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Identification of Novel Signal Recognition Factors for Mitochondrial beta-barrel Membrane Proteins

Research Project

Project/Area Number 21K15043
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 43030:Functional biochemistry-related
Research InstitutionUniversity of Miyazaki

Principal Investigator

Germany Edward  宮崎大学, フロンティア科学総合研究センター, 研究員 (00866767)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
Keywordsβバレル型膜タンパク質 / 大腸菌 / ミトコンドリア / 蛋白質輸送 / グラム陰性菌 / 膜タンパク質 / タンパク質輸送 / BAM複合体 / SAM複合体 / βバレル / ベータバレル型膜タンパク質 / SAM complex
Outline of Research at the Start

ベータバレル型膜タンパク質は、グラム陰性菌(バクテリア)の外膜から、真核生物ではミトコンドリアと葉緑体というバクテリアから派生したオルガネラのやはり外膜に存在するタンパク質である。これらは、正しい立体構造形成を伴った膜組込み、アセンブリーが行われなければ、それぞれがもつ正しい機能を発揮することができない。アセンブリーを実現する分子装置は、その中心的な因子が広く保存されている。しかしながら、近年の解析で明らかにされたグラム陰性菌における必須因子が、ミトコンドリアでは保存されておらず、別のタンパク質がその機能を代替している可能性が高い。本研究では、その未知因子の同定と機能解析を行う。

Outline of Final Research Achievements

β-barrel membrane proteins are membrane proteins with unique structures found in the outer membranes of Gram-negative bacteria, mitochondria and chloroplasts. Their conformation and membrane insertion, known as assembly, are essential for life with β-barrel membrane proteins. They are carried out by the recognition of the beta signal present in the protein by the transport machinery. However, other prominent assembly mechanisms are unknown. In this study, we focused on the interaction between the transported protein and the transport apparatus in order to explore other molecular mechanisms. As a result, an internal signal was found in bacteria and this was confirmed to be present in mitochondria.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では、バクテリアにおけるInternalシグナルの発見、及びそれがミトコンドリアに保存されていることを見出した。βバレル型膜タンパク質のアセンブリーは、バクテリアでは抗菌薬の標的となりうるが、ミトコンドリアにも同様のシステムが存在するため副作用の可能性が指摘されている。今回、バクテリアとミトコンドリアの両方で解析したことで、その相違点、類似点を列挙することができた。これらの情報は、副作用の少ないβバレル型膜タンパク質のアセンブリー阻害薬の開発に重要な情報を提供しうる。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2024 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Int'l Joint Research] Monash 大学(オーストラリア)

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] モナシュ大学(オーストラリア)

    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Journal Article] Dual recognition of multiple signals in bacterial outer membrane proteins enhances assembly and maintains membrane integrity2024

    • Author(s)
      Germany Edward M、Thewasano Nakajohn、Imai Kenichiro、Maruno Yuki、Bamert Rebecca S、Stubenrauch Christopher J、Dunstan Rhys A、Ding Yue、Nakajima Yukari、Lai XiangFeng、Webb Chaille T、Hidaka Kentaro、Tan Kher Shing、Shen Hsinhui、Lithgow Trevor、Shiota Takuya
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 12

    • DOI

      10.7554/elife.90274.3

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] From BAM to SAM, a conserved rule that regulates β- barrel membrane protein assembly2022

    • Author(s)
      Edward Germany
    • Organizer
      Nebraska univ seminar series
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Conserved internal β-signals regulate OMP assembly in gram-negative bacteria.2022

    • Author(s)
      エドワード ジャーマニー
    • Organizer
      遺伝研研究会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] BamD-Dependent Substrate Recognition Facilitates Outer Membrane Sorting and Insertion of Beta-Barrel Proteins2021

    • Author(s)
      エドワード ジャーマニー, 中島 由香里, 塩田 拓也
    • Organizer
      第17回21世紀大腸菌研究会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

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Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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