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Structural analysis of clock protein complex by combined deuterium-assisted small-angle neutron scattering and analytical ultracentrifugation

Research Project

Project/Area Number 21K15051
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 43040:Biophysics-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

Morishima Ken  京都大学, 複合原子力科学研究所, 助教 (40812087)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Keywords時計タンパク質複合体 / コントラスト同調中性子小角散乱(CM-SANS) / X線小角散乱(SAXS) / AUC-SAS / 時計タンパク質 / X線小角散乱 / 中性子小角散乱 / 超遠心分析 / 重水素化支援中性子小角散乱 / 時計蛋白質
Outline of Research at the Start

シアノバクテリアの時計蛋白質KaiA・KaiB・KaiCによる生物時計機構を理解するためには、KaiCのリン酸化度に応じて形成される種々の複合体の構造の検討が必要であるが、なかでも解離会合平衡下で形成されるKaiA-KaiC(AC)複合体の構造は十分に解明されていない。本研究では、超遠心分析(AUC)と小角散乱(SAS)の複合解析手法「AUC-SAS法」を用いて、解離-会合平衡下の溶液のSASデータからAC複合体のみの寄与を選択的に導出して構造解析を行う。さらに、重水素化支援中性子小角散乱「DA-SANS」とAUC-SAS法を組み合わせ、AC複合体中のKaiCに注目した構造解析も行う。

Outline of Final Research Achievements

To understand the mechanism of circadian oscillations by cyanobacterial clock proteins (KaiA, KaiB and KaiC), it is necessary to clarify the structure and dynamics of the complexes formed by these proteins in solution. In this study, the formation behavior and solution structure of the KaiA-KaiC complex (AC complex), which promotes the phosphorylation of KaiC, were analyzed by an integrated method of analytical ultracentrifugation and small-angle neutron/X-ray scattering.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究により解明されたAC複合体の溶液構造は、概日時計システムにおいて重要なKaiCのリン酸化亢進メカニズムの理解に寄与する。また、本研究の独自手法である「AUC-SAS法」はKaiA-KaiC相互作用のように解離-会合速度が速い平衡系における複合体構造解析に大変有用であることが示された。したがって同様の複合体系の溶液構造解析にも応用されることが期待される。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (81 results)

All 2024 2023 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 6 results) Presentation (66 results) (of which Int'l Joint Research: 14 results,  Invited: 3 results) Remarks (2 results)

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      奥田綾,清水将裕,守島健,柚木康弘,井上倫太郎,佐藤信浩,裏出令子,杉山正明
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      守島健,柚木康弘,清水将裕,奥田綾,佐藤信浩,井上倫太郎,裏出令子,矢木宏和,加藤晃一,杉山正明
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      http://www.rri.kyoto-u.ac.jp/NSBNG/activity.html

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    • URL

      http://www.rri.kyoto-u.ac.jp/NSBNG/activity.html

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Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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