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Integrative proteomic analysis of PDX models to develop targeted therapies for recurrent esophageal cancer

Research Project

Project/Area Number 21K15543
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 50010:Tumor biology-related
Research InstitutionAichi Cancer Center Research Institute

Principal Investigator

Higaki Eiji  愛知県がんセンター(研究所), 分子診断TR分野, 研究員 (60896009)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords食道癌 / PDXモデル / 患者由来細胞 / プロテオミクス / 細胞表面タンパク質 / 術前化学療法 / CRISPR-Cas9 / 合成致死 / PDC / リン酸化タンパク質 / 化学療法 / 転移再発食道癌 / 分子標的治療
Outline of Research at the Start

手術可能なStageⅡ、Ⅲ食道癌の半数近くが転移・再発をきたす。本研究では、術前化学療法を受けた食道癌患者から外科手術により採取された腫瘍検体を用いて、患者腫瘍組織移植(PDX)モデルを作成し、サーフェスオーム解析とリン酸化タンパク解析による活性化シグナル経路同定を中心とした網羅的多層プロテオーム解析を行う。これにより、術前化学療法後食道癌の分子背景の解明から、革新的細胞表面分子治療標的群を同定し、転移再発食道癌の克服を目指す。

Outline of Final Research Achievements

Nearly half of operable stage II and III esophageal cancer patients develop recurrence. Effective chemotherapy for metastatic esophageal cancer is limited and there is an urgent need to develop innovative therapies. In this study, we will develop patient-derived xenograft (PDX) models of esophageal cancer and a comprehensive multi-omics analysis of PDX tumors will be performed, including cell surfaceome and phosphoproteome analysis that focus on the identification of activated signalling pathways. In addition, a genome-wide functional screening using the CRISPR-Cas9 system will be performed using the esophageal cancer cell lines established in this study. This will help to elucidate the molecular mechanisms of esophageal cancer and identify a set of cell surface molecules as innovative therapeutic targets to overcome esophageal cancer.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究において、食道癌PDXにおける細胞表面タンパク質の発現プロファイルや機能スクリーニングから機能的サーフェスオームデータ基盤を構築し、その分子生物学的理解を深めることで、既存研究では俯瞰しえなかった革新的細胞表面タンパク質治療標的群を大規模に開拓できる。腫瘍特異性が高い細胞表面分子が同定されれば、抗体薬物複合体や癌抗原ワクチン、CAR-T療法など、免疫療法の革新につながることが期待される。また、食道癌特異的に発現する分子は、治療標的としてだけでなく、診断、再発・治療効果予測に有用な組織・血液バイオマーカーとしての展開が期待できる。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (2 results)

All 2023 2022

All Presentation (2 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Presentation] Systems-approach based molecular profiling of mouse models for translational cancer research2023

    • Author(s)
      Ayumu Taguchi, Shuang Zhou, Yuichi Abe, Taisuke Kajino, Hisanori Isomura
    • Organizer
      第82回日本癌学会学術集会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] In-depth proteomic analysis of cancer models2022

    • Author(s)
      Ayumu Taguchi, Yuichi Abe, Taisuke Kajino, Hisanori Isomura
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術集会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Invited

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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