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Development of next generation treatment strategy for pancreatic cancer with clinical implementation of whole exome sequencing

Research Project

Project/Area Number 21K15959
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 53010:Gastroenterology-related
Research InstitutionKeio University

Principal Investigator

林 秀幸  慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 特任講師 (60787810)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2024: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2023: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords膵癌 / 全エクソン解析 / がんゲノムプロファイリング検査 / プレシジョンメディシン / 遺伝子解析 / 膵がん / 個別化治療 / がんゲノム医療 / ターゲットシークエンス / クリニカルシークエンス
Outline of Research at the Start

本研究の概要は膵がんを対象に現行のがん遺伝子パネル検査に代わる新たな手法として、従来、研究用途で施行されてきた全エクソン解析の臨床的有用性を評価し、同検査を臨床実装すること、さらには全エクソン解析から得られた新規膵がん関連ゲノム情報を用いた膵がんプレシジョンメディシンにおける次世代治療戦略を確立することである。

Outline of Annual Research Achievements

本年度(2023年度)は当院で全身化学療法を実施した膵がん107症例において全エクソン検査を含めたがんゲノムプロファイリング検査の実施の有無が予後の改善に寄与するかどうかを検討する後ろ向き観察研究の結果をまとめ、ESMO2023(欧州臨床腫瘍学会)で発表した。膵癌症例において治療経過中にがんゲノムプロファイリング検査を行った症例は未施行の症例と比べて有意に生存期間を延長しており(29.7ヵ月 vs 13.4ヵ月, HR: 0.51, p= 0.017)、両群の患者背景に差はなかったことから、膵癌においてはがんゲノムプロファイリング結果を把握することが治療医の治療選択に影響を与え、genotype-mathced treatmentの実施の有無に関わらず患者予後の向上に寄与する可能性につき報告した。また、がんゲノムプロファイリング検査を施行した47症例を対象に膵癌におけるがんゲノムプロファイリング検査の至適時期に関する検討を行い、第21回日本臨床腫瘍学会学術集会(JSMO2024)で発表した。膵癌においては一次化学療法施行前にがんゲノムプロファイリング検査を実施した症例が一次化学療法施行後に実施した症例と比べて有意に生存期間を延長しており(40.1ヵ月 vs 24.0ヵ月, HR: 0.33, p= 0.042)、膵癌においては早期にがんゲノムプロファイリング検査を実施することが患者予後の向上に寄与する可能性につき報告した。
その他、腫瘍組織検体のみを用いたがんゲノムプロファイリング検査(T-only検査)において検出されたBRCA1/2遺伝子異常は、どんなにその検出アレル頻度が低い場合であってもGermlin由来のバリアントである可能性があることを英文誌(Hayashi H et al, : Germline BRCA2 variant with low variant allele frequency detected in tumor-only comprehensive genomic profiling. Cancer Sci 2024;115(2):682-686.)に筆頭著者で報告した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

今年度は膵癌に対する全エクソン解析を実施した症例(約60症例)の解析のまとめを行うことができる状況にあるため。

Strategy for Future Research Activity

今年度は膵がんクリニカルシークエンスにおける全エクソン解析の臨床的有用性を検証する目的で、膵がん患者を対象にターゲットシークエンスと全エクソン解析を同時に施行し、両者の臨床的有用性(Actionable遺伝子異常・Germline遺伝子バリアント検出率、治療実施率、Turnaround timeなど)を比較検討する研究の最終解析を行い、同研究結果につき報告する。

Report

(3 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Germline <i>BRCA2</i> variant with low variant allele frequency detected in tumor‐only comprehensive genomic profiling2023

    • Author(s)
      Hayashi Hideyuki、Kunimasa Kei、Tanishima Shigeki、Nakamura Kohei、Ishikawa Marin、Kato Yasutaka、Aimono Eriko、Kawano Ryutaro、Nishihara Hiroshi
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 115 Issue: 2 Pages: 682-686

    • DOI

      10.1111/cas.16043

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 膵癌におけるゲノム医療2023

    • Author(s)
      林 秀幸
    • Journal Title

      肝胆膵

      Volume: 87 Pages: 571-581

    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Journal Article] 膵癌治療の進歩 (1) 薬物療法 (分子標的治療薬・免疫チェックポイント阻害薬など)2023

    • Author(s)
      林秀幸、奥坂拓志
    • Journal Title

      日本臨牀

      Volume: 81巻増刊号2号 Pages: 474-483

    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Journal Article] Targeted amplicon sequencing for primary tumors and matched lymph node metastases in patients with extrahepatic cholangiocarcinoma2022

    • Author(s)
      Yamada T、Nakanishi Y、Hayashi H、Tanishima S、Mori R、Fujii K、Okamura K、Tsuchikawa T、Nakamura T、Noji T、Asano T、Matsui A、Tanaka K、Watanabe Y、Kurashima Y、Ebihara Y、Murakami S、Shichinohe T、Mitsuhashi T、Hirano S
    • Journal Title

      HPB

      Volume: 24 Issue: 7 Pages: 1035-1043

    • DOI

      10.1016/j.hpb.2021.11.008

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 膵がん診療におけるリキッドバイオプシー検査によるゲノム解析の有用性2022

    • Author(s)
      林 秀幸
    • Journal Title

      膵臓

      Volume: 37 Pages: 14-21

    • NAID

      130008164853

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 膵・胆道癌におけるがんゲノムプロファイリング検査の現状と今後の展開2021

    • Author(s)
      林 秀幸
    • Journal Title

      胆と膵

      Volume: 42 Pages: 1233-1240

    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Clinical utility of Upfront Comprehensive Genomic Profiling for the treatment of Advanced Pancreatic Cancer2024

    • Author(s)
      Eiichiro So, Hideyuki Hayashi, Keitaro Shimozaki, Yasunori Sato, Sara Horie, Shotaro Kishimoto, Akihiko Chida, Yuki Saito, Kai Tsugaru, Kenro Hirata, Hiroshi Nishihara, Takanori Kanai, Yasuo Hamamoto
    • Organizer
      第21回日本臨床腫瘍学会学術集会(JSMO2024)
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Comprehensive Genomic Profiling Contributes to the Prognosis of Patients with Advanced Pancreatic Cancer2023

    • Author(s)
      Eiichiro So, Hideyuki Hayashi, Keitaro Shimozaki, Sara Horie, Shotaro Kishimoto, Akihiko Chida, Yuki Saito, Kai Tsugaru, Kenro Hirata, Hiroshi Nishihara, Takanori Kanai, Yasuo Hamamoto
    • Organizer
      ESMO2023(欧州臨床腫瘍学会)
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Real-world evidence of precision medicine for biliary tract cancer2023

    • Author(s)
      Hayashi H, Tanishima S, Fujikura T, Nakamura K, Ishikawa M, Kato Y, Kawano R, Hirata K, Hamamoto Y, and Nishihara H
    • Organizer
      第20回日本臨床腫瘍学会学術集会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 本邦におけるがんゲノム医療の現状と今後の課題2022

    • Author(s)
      林秀幸
    • Organizer
      第7回日本肉腫学会年次学術集会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Comparison of clinical utility between whole-exome sequencing and targeted sequencing (PleSSision-WET study)2022

    • Author(s)
      Hideyuki Hayashi, Shigeki Tanishima, Kaori Mochida, Tomoka Fujikura, Sachiko Hagiwara, Emmy Yanagida, Hiroshi Yamada, Ryutaro Kawano, Kohei Nakamura, Marin Ishikawa, Yasutaka Kato, Eriko Aimono, Mitsuho Imai, Arisa Ueki, and Hiroshi Nishihara
    • Organizer
      第19回日本臨床腫瘍学会学術集会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Clinical implementation of whole-exome sequencing for cancer in clinical practice2021

    • Author(s)
      Hideyuki Hayashi
    • Organizer
      第80回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited

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Published: 2021-04-28   Modified: 2024-12-25  

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