Study on invasion potential of Helicobacter pylori uninfected signet ring cell gastric cancer
| Project/Area Number |
21K15927
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 53010:Gastroenterology-related
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| Research Institution | Hiroshima University |
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Principal Investigator |
小刀 崇弘 広島大学, 病院(医), 助教 (60838788)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
Fiscal Year 2023: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000)
Fiscal Year 2022: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
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| Keywords | ヘリコバクターピロリ未感染 / 印環細胞癌 / 未分化型胃癌 / 浸潤癌 / 未感染胃癌 / Helicobacter pylori / SRCC / gastric cancer |
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| Outline of Research at the Start |
Hp感染率の低下に伴いHp胃炎によらない未感染胃癌が問題となってきている。Hp未感染胃癌の中で印環細胞癌(SRCC)が特徴的な組織像の1 つであるが、このSRCCは粘膜内に留まり浸潤傾向に乏しく、増大しにくいという特徴があるとされている。しかし一部の粘膜内SRCCは、低分化腺癌が混在し浸潤癌に移行するが、その機序については明らかとなっていないため、Hp未感染SRCCの癌ゲノム解析を行う。さらに浸潤癌と粘膜内癌が同時発症した症例を経験しているため、ゲノム景観を比較することによりSRCCの浸潤に関与する遺伝子変異を明らかにして、それを胃癌細胞株と動物モデルで機能解析を行うことによって証明する。
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は当院でヘリコバクターピロリ未感染未分化型胃癌での浸潤先進部でどのような遺伝子異常が起こっているかを癌ゲノム解析を用いて明らかとしていく研究である。この変化を明らかにするためにヘリコバクターピロリ除菌後未分化型胃癌の浸潤先進部でどのような遺伝子異常が起こっているかを検索しコントロールとして未感染癌の変化について明らかにする研究である。これまでに内視鏡治療もしくは手術で治療したヘリコバクターピロリ未感染未分化型胃癌36症例39病変のうち、粘膜下層以深への浸潤を認めた7症例7病変の粘膜内印環細胞癌成分と浸潤部の低分化腺癌成分をそれぞれレーザーマイクロダイセクションにて切り出し，市販の抽出キットを用いてgDNAの抽出を行った。Qubitを用いてDNA量を測定したところ次世代シークエンサーの解析に十分な量のDNAを採取することができた。また粘膜下層以深への浸潤を認めたヘリコバクターピロリ除菌後未分化型胃癌7症例7病変の粘膜内印環細胞癌成分と浸潤部の低分化腺癌成分からもそれぞれレーザーマイクロダイセクションにて切り出し，同様に抽出キットを用いてgDNAの抽出を行った。同症例においてもQubitを用いてDNA量を測定したところ次世代シークエンサーの解析に十分な量のDNAを採取することができた。さらにこれらの症例のDNAのQualityを測定するためにAgilent社のtapestationのGenomic DNAを用いてDIN値の測定を行った。さらに経年劣化によるDNAの断片化の程度を測定するためqPCRによるDNA定量をΔΔQCを用いて測定を行った。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
現在，最も時間のかかるDNA抽出を終えており，さらにライブラリーの作成にすぐに取りかかれるような状態であるため，概ね順調に推移していると考える。
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| Strategy for Future Research Activity |
ライブラリーの作成，次世代シークエンサーによるシークエンス，パイプラインによる癌ゲノムプロファイリングの解析を通じて研究を行っていく。
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Report
(2 results)
Research Products
(1 results)
