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Elucidation of the relationship between amino acids synthesized by microbiome muscle mass in cirrhosis model/patients using network analysis

Research Project

Project/Area Number 21K15970
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 53010:Gastroenterology-related
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

山本 健太  名古屋大学, 医学部附属病院, 病院助教 (80852582)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Keywords腸内細菌 / 肝臓 / 繊維化 / ネットワーク解析 / 肝硬変 / マウス / ヒト / 肝癌 / 肝疾患 / 筋肉 / サルコペニア / アミノ酸 / 機能遺伝子 / 慢性肝疾患
Outline of Research at the Start

肝硬変患者における腸内細菌叢が作るアミノ酸と筋肉量の関連性を明確にし、有用もしくは有害な細菌を同定することでサルコペニアや肝性脳症のリスク評価を可能とするバイオマーカーの発見と治療・予防薬の開発を目指す。肝硬変患者ではアンモニア産生菌や分岐鎖アミノ酸以外のアミノ酸合成菌が多く、アミノ酸を生成する際に窒素をとりあう「細菌による競合」が生じている可能性がある。この解明には単一の細菌を検出する目的ではなく肝硬変による腸内細菌叢の乱れ、競合する細菌など複数の有用な細菌や競合する細菌のネットワークを明らかにすることで新たな視点により人体に与える影響を解明する。

Outline of Annual Research Achievements

動物実験では細菌叢が構成する種類によりその特性が異なることを前年度までに示しており、これに介入するため胆汁酸の殺菌効果に注目しelobixibatを用いた。以前より線維化・腫瘍・腸内細菌のネットワーク形成に注目しており、本研究では肝臓腫瘍における胆汁酸レベルの影響を調査し、腸内での胆汁酸吸収を抑制するelobixibatが、血清および肝臓内の胆汁酸レベルを減少させ、肝腫瘍の成長を抑制することを明らかにした。腫瘍の減少がelobixibatが吸収抑制した胆汁酸により大腸内に大量に流入することでグラム陽性細菌の割合が大幅に低下したことで生じた可能性がある。肝内及び血清の胆汁酸低下と二次胆汁酸の変化が腫瘍形成抑制と関連することを報告した。(Hepatol Int. 17:1378-1392.2023)またヒト検体を用いた細菌叢と血液検査を含む臨床検体との関連性についてネットワークを構築し、影響を受ける細菌群を同定して報告した。(日本消化器病学会総会・肝臓学会総会・JDDW)その中でもHBV群とHCV群における細菌叢のネットワークを各自で作成して共通する細菌を同定し、そのネットワークが臨床的数値にあたえる影響を明確にしUEG weeks2023で報告した。臨床に応用するため細菌が患者予後と関連するかを検討し、VeillonellaとRuminococcaceaeの一部の細菌の過多が予後と関連することを報告した(Microorganisms. ;12:610.2023)。これらの細菌ネットワークが臨床に影響を与えるメカニズムを解明するために、ネットワークの可視化に取り組んでおり水中電子顕微鏡を用いて大腸粘膜表面の細菌群の撮像に成功し報告した(Liquid Phase Electron Microscopy Gordon Research Conferences 2024)。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ヒト及びマウスにおいても細菌叢がどのようなネットワークを形成しているのかは明確化できている。特に臨床的指標に与える影響が明瞭貸してきており、予後や線維化、血液検査などの臨床的指標など様々な因子と関連する細菌及びその細菌に盈虚を与える細菌やその細菌群が構成するネットワークなどはわかってきている。しかし数理学的な手法による論証のみでは不十分であり、可視化もしくはvalidationにより再現性を証明するなどの課題は残っており、正確な報告のためにはさらなる検討が必要である。

Strategy for Future Research Activity

動物実験に関してはおおむね順調に経過している一方でヒト検体はさらなる検討が必要である。再現性や他の手法による証明が必要でありさらなる検討を重ねる必要がある。慢性肝炎という共通項を考え、C型肝炎・B型肝炎に群分けしても再現されるネットワークを確立する必要がある。またネットワークの構成要素のみに注目されていたが、ネットワークに影響を与える影響度が細菌により異なることが明瞭貸してきておりより影響力が強い細菌の同定を試みる。すでに検体数は十分確保されているため現在までに得た結果をもとに再計算を行いネットワーク構築を進めていく。一方で推測されたネットワークが実際に存在するのか、腸管壁のどの部位でどのような役割を担うかに関しては水中電子顕微鏡や胆汁酸などの代謝産物の計測結果と合わせて推測できるように試みる。

Report

(3 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results)

  • [Journal Article] Identification of the Microbiome Associated with Prognosis in Patients with Chronic Liver Disease2024

    • Author(s)
      Yamamoto Kenta、Honda Takashi、Inukai Yosuke、Yokoyama Shinya、Ito Takanori、Imai Norihiro、Ishizu Yoji、Nakamura Masanao、Kawashima Hiroki
    • Journal Title

      Microorganisms

      Volume: 12 Issue: 3 Pages: 610-610

    • DOI

      10.3390/microorganisms12030610

    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Journal Article] Impact of elobixibat on liver tumors, microbiome, and bile acid levels in a mouse model of nonalcoholic steatohepatitis2023

    • Author(s)
      Sugiyama Y, Yamamoto K, Honda T, Kato A, Muto H, Yokoyama S, Ito T, Imai N, Ishizu Y, Nakamura M, Asano T, Enomoto A, Zaitsu K, Ishigami M, Fujishiro M, Kawashima H.
    • Journal Title

      Hepatol Int

      Volume: 17 Issue: 6 Pages: 1378-1392

    • DOI

      10.1007/s12072-023-10581-2

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Patients with low muscle mass have characteristic microbiome with low potential for amino acid synthesis in chronic liver disease2022

    • Author(s)
      Yamamoto Kenta、Ishizu Yoji、Honda Takashi、Ito Takanori、Imai Norihiro、Nakamura Masanao、Kawashima Hiroki、Kitaura Yasuyuki、Ishigami Masatoshi、Fujishiro Mitsuhiro
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 3674-3674

    • DOI

      10.1038/s41598-022-07810-3

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Exploring the Gut Microbiome's Interaction with Colon Mucosa in human Chronic Liver Disease using liquid-phase ASEM2024

    • Author(s)
      Kenta Yamamoto, Chikara Sato, Takashi Honda
    • Organizer
      Liquid Phase Electron Microscopy GRC 2024
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] INVESTIGATING THE RELATIONSHIP BETWEEN GUT MICROBIOME AND FIBROSIS MARKERS IN PATIENTS WITH VIRAL HEPATITIS2023

    • Author(s)
      K. Yamamoto, T. Honda, Y. Inukai, S. Yokoyama, T. Ito, N. Imai, Y. Ishizu, H. Kawashima, M. Ishigami
    • Organizer
      United European Gastroenterology week 2023
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 慢性肝疾患患者の予後に関する腸内細菌・臨床的因子の検討2023

    • Author(s)
      山本 健太 本多 隆 犬飼 庸介 水野 史崇 松田 宣賢 山本 崇文 水野 和幸 武藤 久哲 横山 晋也 伊藤 隆徳 今井 則博 石津 洋二 石上 雅敏 川嶋 啓揮
    • Organizer
      Japan Digestive Disease Week 2023
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Correlation Between Gut Microbiota and Clinical Parameters in Patients with Alcoholic Liver Disease2023

    • Author(s)
      Kenta Yamamoto, Takashi Honda, Shinya Yokoyama, Takanori Ito, Norihiro Imai, Yoji Ishizu, Masatoshi Ishigami Tetsuya Ishikawa, Hiroki Kawashima
    • Organizer
      The 3rd JSH International Liver Conference.
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 肝癌患者における長期予後と腸内細菌叢の関係2023

    • Author(s)
      山本 健太 本多 隆 石上 雅敏
    • Organizer
      第59回日本肝臓学会総会 2023
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] ネットワーク解析を用いた線維化マーカーと 腸内細菌叢の関係性の解明2023

    • Author(s)
      山本 健太 本多 隆 石上 雅敏
    • Organizer
      第109回日本消化器病学会総会 2023
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 慢性肝疾患患者における 腸内細菌ネットワーク解析と臨床的指標の関連性2022

    • Author(s)
      山本 健太 本多 隆 石上 雅敏
    • Organizer
      日本消化器病学会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Microbiome correlated with fibrosis markers common to HBV and HCV patients2022

    • Author(s)
      Kenta Yamamoto. Takashi Honda. Masatoshi Ishigami
    • Organizer
      Japan Digestive Disease Week 2022
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 慢性肝疾患患者においてProton pump inhibitors内服下では腸内細菌に影響を与える臨床的因子が異なる2022

    • Author(s)
      山本 健太, 本多 隆, 松田 宜賢, 犬飼 庸介, 山本 崇文, 杉山 由晃, 吉岡 直輝, 水野 和幸, 武藤 久哲, 横山 晋也, 伊藤 隆徳, 今井 則博, 石津 洋二, 石上 雅敏
    • Organizer
      肝臓学会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] The Effect of Elobixibat on Tumorigenesis in the NASH Mice Model2022

    • Author(s)
      Kenta Yamamoto, Yoshiaki Sugiyama, Takashi Honda, Asuka Kato, Hisanori Muto, Shinya Yokoyama, Takanori Ito, Norihiro Imai, Yoji Ishizu, Masatoshi Ishigami, Hiroki Kawashima
    • Organizer
      APASL Oncology 2022 (Single Topic Conference)
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 肝疾患における臓器連関の役割 ランダムフォレストを用いた慢性肝疾患患者における筋肉量減少と関連ある腸内細菌叢の同定への試み2021

    • Author(s)
      山本 健太, 本多 隆, 石上 雅敏
    • Organizer
      第44回日本肝臓学会西部会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

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Published: 2021-04-28   Modified: 2024-12-25  

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