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Analysis of CRISPR-Cas-like viral defense mechanisms in mammals

Research Project

Project/Area Number 21K15457
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 49060:Virology-related
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

Koide Rie  国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 研究員 (40846325)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Keywords内在性RNAウイルス / 抗ウイルス免疫 / 哺乳類 / PIWI-interacting RNA / CRISPR-Cas
Outline of Research at the Start

哺乳類のゲノムには、内在性ウイルス様エレメント(EVE)と呼ばれるウイルス由来配列が多数存在する。近年、EVEが近縁ウイルスに相補的なPIWI-interacting RNA(piRNA)を産生することがわかってきた。piRNAはPIWIタンパク質と結合し、標的mRNAの発現を配列特異的に制御する小分子RNAである。この機能から、EVE由来のpiRNAがRNA干渉によって近縁ウイルスの感染を抑制する可能性を着想した。本研究では、RNAウイルス由来配列から産生されるpiRNAが哺乳類で近縁ウイルスに対する抵抗性因子として機能するかどうかを検証する。

Outline of Final Research Achievements

The study aims to elucidate a novel antiviral mechanism mediated by piRNAs derived from endogenous bornavirus-like elements (EBLNs). We hypothesized that EBLN-derived piRNAs may silence Borna disease virus-1 (BoDV-1) in hippocampal neural progenitor cells (hNPCs), but we were unable to detect EBLN-derived piRNAs from hNPCs in our hands. Based on these results, we are now shifting our focus to testes, which expressed EBLN-derived piRNAs. Currently, we are conducting BoDV-1 infection experiments using spermatogonial stem cells and testicular organ culture systems. In the future, we plan to establish a BoDV-1 testicular infection model and further analyze the antiviral role of EBLN-derived piRNAs in germ cells.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究は、哺乳類では前例のない、piRNAを介した抗ウイルス免疫機構の解明を目指す初の試みである。生物ゲノムにはEBLN以外にも多数のウイルス由来配列が存在するが、最近の研究でその一部がゲノム上のpiRNA産生領域(piRNAクラスター)に存在し、近縁ウイルスに対して相補鎖のpiRNAを産生することがわかってきた。したがって、本研究でpiRNAを介したウイルス制御機構を解明することは、BoDV-1のみならず、他の様々なウイルスの防御策を開発する上でも重要であると考えられる。

Report

(3 results)
  • 2023 Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2023 2021

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] The regulation of persistent Borna disease virus infection by RNA silencing factors in human cells2023

    • Author(s)
      Kaneko Yuka、Naito Yuui、Koide Rie、Parrish Nicholas F.、Takahashi Tomoko
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 658 Pages: 122-127

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2023.03.069

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] A murine model to test the role of endogenous bornavirus-like elements on Borna disease virus infection.2021

    • Author(s)
      Rie Koide, Takaya Abe, Anselmo Jiro Kamada, Yuka Saito, Matteo Guerrini, Asami Fujii, Erica Parrish, Masayuki Horie, Hiroshi Kiyonari, Shigeo Koyasu, Kazuhiko Yamamoto, Keizo Tomonaga, Nicholas Parrish
    • Organizer
      第23回日本レトロウイルス研究会夏期セミナー
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] A mouse model to test for EVE-derived antiviral activity against Borna disease virus.2021

    • Author(s)
      Rie Koide, Takaya Abe, Anselmo Jiro Kamada, Yuka Saito, Matteo Guerrini, Asami Fujii, Erica Parrish, Masayuki Horie, Hiroshi Kiyonari, Shigeo Koyasu, Kazuhiko Yamamoto, Keizo Tomonaga, Nicholas Parrish
    • Organizer
      第68回日本ウイルス学会学術集会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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