分子バーコードを用いたNGS解析でのctDNA評価による乳癌の遠隔再発リスク診断

• Project/Area Number: 21K15591
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 50020:Tumor diagnostics and therapeutics-related
• Research Institution: Osaka University
• Principal Investigator: 吉波 哲大 大阪大学, 医学部附属病院, 特任助教(常勤) (30894240)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2022)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
• Keywords: ctDNA / 乳癌 / MB-NGS / residual cancer burden / 再発リスク

Outline of Research at the Start

血中循環腫瘍DNA(circulating tumor DNA;ctDNA)の評価が、がん微小転移の存在診断に繋がることが注目されている。現在、手術可能乳癌症例においては、診断時の腫瘍径とリンパ節転移状況を用いた解剖学的分類で遠隔再発リスクを評価し周術期治療を決定している。しかし、その精度は十分ではなく改善が求められている。我々は、MB-NGS解析を用いて評価した治療前のctDNAの有無が、有意な遠隔再発リスク因子となることを報告した。本研究では、MB-NGS解析を改良したより高感度な手法を用いてctDNAの検出を試み、遠隔再発リスク評価がさらに高精度に可能となるかを検討する。

Outline of Annual Research Achievements

乳癌患者の血中循環腫瘍DNA(circulating tumor DNA; ctDNA)を検出するためには高感度なアッセイが必要である。すでに、分子バーコードを用いた次世代シーケンス解析(MB-NGS解析)により、各検体につき1変異を対象とした際の検出限界VAF0.1%を達成した。さらに感度を向上させるために各症例の複数個所をターゲットをしたアッセイの開発必要と考えた。
既存のパネル検査でどのアッセイが残存微小転移(residual cancer burden)の検出に有用かについて種々の報告を検討し、本研究で使用するアッセイを確定した。また、どのような臨床背景をもちどのタイミングでの検体を測定するかを確定させた。今後はその条件にあう乳癌患者の臨床検体を測定していく予定である。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

測定系の選定、測定検体の条件設定を行った。今後は保存検体の中から条件に合う検体を同定し提出する。今年度中に結果を得て研究成果を報告できる見通しがある。

Strategy for Future Research Activity

検体を測定し、臨床情報とその結果を包括的に検討する。