大腸粘膜下層浸潤癌におけるmicro RNA網羅的解析
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21K15406
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 49020:Human pathology-related
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| Research Institution | Iwate Medical University |
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Principal Investigator |
永塚 真 岩手医科大学, 医学部, 助教 (90815937)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2023: ¥260,000 (Direct Cost: ¥200,000、Indirect Cost: ¥60,000)
Fiscal Year 2022: ¥130,000 (Direct Cost: ¥100,000、Indirect Cost: ¥30,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
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| Keywords | 大腸癌 / リンパ節転移 / micro RNA / messenger RNA / 大腸腫瘍 |
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| Outline of Research at the Start |
我々は粘膜内癌から進行癌へプログレッションする際に重要な役割を担う可能性があるmiRNAを明らかにしたが, 粘膜下層浸潤癌におけるリンパ節転移を予測するマーカーとして有用かどうかについては追加検証が必要と考えられた. 近年はマイクロアレイ機器の進歩によりarrayを用いてmiRNAについて網羅的解析 が可能となった.マイクロアレイを用いた粘膜下層浸潤癌におけるmiRNAの網羅的解析を行った研究は無く, 網羅的解析を行うことで粘膜下層浸潤癌リンパ節転移に重要な役割を担う miRNAの同定が期待される.
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| Outline of Annual Research Achievements |
大腸粘膜下層浸潤癌(リンパ節転移例、非転移例)についてパラフィンからRNAを抽出した。いくつかの症例でRNAの抽出に難渋し一部固有筋層浸潤、漿膜下層浸 潤症例も症例として追加した。術前化学療法が行われた症例、遺伝性腫瘍症例、免疫染色やMSI解析でMSIが示唆された症例は除外とした。結果としてリンパ節転 移例18例, 非転移例21例で解析を行なった。網羅的miRNA解析はaffymetrix GeneChip miRNA Array 4.0を用いた。網羅的mRNA解析はaffymetrix Clario S human assayを用いた。リンパ節転移群と非転移群のmiRNA発現変動の比較はFDR p<0.05かつdelta Fold change>絶対値2を越えるものを抽出することとした。その結果8 個のmiRNA (miR-4685-3p, 6754-3p, 6806-3p, 8085など)でup regulationを示した。down regulationを示したものは認めなかった。
up regulationを示したmiRNAとmRNAの相互関係をパスウェイ解析で検討した。miRNAでup regulationを示し、down regulationを示したmRNAは7パターンであった (TMEM243とmiR-206, 4685-3p, 6754-3p, METAP1とmiR-4685-3p, CAMK4とmiR-8085, TGOLN2とmiR-6806-3p, 8085)。そのうち回帰性を認めたmiRNAとmRNAの組み合わせはMETAP1とmiR-4685-3p, TGOLN2とmiR-6806-3pであった。これらのmiRNAとmRNAの組み合わせがリンパ節転移に重要な役割を担う可能性が示唆された。
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Report
(3 results)
Research Products
(1 results)
