• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Developmental profiles of fused cells produced by fusion of plant zygotes with somatic protoplasts

Research Project

Project/Area Number 21K15126
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 44030:Plant molecular biology and physiology-related
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

戸田 絵梨香  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 特別研究員 (50783065)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2022: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
Keywords受精卵 / 体細胞 / 配偶子 / プロトプラスト / イネ / 発生 / トランスクリプトーム
Outline of Research at the Start

本研究では、花から単離した卵細胞と精細胞を電気的に融合し受精卵を作出するin vitro受精系を用いて、作出した受精卵にさらに体細胞組織由来のプロトプラストを融合させることで、融合細胞(融合受精卵)を作出し、それらの発生解析を行う。これにより、エピゲノム修飾状態の異なる細胞の融合が、植物受精卵の発生プロファイルにどのような影響を及ぼすかについて、実験発生学的に明らかにすることを目的とした。また、融合受精卵の遺伝子発現解析を行い、それらを受精卵との比較解析に用いることで、受精卵発生を司る分子基盤を浮かび上がらせ、その解明につなげる。

Outline of Annual Research Achievements

受精卵は分化全能性を有し、かつ、次世代個体となる最初の細胞である。被子植物において、子孫を確実に形成するためには、受精卵・胚発生過程が厳密な転写制御下で進行すると予想される。一方で、植物受精卵の可塑性(多能性)やその維持・制御を司る分子機構については不明な点が多い。そこで本研究では、植物受精卵の可塑性を実験発生学的に明らかにすることを目的として、イネ受精卵(卵細胞×精細胞)に対して体細胞プロトプラストを融合した融合細胞(融合受精卵)を作出し、その発生過程を観察した。葉肉細胞プロトプラストを融合した融合受精卵の多くが発生不全を示した一方で、胚盤カルスプロトプラストの融合受精卵では、分裂・発生を進行する個体が高い割合で観察された。また、半数体イネ由来の葉肉細胞プロトプラストを融合に用いた場合、分裂・発生を示す個体がみられた。これらの結果より、融合する体細胞プロトプラストの種類あるいは融合受精卵を構成する配偶子と体細胞のゲノム比率によって、融合受精卵が異なる発生プロファイルを示すことが明らかとなった。このことから、葉肉細胞プロトプラストで特異的あるいは高発現している遺伝子群が、受精卵の可塑性を負に制御し、分裂・発生に異常を引き起こしている可能性が考えられた。そこで、葉肉細胞および胚盤カルスのトランスクリプトーム解析を実施し、現在、雌雄配偶子および受精卵との発現比較解析を進めている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

融合する体細胞プロトプラストの種類あるいは融合受精卵を構成する配偶子と体細胞のゲノム比率によって、融合受精卵がどのような発生プロファイルを示すのかが明らかになりつつある。これら発生解析に加えて、トランスクリプトームデータの解析を進めることで、植物受精卵の発生制御に関与する、あるいは、植物受精卵の可塑性を負に制御する遺伝子群の探索・同定を目指す。

Strategy for Future Research Activity

①融合受精卵の発生解析:研究成果をまとめるにあたり、追加実験等を進める。
②融合受精卵のトランスクリプトーム解析:受精卵との比較解析を行うことによって、受精卵発生制御に関与する遺伝子群の探索・同定に取り組む。
②異種組み合わせによる融合受精卵の作出およびその発生解析:異種融合受精卵の発生プロファイルやゲノム脱落の有無などを解析する。

Report

(3 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (28 results)

All 2023 2022 2021

All Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 8 results) Presentation (19 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Genome editing, considering through conventional breeding2023

    • Author(s)
      Yoshida Hitoshi、Tabei Yutaka、Tsuda Mai、Tanaka Junichi、Taniguchi Yojiro、Toda Erika、Takahara Manabu、Shimosaka Etsuo、Kunihisa Miyuki、Sakai Hiroaki、Yoshizaki Goro
    • Journal Title

      Breeding Research

      Volume: 25 Issue: 1 Pages: 78-83

    • DOI

      10.1270/jsbbr.25.W08

    • ISSN
      1344-7629, 1348-1290
    • Year and Date
      2023-06-01
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Open Access
  • [Journal Article] Whole-genome sequence analysis of mutations in rice plants regenerated from zygotes, mature embryos, and immature embryos2023

    • Author(s)
      Ichikawa Masako、Kato Norio、Toda Erika、Kashihara Masakazu、Ishida Yuji、Hiei Yukoh、Isobe Sachiko N.、Shirasawa Kenta、Hirakawa Hideki、Okamoto Takashi、Komari Toshihiko
    • Journal Title

      Breeding Science

      Volume: 73 Issue: 3 Pages: 349-353

    • DOI

      10.1270/jsbbs.22100

    • ISSN
      1344-7610, 1347-3735
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Transcriptome analyses uncover reliance of endosperm gene expression on Arabidopsis embryonic development2023

    • Author(s)
      Zhang Yilin、Maruyama Daisuke、Toda Erika、Kinoshita Atsuko、Okamoto Takashi、Mitsuda Nobutaka、Takasaki Hironori、Ohme‐Takagi Masaru
    • Journal Title

      FEBS Letters

      Volume: 597 Issue: 3 Pages: 407-417

    • DOI

      10.1002/1873-3468.14570

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Genome editing approaches using reproductive cells/tissues in flowering plants2023

    • Author(s)
      Toda Erika、Kato Norio、Higashiyama Tetsuya、Okamoto Takashi
    • Journal Title

      Frontiers in Genome Editing

      Volume: 4 Pages: 1085023-1085023

    • DOI

      10.3389/fgeed.2022.1085023

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Isolation of gametes and zygotes from Setaria viridis2022

    • Author(s)
      Toda Erika、Kiba Takatoshi、Kato Norio、Okamoto Takashi
    • Journal Title

      Journal of Plant Research

      Volume: 135 Issue: 4 Pages: 627-633

    • DOI

      10.1007/s10265-022-01393-w

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Regulatory functions of ROS dynamics via glutathione metabolism and glutathione peroxidase activity in developing rice zygote2021

    • Author(s)
      Rattanawong Kasidit、Koiso Narumi、Toda Erika、Kinoshita Atsuko、Tanaka Mari、Tsuji Hiroyuki、Okamoto Takashi
    • Journal Title

      The Plant Journal

      Volume: 108 Issue: 4 Pages: 1097-1115

    • DOI

      10.1111/tpj.15497

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Plant genome engineering from lab to field-a Keystone Symposia report2021

    • Author(s)
      Cable J, Ronald PC, Voytas D, Zhang F, Levy AA, Takatsuka A, Arimura S, Jacobsen SE, Toki S, Toda E, Gao C, Zhu J, Boch J, Van Eck J, Mahfouz M, Andersson M, Fridman E, Weiss T, Wang K, Qi Y, Jores T, Adams T, Bagchi R
    • Journal Title

      Annals of the New York Academy of Sciences

      Volume: 1506 Issue: 1 Pages: 35-54

    • DOI

      10.1111/nyas.14675

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Isolation of gametes and zygotes from Setaria viridis2021

    • Author(s)
      Erika Toda, Takatoshi Kiba, Norio Kato, Takashi Okamoto
    • Journal Title

      BioRxiv

      Volume: -

    • DOI

      10.1101/2021.11.01.466850

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Open Access
  • [Presentation] イネ受精卵-体細胞プロトプラスト融合細胞の発生プロファイル2023

    • Author(s)
      戸田絵梨香、亀川拓夢、東山哲也、井澤毅、岡本龍史
    • Organizer
      日本植物学会第87回大会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] イネ受精卵発生における体細胞融合の影響2023

    • Author(s)
      戸田絵梨香、亀川拓夢、東山哲也、井澤毅、岡本龍史
    • Organizer
      学術変革領域研究「挑戦的両性花原理」2023年度若手の会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Developmental profiles of zygote-somatic protoplast fused cells in rice2023

    • Author(s)
      Toda E, Kamekawa T, Higashiyama T, Okamoto T
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Reliance of endosperm gene expression on Arabidopsis embryonic development2023

    • Author(s)
      Zhang Y, Maruyama D, Toda E, Kinoshita A, Okamoto T, Mitsuda N, Takasaki H, Takagi-Ohme M
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 顕微授精法を用いたイネ栽培種-遠縁・近縁野生種間の交雑体および複二倍交雑体の作出2023

    • Author(s)
      小野里佳、戸田絵梨香、手塚拓海、縣歩美、木下温子、佐藤豊、岡本龍史
    • Organizer
      日本育種学会第143回講演会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Effect of paternal genome excess on the developmental and gene expression profiles of polyspermic zygotes in rice2022

    • Author(s)
      Toda E, Deushi R, Koshimizu S, Yano K, Okamoto T
    • Organizer
      26th International Congress on Sexual Plant Reproduction
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Transcriptional dynamics during development of early zygotes in rice: An approach using time-course single-zygote RNA sequencing2022

    • Author(s)
      Toda E, Koshimizu S, Kinoshita A, Higashiyama T, Yano K, Okamoto T
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Asia “Integrative Epigenetics in Plants”
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Transcriptional dynamics during development of early zygotes in rice: An approach using time-course single-cell RNA sequencing2022

    • Author(s)
      Toda E, Koshimizu S, Kinoshita A, Higashiyama T, Yano K, Okamoto T
    • Organizer
      第55回日本発生生物学会年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 種子形成における胚が制御する胚乳特異的遺伝子発現2022

    • Author(s)
      高崎寛則, Zhang Yilin, 丸山大輔, 戸田絵梨香, 木下温子, 岡本龍史, 大島良美, 光田展隆, 高木優
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] イネとシロイヌナズナにおける自然突然変異や培養変異等とゲノム編集技術による変異発生に関する科学的知見の集積とサイエンスコミュニケーション向けた情報提供について2022

    • Author(s)
      津田麻衣, 田部井豊, 田中淳一, 谷口洋二郎, 戸田絵梨香, 高原学, 吉田均
    • Organizer
      日本育種学会第142回講演会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] イネ受精卵の初期発生過程における転写ダイナミクス2022

    • Author(s)
      戸田絵梨香、越水静、木下温子、東山哲也、矢野健太郎、岡本龍史
    • Organizer
      学術変革領域研究「挑戦的両性花原理」2022年度若手の会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] イネ受精卵への物質導入によるゲノム編集2021

    • Author(s)
      戸田絵梨香
    • Organizer
      日本ゲノム編集学会第6回大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] イネ受精卵の最初期発生過程における遺伝子発現変動および父母因子の発現プロファイル2021

    • Author(s)
      戸田絵梨香, 越水静, 木下温子, 永田博基, 赤坂大輔, 大西由之佑, 東山哲也, 木下哲, 矢野健太郎, 岡本龍史
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 野生蘭ネジバナにおける単一受精説の検証2021

    • Author(s)
      水上茜, 福村薫, 加藤ふゆき, 戸田絵梨香, 時田(松浦)公美, 鈴木孝征, 東山哲也
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] キメラリプレッサーを用いたイネ卵細胞の分裂・発生を誘導する新規転写因子の探索2021

    • Author(s)
      澤本陸, 大島良美, 貴嶋紗久, 光田展隆, 池田美穂, 高崎寛則, 高木優, 戸田絵梨香, 岡本龍史
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] イネ受精卵発生を誘導するOsASGR-BBML1の標的遺伝子群の同定2021

    • Author(s)
      増尾心之介, 大島良美, 貴嶋紗久, 光田展隆, 池田美穂, 高崎寛則, 高木優, 戸田絵梨香, 木下温子, 岡本龍史
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Embryo dependent and independent gene expression in endosperm2021

    • Author(s)
      Zhang Y, Takasaki H, Maruyama D, Toda E, Okamoto T, Takagi-Ohme M
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] イネ受精卵の最初期発生過程における遺伝子発現プロファイルの解析2021

    • Author(s)
      戸田絵梨香、越水静、木下温子、東山哲也、矢野健太郎、岡本龍史
    • Organizer
      第4回植物インフォマティクス研究会・年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Functional analysis of the endosperm genes expressed in an embryonic development-dependent manner in Arabidopsis2021

    • Author(s)
      Zhang Y, Maruyama D, Toda E, Okamoto T, Oshima Y, Mitsuda N, Takasaki H, Takagi-Ohme M
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 植物の配偶子と体細胞の融合細胞及びその製造方法2022

    • Inventor(s)
      戸田絵梨香、岡本龍史
    • Industrial Property Rights Holder
      戸田絵梨香、岡本龍史
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2022-155645
    • Filing Date
      2022
    • Related Report
      2022 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi