A miRNA signature as a diagnostic biomarker for microvascular invasion in hepatocellular carcinoma
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21K15596
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 50020:Tumor diagnostics and therapeutics-related
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| Research Institution | Kumamoto University |
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Principal Investigator |
Yamamura Kensuke 熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 特定研究員 (10816507)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2023-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
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| Keywords | 肝細胞癌 / 微少脈管侵襲 / マイクロRNA / バイオマーカー / signature / micro RNA |
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| Outline of Research at the Start |
HCCの悪性度は、MVIの有無、低分化型、肉眼的分類などで評価されるが、それらを術前に予測するための有効な手段がない。このMVIはHCCにおいて重要な予後予測因子であり、MVIの診断は治療方針の構築に重要となるが、現在の画像診断モダリティーでは治療前の診断が困難である。
HCCの臨床検体を用いてmiRNA-Seq解析を行い、MVIを認めるHCC特異的に発現しているmicro RNA （miRNA）を同定する。バイオインフォマティクスを駆使し、候補となるmiRNAを絞り込み、miRNAシグニチャーを樹立する。さらに国際共同研究で集められた1000例に及ぶ大規模コホートで、シグニチャーの有用性を検証する。
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| Outline of Final Research Achievements |
We initially identified a 16-gene expression signature from a total of 19245 genes, which showed significant predictive power for recurrence free survival (RFS) in non B non C HCC patients [HR: 5.02 (3.12 - 8.08), p<0.0001]. Subsequently, using clinical training cohort, we developed a reduced and optimized 4 gene signature composed of DKK1, CTSL2, MAMSTR and HLA-G, which demonstrated as a robust model in predicting RFS (HR, 3.05; 95%CI, 1.81 - 5.14; P<0.0001). The performance of the gene signature was validated in two independent clinical cohorts (HR, 3.39; 95% CI: 1.98 - 5.79, P<0.0001 and HR, 3.44; 95%CI: 1.95 - 6.06, P<0.0001). Furthermore, a nomogram comprising our four gene signature, tumor size, number of tumors, AFP, and DCP was generated to predict the 2-year recurrence free survival in the training cohort, and it performed well in the two independent validation cohorts (concordance index: 0.73 and 0.71, respectively).
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
システマティックかつ網羅的なバイオマーカーの探索及び検証を行うことで、NBNC-HCCの再発予測ノモグラムを樹立した。個々の患者の再発予測に有用な臨床ツールとなりうる。
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Report
(3 results)
Research Products
(6 results)
