マルチオミックス解析による大動脈瘤破裂の血管リモデリング機構解明
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21K15366
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 48040:Medical biochemistry-related
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| Research Institution | Waseda University |
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Principal Investigator |
杉山 夏緒里 早稲田大学, 理工学術院, 次席研究員(研究院講師) (20889662)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2025-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
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| Keywords | 大動脈瘤 / ラマン分光法 / 多変量解析 / 細胞外マトリクス / 多変量スペクトル分解 / 遺伝子発現解析 / RNA-seq法 / 胸部大動脈瘤 / 大動脈瘤破裂 |
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| Outline of Research at the Start |
大動脈瘤は血管壁が異常に拡張する疾患で、瘤破裂時の死亡率は非常に高いが、その機序の詳細は不明である。破裂地点を定めたモデルは存在せず、破裂直前の原因因子は未解明である。そこで、本研究は、破裂誘発マウスモデルを作製し、破裂直前の血管リモデリングを時系列的に探索する。生体分子の分子構造情報がラベルフリーで得られるラマン分光法と、位置情報を含んだ微小領域におけるRNAseq解析による遺伝子発現情報を組み合わせたマルチオミックス解析手法を提案し、破裂直前の血管壁の構造が変化する血管リモデリング機序を明らかにする。
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、大動脈瘤破裂モデルマウスにおいて、破裂直前のシグナル探索のために、血管の位置ごとや経時変化による血管壁の構造変化を解明する。今年度は、野生型マウスと大動脈瘤モデルマウスについて、薬剤投与・非投与についてラマン分光法によって破裂に関連するシグナル探索に向けて解析を行った。薬剤投与群において破裂直前に増加する因子を発見し、それについて詳細解析を試みた。この成分について組織学的解析を行ったところ、染色においても同等の成分が破裂直前に増加していることを同定した。ラマンによる詳細解析については、共焦点ラマン顕微鏡を用いて細胞レベルで解析を行うための条件検討を行った。得られたスペクトルの解析については、よりよい解析が行えるための最適化を行い、同定した成分のスペクトル分解を行った。位置特異的成分抽出のために解析手法の工夫も行った。遺伝子発現解析については、微小組織における検討が難しかったため、バイオプシによるラマン測定の隣接切片を用いて行った。血管壁１サンプルにおけるバイオプシを取得し、そのRNAシーケンスの条件検討を行った。その後、ラマン測定サンプルの隣接切片のバイオプシを取得し、野生型と大動脈瘤破裂モデルマウスについて、RNAシーケンスを行い、薬剤投与・非投与群について比較解析を行った。N>3で測定行い、その結果を解析することで、破裂直前に上昇が見られた遺伝子群を同定した。今後はパスウェイ解析などを行い、病態との関連性を探求する。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
ラマンイメージングを用いて破裂直前の成分の同定に成功した。また、遺伝子発現解析についても予定していた測定を終えることができた。
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| Strategy for Future Research Activity |
着目する破裂直前の成分を同定することができたので、今後はその成分の詳細解析を行う。遺伝子発現解析の再現性の取れるデータの取得が行えたため、そのデータとラマンイメージングで同定した成分についての相関を探求する。
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Report
(2 results)
Research Products
(7 results)
