Integrative proteomic analysis of PDX models to develop targeted therapies for recurrent esophageal cancer
| Project/Area Number |
21K15543
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 50010:Tumor biology-related
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| Research Institution | Aichi Cancer Center Research Institute |
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Principal Investigator |
檜垣 栄治 愛知県がんセンター(研究所), 分子診断TR分野, 研究員 (60896009)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
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| Keywords | 食道癌 / 術前化学療法 / PDXモデル / PDC / プロテオミクス / 細胞表面タンパク質 / リン酸化タンパク質 / 化学療法 / 転移再発食道癌 / 分子標的治療 |
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| Outline of Research at the Start |
手術可能なStageⅡ、Ⅲ食道癌の半数近くが転移・再発をきたす。本研究では、術前化学療法を受けた食道癌患者から外科手術により採取された腫瘍検体を用いて、患者腫瘍組織移植（PDX）モデルを作成し、サーフェスオーム解析とリン酸化タンパク解析による活性化シグナル経路同定を中心とした網羅的多層プロテオーム解析を行う。これにより、術前化学療法後食道癌の分子背景の解明から、革新的細胞表面分子治療標的群を同定し、転移再発食道癌の克服を目指す。
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| Outline of Annual Research Achievements |
手術可能なStageⅡ、Ⅲ食道癌の半数近くが転移・再発をきたす。近年のゲノム解析技術の発展にもかかわらず、転移再発食道癌に対する有効な化学療法は限られており、革新的なアプローチによる新規治療法の開発が急務である。そこで、本研究では、術前化学療法を受けた食道癌患者から内視鏡検査あるいは外科手術によって採取された腫瘍検体を用いて、患者腫瘍組織移植（patient-derived xenograft; PDX）モデルを作成し、細胞表面タンパク質（サーフェスオーム）解析から下流の活性化シグナル経路同定のためのリン酸化タンパク質解析まで含む高深度な多層プロテオーム解析によって、新規治療標的分子や薬剤感受性予測バイオマーカーの探索同定を行った。現在までに、食道癌患者33症例からPDXモデルを作成した。このうち4症例においては、治療前と術前化学療法後のペアPDXモデルが作成できた。さらに9症例において、患者腫瘍由来細胞株（PDC）を樹立した。このうち、ペアとして作成できた食道癌PDXモデルと、DCF療法に異なる感受性を示した食道癌症例由来のPDXモデルを中心に、ゲノム、トランスクリプトーム、サーフェスオームを含む空間プロテオーム解析を行った。得られた分子プロファイルの比較から、DCF療法への感受性に関連する分子シグネチャの同定を進めるとともに、有望な治療標的分子についてはすでに機能解析を行っている。
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Report
(3 results)
Research Products
(2 results)
