク質が大腸菌のマルチストレス耐性に及ぼす影響2024

    • Author(s)
      佐藤 悠、岡野憲司、本田孝祐
    • Organizer
      日本農芸化学会2024年度東京大会(創立100周年記念大会)
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 耐熱菌由来の熱ショックタンパク質による大腸菌のストレス耐性強化2024

    • Author(s)
      佐藤 悠、岡野憲司、本田孝祐
    • Organizer
      日本農芸化学会中四国支部第67回講演会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 高温で増殖可能なバクテリア由来のヒートショックタンパク質による大腸菌のストレス耐性強化2023

    • Author(s)
      佐藤 悠、岡野憲司、本田孝祐
    • Organizer
      第75回日本生物工学会大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Toward a full picture of microbial dark matter in the terrestrial subsurface2023

    • Author(s)
      佐藤悠
    • Organizer
      中高温微生物研究センター環境微生物部門セミナー
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 地下圏に潜む微生物ダークマターの全貌解明を目指して2023

    • Author(s)
      佐藤 悠、中島 悠、大久保智司、岡野憲司、木村浩之、延優、玉木秀幸、本田孝祐
    • Organizer
      第17回日本ゲノム微生物学会大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 好熱菌由来のヒートショックタンパク質による大腸菌のストレス耐性強化2022

    • Author(s)
      佐藤 悠、岡野憲司、本田孝祐
    • Organizer
      第74回日本生物工学会大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 温度適応に必要なものは何か?ー例外的な微生物を例にー2022

    • Author(s)
      佐藤 悠
    • Organizer
      日本農芸化学会中四国支部支部創立20周年記念第36回若手研究者シンポジウム
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 深部流体に含まれる微生物の多様性と代謝特性2022

    • Author(s)
      佐藤 悠、中島 悠、大久保 智司、岡野 憲司、木村 浩之、本田 孝祐
    • Organizer
      日本微生物生態学会第35回札幌大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Production of optically pure D-lactic acid from renewable resources2021

    • Author(s)
      Sato Yu、Okano Kenji、Tanaka Tsutomu、Kondo Akihiko、Honda Kohsuke
    • Organizer
      Young Asian Biochemical Engineers’ Community (YABEC) 2021
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Metabolic engineering of Lactobacillus plantarum for D-lactic acid production from lignocellulosic materials2021

    • Author(s)
      Sato Yu、Okano Kenji、Honda Kohsuke
    • Organizer
      Universitas Brawijaya-Osaka University Joint Symposium - Development of Green Technology for a Sustainable Society -
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 好熱好酸性アーキアThermoplasma acidophilum由来の2種類のセリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼの異種発現及び機能解析2021

    • Author(s)
      佐藤 悠、Maruf Ilma Fauziah、佐々木 由佳、Krebs Anastasia、NieBer Jochen、谷口 博範、 岡野 憲司、木谷 茂、 Restiawaty Elvi、Akhmaloka、本田 孝祐
    • Organizer
      第73回日本生物工学会大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi